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关键词： Chemistry  

摘要： Self-assembled monolayers for matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry (SAMDI-MS) is a platform that combines self-assembled monolayers of alkanethiolates on gold and MALDI mass spectrometry analysis to report mass changes resulting from surface reactions. The synthetic flexibility of the monolayer and the use of mass spectrometry as a generalizable readout method enables SAMDI-MS characterization of a broad spectrum of biochemical interactions. Furthermore, SAMDI-MS is compatible with high-throughput sample preparation and processing and finds important applications in high-throughput screening and experimentation. In this thesis, I will present the development and application of three unique SAMDI-MS assays. In Chapter 2, I will describe the development of a SAMDI-MS assay for the cancer-associated enzyme isocitrate dehydrogenase 1 (IDH1). The assay uses a hydrazone formation reaction to immobilize IDH1’s αKG product to the surface, where it can be quantified as a measure of the enzyme’s activity or expression level. This work reports a valuable tool in the assessment of IDH1 inhibitor or knockdown agent candidates and serves as an important early example of SAMDI-MS’s ability to assay metabolic enzymes with molecular substrates and products in complex sample environments. In Chapter 3, I will describe the application of the protein interaction by SAMDI (PI-SAMDI) assay, which measures protein-ligand interactions through binding-induced enhancement in the activity of a reporter enzyme, to explore the ligand preferences of the PHD1 reader domain of histone demethylase KDM5A. This works reveals new insights into permissible PHD1-H3 binding interactions and establishes PI-SAMDI as a useful preliminary screening tool in comprehensive studies of protein-ligand binding. In Chapter 4, I will describe the development of a SAMDI affinity selection mass spectrometry (ASMS) assay, in which surface-bound biomarker is detected upon interaction with an immo

关键词： Agro-ecological zone   Antioxidant enzyme   Basmati or non-basmati   Rice  

摘要： India has a diverse range of agro-ecological conditions which support the cultivation of different rice varieties differing in the adaptation which is so important for sustainable development of rice crop. Specific ecotypes of rice adapted to diverse conditions have divergence in their morphology, physiology, biochemistry, molecular function, agronomy, and stress response. In the present study, 12 different rice varieties viz., PB-1, PB-1509, Pusa-RH-10, CSR-30, HKR-47, PR-126, Govind, Sharbati, ADT-37, ADT-39, ADT-45, White Ponni, were selected for the study of intrinsic biochemical behaviour and these varieties belong to different Agro-ecological zones and basmati or non-basmati rice varieties. Amongst intrinsic biochemicals activity, the differential response of radical scavenging, superoxide dismutase (SOD), catalase (CAT) and guaiacol peroxidase (POX) activities, were observed in the selected rice varieties at 14 days old seedling stage, developed under controlled growth conditions. Comparatively, North India region rice varieties displayed an enhanced intrinsic biochemical response than south India region rice varieties. Similarly, basmati rice varieties showed increased biochemical response compared to non-basmati rice varieties. Thus, the differential biochemical responses (radical scavenging, SOD, CAT, and POX activities) observed creates a significant difference between rice varieties and provides valuable information about rice ecotype-biochemical interaction for sustainable adaptive value under different ecological conditions. © 2020, Korean Society of Crop Science (KSCS).

关键词： 高职   生物化学实验   混合式教学  

摘要： 探讨了混合式教学模式在高职生物化学实验教学中的应用,选取高职医学检验技术专业117名学生为实验组,2019级高职临床医学专业123名学生为对照组,分别实施混合式教学和传统的面对面线下教学,问卷调查教学效果,为高职生物化学实验教学改革提供思路。

关键词： 高职   生物化学   课程思政  

摘要： 随着教育改革的不断深入,教育部门开始提出了课程思政的教学方针,而所谓的课程思政主要就是指以构建全员、全程、全课程育人格局的形式将各类课程与思想政治理论课同向同行,形成协同效应,把"立德树人"作为教育的根本任务的一种综合教育理念,其可以在提高学生专业课程学习质量的同时培养学生的思想品德,因此教师在教学过程中应当重视高职《生物化学》课程思政教育体系建设,使学生在学习知识的同时,提升自己的道德品质,树立正确的价值观和人生观,促进学生的全面发展。本文针对高职《生物化学》课程思政教育展开了讨论和分析。

摘要： 主编:解军程景民出版:高等教育出版社出版时间:2020年8月ISBN:978-7-04-054144-1定价:39.80元内容简介《生物化学的故事—代谢之旅》以生物化学课程的主干知识为基础,以细胞中的物质代谢知识作为背景,为读者精心安排了一段奇妙的旅行,

摘要： 科教融合是当前我国高等教育发展的趋势,较多的高校和研究机构已经在科教融合的模式和教学实践方面进行了探索。提倡高水平科学家参与教学活动,教学方法和教学内容的创新,是科教融合推进中的重要内容之一。为此,我刊开辟了"科教融合"栏目,该栏目将主要刊登以下各类论文:生命科学教学中新课程的开设与探索;包含生命科学新思想或前沿知识的优秀教学案例;生命科学教学方法的探索

摘要： 科教融合是当前我国高等教育发展的趋势,较多的高校和研究机构已经在科教融合的模式和教学实践方面进行了探索。提倡高水平科学家参与教学活动,教学方法和教学内容的创新,是科教融合推进中的重要内容之一。为此,我刊开辟了"科教融合"栏目,该栏目将主要刊登以下各类论文:

关键词： 研究生助教   实验教学   生物化学   制度   建议  

摘要： 国外的研究生助教在实验教学过程中发挥的重要作用已经非常明显,在国内很多高校中研究生助教配合主讲教师参与实验教学的模式已经实施。基础生物化学是生命类专业的核心基础课程,这门课程具有很强的理论性与实践性。实验教学是生物化学的重要环节,笔者本人从事基础生物化学教学多年的实践经验表明,研究生助教在实验教学中的确发挥了重要作用,但同时也存在着一些问题,有待深入地进行反思与改进。本文以保证实验教学质量,提高研究生助教教学水平为着眼点,对研究生助教的发展现状做了概括并对助教管理体制提出了一些建议。

关键词： 茶树   叶色变异   光合作用   植物激素   多组学技术  

摘要： 独特的历史背景与茶叶品质风味使白化茶树在近年来从众多茶树品种资源中脱颖而出。随着高通量组学技术的兴起,已有研究从转录、蛋白、代谢等水平对白化茶树的叶色和特征代谢变异机理进行了探索。但受限于分析方法的单一与技术的不足,利用上述组学分析阐明白化茶树变异机理仍缺乏有效依据。因此,通过整合多组学数据集对白化茶树进行有效关联分析对于解析白化茶树变异机理具有重要现实意义。为探究白化茶树叶色变异的生理生化分子机理,本研究以课题组自选低温敏感型黄化品系‘湘妃黄叶’及其母本‘湘妃翠’(国家级良种)为实验材料,在叶色变化期对它们进行了光合生理与组织学、转录组学、翻译组学与代谢组学比较研究。主要研究结果如下:(1)‘湘妃黄叶’(EL)光合色素含量均显著低于‘湘妃翠’(GL),但叶绿素a/b显著高于GL。EL叶绿体结构异常,类囊体结构缺失。EL光系统II光化学最大量子效率(Fv/Fm)显著低于GL,但非光化学猝灭(NPQ)和光化学猝灭(q P)值均显著高于GL。正常叶主脉厚度(15.96%)和茎髓细胞厚度(43.86%)显著高于黄化叶和黄化茎,但栅栏组织/海绵组织显著低于黄化叶(37.09%)。(2)转录组测序共获得339,057,632条原始读数(reads),组内皮尔森系数高于0.98。黄化叶中上调的差异表达基因(DEGs)1968个,下调的DEGs1715个。GO富集分析表明DNA复制起始(GO0006270)富集系数最高,有25个DEGs在此条目中上调,KEGG富集分析表明类黄酮生物合成(ko00941)、黄酮和黄酮醇生物合成(ko00944)和鞘糖脂生物合成(ko00601)的富集因子最高,共有47个DEGs在这些通路中上调,2个DEGs下调。GSEA-KEGG分析表明MAPK信号通路、氮硫代谢等在黄化叶中起正调节作用,而类黄酮生物合成、光合作用等在黄化叶中起负调节作用。随机筛选22个DEGs进行实时荧光定量PCR验证,所得到趋势均与转录组数据一致。(3)翻译组测序共获得573,023,425条原始reads,组内皮尔森系数高于0.96。黄化叶与正常绿叶的核糖体印迹(RPF)长度近似(32nt),其分布规律为CDS>内含子>3’UTR>5’UTR。核糖体结合翻译的起始和终止位点分别位于上游24nt和下游24nt。黄化叶中上调的差异翻译基因(DTGs)998个,下调的DTGs1025个。GO富集分析表明细胞增殖(GO000828)富集因子最高,有35个DTGs在此条目中上调。KEGG富集分析表明类黄酮生物合成(ko00941)、DNA复制(ko03030)和光合作用(ko00195)的富集因子最高,共有48个DTGs在这些通路中上调,13个DTGs下调。4259个基因(8.43%)在转录与翻译两水平的表达趋势一致,它们主要富集在类黄酮代谢、DNA复制等通路。黄化叶中120个基因翻译效率(TE)降低,192个基因TE提高。在黄化叶和正常绿叶中均发现翻译效率越高的基因的CDS区域长度更小而GC含量更高,基因的3’UTR区域GC含量越低。基因的5’UTR区域均值化最小自由能越大,序列长度越小。全基因组中共有2523个基因(42.4%)被预测拥有u ORF,平均每个基因约有3个u ORF,黄化叶中1739个基因拥有3103个核糖体结合的u ORF,正常绿叶中1689个基因被预测含有2981个u ORF。翻译u ORF比非翻译u ORF拥有更强的折叠潜力,但5’UTR长度更短。翻译u ORF的u ORF到m ORF启动子的相对长度以及从u ORF到转录启动位点比非翻译u ORF更短。翻译u ORFs显著抑制了相应基因的转录效益,并且随着翻译u ORF数量的增加,翻译效率的降低也进一步增强。(4)广泛靶向代谢组学共鉴定出553个代谢物,它们主要包括:生物碱、氨基酸及其衍生物、类黄酮等10种类型。共筛选出108种差异积累代谢物(DAMs),主要包括氨基酸类和类黄酮类代谢物。靶向测定16种植物激素发现黄化叶中的水杨酸、脱落酸、反式玉米素和吲哚乙酸显著低于正常绿叶,且水杨酸、脱落酸和吲哚乙酸之间存在显著正相关关系。整合多组学结果表明,黄化叶HY5基因在转录和翻译水平均显著高于正常绿叶,并且与3种特征植物激素均显著负相关。PHYA和CRY1在转录和翻译水平表达趋势一致,分别与ABA和IAA呈显著负相关。

关键词： 高职   生物化学,教学现状   对策  

摘要： 生物化学内容抽象晦涩,很多学生学习起来比较吃力,没有学习的兴趣,从教材、实验、教师的教学方法以及学生的能力等四个方面分析高职护理专业生物化学教学现状,并探讨相应的对策,使学生变被动学习为主动学习,掌握学习方法,养成良好的学习习惯,提高专业能力,为以后的护理专业核心课学习奠定基础。