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摘要： 中国生物化学与分子生物学会北京大学主办·中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)《中文核心期刊要目总览》收录·美国《化学文摘》(CA)收录并列为国际核心期刊·中国科学引文数据库(CSCD)、《中国生物学文摘数据库》、《中国期刊网》、《中国学术期刊(光盘版)全文数据库》、《中国科技期刊精品数据库》收录·美国《生物学文摘》(BA)、俄罗斯《文摘杂志》(AJ)、世界卫生组织西太平洋地区医学索引(WPRIM)收录·特设郑集-张昌颖优秀论文奖励基金

关键词： 高职院校   药学专业   生物化学   课程思政  

摘要： 生物化学是高职院校药学专业重要的专业基础课程。充分挖掘生物化学课程所蕴含的思政元素，并将其融入教学全过程，是落实立德树人根本任务和提升“三全育人”成效的重要途径。以高职院校药学专业生物化学课程为例，阐述了开展课程思政的必要性，从课程思政元素的挖掘和教学手段实施等方面，对课程思政融入专业课程进行了探究，以期为相关教学提供借鉴。

关键词： 石油降解   模型   地下水化学特征   碳酸平衡  

摘要： 有机污染问题是地下水面临的主要问题之一。当前生物降解被视为修复去除地下水有机污染物的绿色途径,生物降解的发生必然扰动含水层原有生物地球化学作用,因而降解过程对地下水化学环境因素扰动效应值得探究。本文首先将有机物的降解理论与水文地球化学理论相结合,从理论上推导地下水化学成分对典型有机污染的生物化学响应模型,揭示有机物降解对地下水化学因素的影响机制。其次,通过室内实验模拟地下水环境因素随典型污染物降解的变化规律,将实验数据与模型进行拟合。最后,结合某石油污染场地资料,通过场地无机盐离子浓度变化量推导甲苯降解量,进行模型验证。文章主要得到以下几点结论:一、构建了地下水化学成分对典型有机污染的生物化学响应模型。生物降解主要通过影响体系的p H与总碳量影响地下水中各物质浓度与相关指标的变化,文章将质量守恒、电子守恒与碳酸平衡理论结合,建立地下水化学成分对甲苯-硝酸盐生物降解响应模型发现,氢离子浓度与甲苯、硝酸盐降解率变化满足一元二次方程的关系,碳酸平衡中各物质浓度可根据氢离子浓度推求。二、揭示了有机物降解对二氧化碳-碳酸盐体系的影响。生物降解过程中钙离子浓度变化与氢离子满足一元二次方程关系,碳酸根、碳酸氢根、碳酸浓度均为氢离子浓度的函数。三、揭示了有机物降解对地下水化学环境因素的影响。地下水中如酸碱性、溶解性无机碳、氧化还原电位、溶解性总固体等指标随生物降解变化。对于多数降解反应,随有机物浓度降低体系中Eh降低,溶解性无机碳增大,酸碱性、溶解性总固体与总硬度等指标的变化情况需结合具体反应分析。

关键词： Eukaryotic cells   Golgi   Effector proteins   Vesicular trafficking  

摘要： Eukaryotic cells use vesicles to transport material between their cellular compartments. The Golgi complex is the central sorting organelle for most of vesicular trafficking events in the cell. To control these trafficking events, the cell utilizes small GTPases that act as on/off switches. At the Golgi, the GTPase Arf1 coordinates most of the outgoing vesicle formation. Arf1 is regulated by the standard GTPase cycle and is activated when a GEF exchanges GDP for GTP. Once GTP bound, Arf1 undergoes a conformational change that allows it to localize to the Golgi complex and recruit effector proteins. At the Golgi, Arf1 is activated by three different GEFs, Gea1, Gea2, and Sec7. These proteins share a common catalytic GEF domain and regulatory domains of unclear function. While they activate the same substrate, Gea1/2 are functionally distinct from Sec7, which activates Arf1-dependent vesicle formation at later parts of the Golgi. Gea1 and Gea2 activate Arf1 at the early and medial Golgi respectively for COPI vesicle formation. While Gea1 and Gea2 are genetically redundant, they have distinct localization in vivo. To understand the regulation of the Golgi Arf-GEFs, I used a structural approach to determine the function and mechanism of these regulatory domains. I present the first full-length structure of a large Arf-GEF, Gea2, andthe structure of Gea2 bound to its substrate Arf1. Using these structures, I was able to structurally and biochemically characterize the activation of Arf1 by Gea2.

关键词： 腐殖质还原菌   敌草快   Kosakonia oryzae   厌氧转化   电子传递  

摘要： 腐殖质呼吸是一种重要的微生物厌氧呼吸形式,对元素地球化学循环及污染物转化具有重要意义。微生物在进行腐殖质呼吸时能够介导环境中多种有机污染物的脱毒降解和直接参与Fe、Mn等重要元素的自然循环过程。发掘更多可培养的腐殖质还原菌资源并开展其厌氧转化污染物的特性研究,明确其在环境中降解转化污染物的规律,仍然是环境微生物领域的研究热点。从海南省多种环境介质中取样,以蒽醌-2,6-二磺酸二钠（AQDS）为唯一电子受体进行腐殖质还原菌的富集分离,通过形态学和生理生化特征,16S r RNA以及全基因草图序列分析对菌株进行鉴定;并研究其Fe（Ⅲ）-腐殖质还原特性以及厌氧条件下对敌草快的转化机制。主要结论如下:（1）从海南省南渡江河流沉积物中分离得到1株兼具腐殖质还原以及厌氧转化敌草快能力的菌株HN05,鉴定为水稻科萨克氏菌（Kosakonia oryzae）HN05。最佳单因子培养条件分别为:温度28-30℃、氯化钠浓度0.5%-1%、p H5-7。HN05生长迅速,培养16 h即可进入生长稳定期。（2）电子供体谱结果显示:菌株HN05能以蔗糖、葡萄糖、乳糖、乳酸、丙三醇、乙酸、乙醇、甲醇作为电子供体还原AQDS,利用能力从大到小依次为:蔗糖>葡萄糖>乳糖>乳酸>丙三醇>乙酸>乙醇>甲醇。（3）电子受体谱结果显示:菌株HN05以蔗糖作为电子供体,对4种腐殖质模式物的还原能力从大到小依次为:AQDS>蒽醌-2-磺酸钠>蒽醌-1,5-二磺酸钠>蒽醌-1-磺酸钠;对2种腐殖质组分的还原能力依次为:腐殖酸>黄腐酸;对2种溶解性Fe（Ⅲ）氧化物的还原能力依次为:乙二胺四乙酸铁钠（Fe-EDTA）>柠檬酸铁;对4种不溶性Fe（Ⅲ）氧化物的还原能力依次为:水铁矿（HFO）>针铁矿>纤铁矿>赤铁矿。胞内电子呼吸抑制结果显示:菌株HN05以Fe-EDTA、AQDS为电子受体时,菌株电子传递链组分只包括脱氢酶;以HFO为电子受体时,HN05电子传递链组分包括脱氢酶、醌类。3种电子受体的电子传递过程都可能偶联质子跨膜转运和ATP合成。（4）菌株HN05厌氧转化敌草快结果表明:在腐殖质还原体系中,HN05能以蔗糖作为电子供体直接厌氧转化敌草快,加入AQDS能显著促进敌草快转化,22 d转化率即可达41.93%。腐殖质模式物种类和浓度、蔗糖浓度、温度、p H是影响转化的关键因素,最佳条件为:AQDS 0.5 mmol/L、蔗糖0.25 mmol/L、培养温度30℃、p H 6.5,此条件22 d敌草快转化率为53.82%。HN05可同时通过生物与化学作用驱动敌草快的厌氧转化,（1）生物机制为:HN05以蔗糖作为电子供体,敌草快直接作为微生物末端电子受体被还原降解;（2）化学机制为:HN05驱动AQDS生成还原性产物蒽氢醌-2,6-二磺酸二钠（AH2QDS）,AH2QDS进一步与敌草快发生氧化还原聚合反应,生成单晶晶体。

关键词： BOPPPS   对分课堂(PAD)   中医学生物化学理论课  

摘要： 为了应对信息时代大学教师在课堂教学中面临的挑战，笔者在生物化学理论课程中应用了混合教学模式，在BOPPPS教学框架的基础上，将PAD教学理念融入参与式学习和总结环节，将两种教学模式结合起来。文章首先对两种教学模式及融合模式的基本理念进行界定，在分析当前高校课堂教学存在的问题基础上，以BOPPPS结合PAD对中医学生物化学理论课堂进行设计，最后对BOPPPS结合PAD在中医学生物化学理论课的应用展开研究。研究结果表明，该教学模式促进了学生主观能动性的调动，对教学产生了良好影响。

摘要： 2022年12月22日-23日https://***/pibbforum/第一届“生物化学与生物物理进展学术论坛”（简称“生生论坛”）将于2022年12月22日-23日召开。本次论坛的主题聚焦“细胞死亡”，诚邀国内生命科学领域的研究生和青年学者，就“细胞死亡”研究相关领域最新进展与会研讨并展示自己的研究成果。一、会议时间：2022年12月22日-23日二、会议形式：线上会议三、论坛主题：细胞死亡细胞死亡是指细胞到达生命终点，处于不可逆转的状态，其对生命体的发育、形态维持具有重要意义，与肿瘤、退行性疾病、代谢性疾病、免疫疾病等多种疾病的发生发展有密切联系。本次论坛聚焦细胞死亡，设置以下专题：

关键词： 高职医学   生物化学   云课堂“线上+线下”混合式教学  

摘要： 针对高职医学生物化学的教学现状，以智慧职教云为教学平台，运用“移动混合式教学模式”将信息化教学与翻转课堂有效结合，使“线上+线下”混合式教学模式深度融合，体现互动、交互式的课堂环境，构建高职高专医学生物化学创新课程教学模式，以期切实提高教学质量。

关键词： 手绘笔记图   生物化学   代谢途径   教学效果  

摘要： 在多媒体和信息化教学已经普及的现代大学课堂,笔记仍然有不可替代的作用。教师在生物化学教学过程中,鼓励学生手绘笔记图,有效地对分散知识点进行梳理,建立知识内容的逻辑架构,从整体上掌握知识内容,达到了良好的效果。本文以动态生物化学为例,介绍手绘代谢途径笔记图的特点和案例,为高校生物化学及相关课程教学改革提供了有益参考。

关键词： 功能化碳点   聚乙烯亚胺   合成   检测   抗微生物   细菌成像  

摘要： 荧光碳点（Carbon dots,CDs）是一种有前途的新型光致发光（PL）纳米材料,具有突出的光学特性、表面功能化、优异的生物及环境友好性等优点,在医学和化学等领域都得到了广泛的应用。其中,作为探针用于生化检测是CDs最常见的也是研究最多的应用,这些CDs利用其表面某些特定的化学结构与检测对象产生光化学反应以达到检测的目的。然而,未经修饰和特定构建的CDs用于检测往往存在灵敏度不高、特异性差的问题,此类缺点在一定程度上降低了其实际应用价值。近年来,人们已经逐渐发现CDs所具备的医学作用,CDs作为医学治疗的候选者应用于肿瘤、药物递送、抗菌等是比较新兴的课题。因此构建功能化CDs,并发掘其潜在应用价值对于纳米材料的研究具有深远的意义。本论文主要总结文献所研究的非金属掺杂型CDs的合成、表征及功能性研究。在此基础上,修饰制备出三种聚乙烯亚胺（PEI）为主要原料的功能化CDs,以对其在成像、检测、抗微生物治疗等方面进行了探索。第1章主要围绕CDs的制备、表面改性修饰、发光机制及其应用情况进行介绍。在当前的研究中,CDs的原料来源十分广泛,主要分为天然存在的材料及合成化合物。同时,人们对CDs的制备研究非常丰富,方法多样,尤其是基于原料和制备方法对CDs进行的改性和修饰。此外,我们根据文献对CDs的发光机制及表面性质进行了阐述。本章还对CDs在生化检测、成像以及细菌感染治疗等方面的应用进行了论述。第2章以葡萄糖（Glc）为碳源,PEI为氮源,柠檬酸（CA）为碳源,在低温（80℃）的条件下1 h一步制备出具有良好生物相容性的蓝绿色氮掺杂CDs（N-CDs）。并且系统地讨论了合成条件特别是原料的选择对产物光学性能的影响。并且,我们还采用荧光共聚焦进行细菌成像,充分利用其突出的光学性质。通过抑菌（抑菌圈和最小抑菌浓度）实验我们系统地对比了N-CDs对多种微生物（革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌以及真菌）的抑制作用。此章对于掺杂型CDs的制备及抗菌应用提供了理论依据。第3章开发出一种首次采用1-硫代甘油（TG）为硫源,PEI为氮源,采用一步法合成具有蓝绿色荧光的多功能氮、硫共掺杂碳点（N,S-CDs,反应的温度为120℃,时间为80 min）。由于该CDs表面富含氨基和硫元素,所以其对Cu2+具有高灵敏的选择性。检测限达到10 n M,线性范围从0.25-50μM。由于药物硫普罗宁对Cu2+有较强的结合力,基于荧光猝灭恢复机制,也实现了对硫普罗宁快速灵敏的检测。其对革兰氏阳性菌（金黄色葡萄球菌和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌）具有较强的敏感性。同时,我们还发现该N,S-CDs具有出色的生物相容性,且有望用于细菌的生物成像。新型N、S共掺杂CDs的制备及其对生化小分子的检测和抗菌研究显示出其在生化领域良好的应用潜力。第4章我们通过水热法合成了具有广谱性抗菌功能的季铵化CDs（q CDs）。使用多种方式如透射电镜、Zeta电位、红外和X射线光电子能谱对其形貌和尺寸、表面电位和基团等进行表征,并通过荧光、紫外等对其光学性质进行研究。本文报道了该q CDs具有广谱性的抗微生物作用,值得一提的是它们对于耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的最小抑菌浓度达到10μg/m L。我们进一步采用扫描电镜和分子生物学手段结合其表征结果研究了碳点的抗微生物机制。在其良好的光学性质基础上,q CDs还被成功用于细菌成像。这种q CDs的开发,对于高效抗微生物CDs的研究提供了良好的思路。