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关键词： 小麦叶锈菌   毒性   温度敏感性   组织病理学   热激蛋白基因  

摘要： 小麦叶锈病菌是小麦的重要病害之一,在全球小麦种植区均有发生。目前,种植抗病品种是防治小麦叶锈病最经济有效的措施,但抗病品种常因小麦叶锈菌新小种的不断产生和发展而丧失抗性。随着全球平均气温的升高,小麦叶锈病菌的越冬越夏范围不断扩大,且自然群体中已有耐高温菌株。本研究对2018-2022年采自山西省不同市县的小麦叶锈病菌标样进行单孢子堆的分离和群体毒性鉴定。然后对分离获得的41个菌株进行温度敏感性测定,筛选出2个耐高温菌株21-M-盐-1和22-M-稷-3以及2个温度敏感菌株21-M-绛-30和22-M-绛-5,高温胁迫下测定4个菌株的孢子萌发率和组织学结构指标。同时采用q RT-PCR技术对4个菌株在高温胁迫下热激蛋白基因PtHsp90-1、PtHp、PtHspHSS1、PtHsp60和PtHspSSB的表达量进行分析。本研究结果如下: （1）对2018-2022年田间采集的132份标样通过单孢子堆分离获得纯化菌,并利用44种已知抗叶锈病基因的近等基因系和材料进行毒性分析。结果表明,山西省小麦叶锈病目前有效的抗叶锈基因为Lr25、Lr38和Lr13+3ka,病菌基因频率均小于30%。与单基因系对应的毒性基因V26、V10、V12、V20和V39表现感病的病菌在四年中毒性基因频率均较高,基本属于无效抗叶锈病基因;132个小麦叶锈病菌菌株划分为82个生理小种,其中主要的优势生理小种为THT、PHT、PKJ、PHS、TKT、THS和THK;毒性多态性分析可得晋中市和运城市的毒性多样性较为丰富。 （2）对2021-2022年分离的41个小麦叶锈菌菌株分别设置18℃、20℃、22℃、24℃、26℃和28℃（18℃为对照）进行温度敏感性测定,确定其ET50值。结果表明,41个菌株的ET50平均值为22.85℃,最高值和最低值分别为25.50℃和18.78℃,相差6.72℃。整体来看,ET50最高值和最低值都为采自山西省运城市的菌株标样,分别为21-M-盐-1（R1）的25.39℃、22-M-稷-3（R2）的25.50℃、21-M-绛-30（S1）的18.78℃和22-M-绛-5（S2）的19.92℃。因此,把这4个菌株选做后续生物学特性分析和高温胁迫其基因表达情况的菌株。根据4个菌株在不同温度下病害严重差异分析发现在26℃时差异最显著（P<0.05）,因此选取26℃作为高温胁迫最佳温度。 （3）在高温胁迫下,对4个菌株进行孢子萌发率测定发现,高温对小麦叶锈病菌孢子萌发阶段影响显著。组织病理学结构观察发现,高温胁迫在小麦叶锈病菌前期菌丝形成阶段影响不明显,而在后期吸器母细胞和吸器的形成阶段有一定影响,这表明吸器母细胞和吸器形成是耐高温菌株抵御热胁迫的关键阶段。 （4）通过qRT-PCR技术对高温胁迫下PtHsp90-1、PtHp、PtHspHSS1、PtHsp60和PtHspSSB这5种基因的表达量进行分析。结果表明,不同温度耐受性菌株在高温胁迫下的基因表达情况不同。PtHsp90-1、PtHp、PtHspHSS1、PtHsp60和PtHspSSB这5种基因在小麦叶锈菌孢子萌发阶段抗高温胁迫中发挥着较为重要的作用,但具体其在小麦叶锈菌株中的作用机制还有待进一步研究和考证,此结果为后续小麦抗叶锈病研究提供了一定的思路。

关键词： 前列腺癌   聚焦超声手术   内分泌治疗   雄激素受体   病理  

摘要： 前列腺癌（Prostate cancer,PCa）是老年男性最常见的恶性肿瘤之一,严重影响中老年男性的健康。近年来,一些新兴的局部治疗方法已逐渐替代传统的治疗方法,其中就包括聚焦超声手术（Focused Ultrasound Ablation Surgery,FUAS）。FUAS局部消融早期PCa的短期效果肯定,但中、远期疗效尚存在争议。FUAS局部治疗无法处理影像学不可见的病灶,是导致FUAS治疗后肿瘤复发的重要因素。内分泌治疗（Endocrine therapy,ET）作为一种全身系统的治疗方式,可抑制前列腺癌的生长和进展,处理影像学不可见的病灶,因此能够弥补FUAS的不足。但PCa患者会在接受ET治疗后两年左右进展为去势抵抗前列腺癌（Castration-resistant to prostate cancer,CRPC）,造成疾病进展。研究发现,CRPC的发生发展主要与雄激素受体（Androgen receptor,AR）信号通路相关。FUAS消融可能能够破坏PCa组织内的AR,进而延缓ET治疗后患者进展到CRPC的时间。 综上所述,FUAS联合ET可能是一种更好的临床方案,但我们首先需要明确这两种治疗会不会产生相互的影响。一方面,需要分析ET治疗后,是否会对超声经过的声通道及靶区的组织结构产生影响,进而影响FUAS治疗的安全性及有效性;另一方面,分析FUAS消融对PCa组织及结构的影响,重点关注可能影响疾病进展的AR的变化情况。因此本研究主要针对上述两个目的,从病理学角度进行研究。 目的 （1）分析ET后,可能影响FUAS治疗安全性及有效性的钙化组织、平滑肌、血管的变化规律。 （2）分析ET联合FUAS治疗对PCa组织的影响,重点关注AR表达的变化情况。 材料和方法 （1）本回顾性研究将ET后接受根治性前列腺切除术的患者纳入试验组,未进行ET直接接受根治性前列腺切除术为对照组,两组标本分别用苏木精-伊红（Hematoxylin and Eosin,HE）染色和（Van Gieson,VG）特殊染色观察组织声环境中的钙化组织、平滑肌和血管。然后定量分析钙化组织的数量和面积、平滑肌的数量、不同类型血管的数量和直径,并在两组间进行对比。 （2）分析FUAS治疗后PCa组织的结构变化,先对组织进行HE染色,在光镜下分别识别出非消融区、交界区、消融区的范围;通过免疫组织化学染色的方法分析ET前组织、ET后组织、交界区、消融区四个样本区域中的肿瘤细胞、正常腺体、间质组织中AR的H值的变化情况。 结果 （1）我们发现前列腺癌组织中的钙化非常少,在对照组所有标本中,仅发现2个,在试验组中发现3个,且总面积基本相等,钙化组织主要分布在癌周围的正常组织中。对照组:钙化组织最大径0.30（0.16-0.48）mm、最小径0.03（0.02-0.05）mm、钙化数7.00（3.00-20.50）个、钙化面积0.14（0.02-0.37）mm2。试验组:钙化最大径0.60（0.50-0.86）mm、钙化最小径0.05（0.02-0.10）mm、钙化数21.00（17.25-39.25）个、钙化面积1.23（0.92-2.56）mm2。两组比较,试验组的钙化最大径、钙化数、钙化面积稍多于对照组（P=0.000/0.001/0.000）;钙化组织最小径两组比较无统计学意义（P=0.108）。 （2）平滑肌方面,我们通过HE染色切片观察发现,ET后,前列腺癌组织的平滑肌呈明显增生的趋势,对照组中的平滑肌是呈有序规整的排列,试验组中的平滑肌明显增生并呈错乱无序的排列。我们定量分析发现,试验组的平滑肌占比像素值2.00（1.69-2.47）x10～7px,明显多于对照组中平滑肌占比像素值1.12（0.99-1.40）x10～7px（P=0.000）。 （3）在血管研究方面,对照组:微静脉446.00（369.00-489.75）个、小静脉111.00（90.50-138.75）个、微动脉20.00（13.50-22.00）个、小动脉6.50（5.00-14.00）个、静脉数554.50（468.25-622.00）个、动脉数28.00（18.50-34.75）个、总血管数570.00（484.50-645.00）个;试验组:微静脉275.00（262.00-303.75）个、小静脉71.00（58.75-79.00）个、微动脉36.50（21.75-43.75）个、小动脉11.00（7.00-15.75）个、静脉数353.00（324.50-381.25）个、动脉数44.50（40.00-52.50）个、总血管数399.50（375.75-426.75）个。两组比较,试验组的微静脉、小静脉、静脉数明显少于对照组（P=0.000/0

摘要： 病理学是医学的一个重要分支，专注于研究疾病的本质、起源和发展过程。通过对组织、细胞和分子水平的观察，病理学为临床医生提供了准确的诊断依据，从而指导治疗决策。随着科技的不断进步，病理学的技术也经历了翻天覆地的变化，从最初的显微镜观察到现代的分子技术，这一演变不仅提高了疾病的诊断准确性，也推动了个性化医疗的发展。

摘要： ~~

关键词： 癌症   病理全切片图像   计算病理学   基因组学   空间转录组学   预后分析   表示学习  

摘要： 癌症是一类因异常细胞增殖而引发的恶性疾病,已成为全球主要致死原因之一。肿瘤的形态和分子异质性导致患者预后存在高度不确定性。近年来,数字病理学的发展使得自动化癌症预后分析成为可能。然而,病理全切片图像(WSI)通常含有数十亿像素,计算需求大,且缺乏精确标注,限制了其发展。为应对这些挑战,本文提出了一系列计算病理学方法,并结合基因组学和空间转录组学数据,进一步提升预后预测能力,增强了模型的生物学可解释性。本文研究的主要内容包括以下几个方面: (1)基于深度多字典学习的癌症预后研究。针对WSI标注不足、金字塔式结构和微环境高异质等挑战,提出了深度多字典学习模型(DMdL)。该方法通过堆叠自编码器提取多尺度深度特征,识别不同形态学表型,再利用字典学习提取稀疏特征,最终构建生存模型。通过后剪枝策略减少特征冗余,提升模型的预后预测能力。 (2)基于双课程对比多实例学习的癌症预后研究。针对传统多实例学习方法的实例编码缺乏生存信息的监督,实例聚合未充分考虑包内的冗余和包间的区分等问题,提出了双课程对比多实例学习方法(DCMIL)。该方法通过跨尺度显著图引导的弱监督实例编码,提取细粒度生存信息,并结合对比增强的软包策略,引入正常组织作为对照,减少冗余,提升模型的区分能力,从而提高预后预测效果。 (3)基于跨模态变分推断的癌症预后研究。癌症预后不仅与组织形态变化相关,还涉及基因表达的微观变化。因此,本文提出了一种跨模态变分推断框架(CrossVarSurv),将病理表型与基因通路信息进行早期融合,模拟细胞间的相互作用。该方法不仅提高了预后模型的预测准确性,还增强了其生物学可解释性,为揭示癌症分子机制提供了新视角。 (4)基于空间双向迁移学习的癌症预后研究。空间转录组学通过结合单细胞水平的基因表达与空间位置信息,为肿瘤研究提供了一个全新的视角。然而,由于空间转录组数据获取成本较高且样本数量有限,分析面临较大挑战。针对这一问题,本文提出了空间双向迁移生存网络(SBiT-Surv),通过整合空间转录组数据与病理数据库,实现数据域的双向迁移。该模型不仅能够预测空间转录组的生存信息,还为病理图像提供局部和微观层面的生物学背景支持,从而弥补两类数据各自的不足,助力更精准的肿瘤异质性解析和生存分析。 四项研究聚焦计算病理学在癌症预后分析中的应用,分别通过无监督聚类和弱监督多实例学习方法处理大规模WSI数据、融合基因组学提升分析效果,并结合空间转录组学解析局部微观生物学信息,为精准生存风险预测和个性化治疗方案提供支持,展现了其在临床应用中的广阔前景。

关键词： 超声   剪切波弹性成像   最大弹性   非特殊类型浸润性乳腺癌   临床病理学特征  

摘要： 目的 探讨非特殊型浸润性乳腺癌(IBC-NST)剪切波弹性成像(SWE)最大弹性(Emax)值与临床病理学特征的关系。方法 回顾性收集经手术病理证实为IBC-NST的259例女性患者共261个病灶的超声及临床病理学资料。术前均行SWE检查并记录肿瘤Emax值，比较各个临床病理学特征不同分组间Emax值的差异，采用多元线性回归分析临床病理学指标对Emax值的影响。结果 肿瘤直径(P<0.001)、腋窝淋巴结转移(P=0.029)、脉管侵犯(LVI)(P=0.036)、组织学分级(P=0.009,P<0.001)、细胞核增殖抗原-67(Ki-67)表达(P=0.037)不同分组间Emax值比较差异均有统计学意义。多元线性回归显示肿瘤最大径(P<0.001)、深度(P<0.001)、肿瘤周围脂肪Emax值(P<0.001)、LVI阳性(P=0.043)是肿瘤Emax值的独立危险因素。结论 IBC-NST的临床病理学特征对肿瘤Emax值存在一定影响，认识其表现可为临床个性化治疗和预后判断提供补充参考价值。