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关键词： DNA   田园洞   测序   中国科学院   人类基因组   提取   古脊椎动物   古人类  

摘要： 近日，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所的研究人员使用一种特殊的捕获技术，从于北京房山的田园洞出土的一具4万年前的、被细菌和真菌DNA严重污染的男性骨骼化石样品中，将混杂在大量微生物DNA中极其微量的古人类DNA筛选了出来，并进行了测序。由此，中国古人类的第一个基因组，也是整个东亚地区最古老的人类基因组诞生了。

关键词： 植物基因工程   教学改革   教学实践  

摘要： 《植物基因工程》是生命科学相关专业的研究生基础课程,针对教学中发现的课程信息量大、前沿知识丰富而抽象、课时少等问题,优化教学内容、改进实验教学方法,特别是利用微信平台辅助教学,有效提高教学质量和教学效果。

关键词： DNA甲基化   药用植物   重亚硫酸盐测序   表观遗传学   品质差异  

摘要： DNA甲基化是目前研究最为广泛的一种表观遗传学现象,甲基化后的DNA可在不改变碱基序列的情况下对植物的表型进行调控。在高等植物中有CG、CHG和CHH(H代表A、C或T)3种甲基化位点,多发生于对称序列CG和重复序列中,且不同物种中的甲基化程度和模式不同。药用植物功能基因启动子区域的DNA发生甲基化后,可抑制基因的表达,进而影响其次生代谢产物的积累,导致品质差异的形成。在众多的DNA甲基化检测方法中,重亚硫酸盐测序法可在单核苷酸水平上鉴别DNA甲基化的位点和程度,是DNA甲基化分析的金标准。对其进行引物优化、技术改良后,可有效地揭示药用植物的DNA甲基化情况,这为阐明经典遗传学不能完全解释的药用植物品质差异等问题提供了技术支持,并开辟了新的研究方向。

关键词： 冷鲜鸡   菌群结构   涂抹法   冲洗法   高通量测序  

摘要： 目的:比较涂抹法和冲洗法对冷鲜鸡表面细菌DNA提取及高通量测序结果的影响。方法:将4只冷鲜鸡对半分开,分别采用涂抹法和冲洗法采集其表面微生物,提取基因组DNA,对细菌16S rRNA基因V3~V4区进行聚合酶链式反应扩增,通过Illumina Hiseq测序平台对扩增产物进行高通量测序,使用QIIME等软件对测序序列进行分析统计。结果:两种方法采集的样品在细菌基因组DNA提取、菌群丰富度、多样性及菌群结构等方面均无显著差异(P>0.05)。高通量测序结果表明,冷鲜鸡表面细菌菌群主要分布于7个门,10个属。变形菌门为优势菌门,占70%以上;希瓦氏菌属、假单胞菌属、不动杆菌属、嗜冷杆菌属和环丝菌属为优势菌属,分别占10%~20%。结论:两种采样方法对冷鲜鸡表面细菌DNA提取及高通量测序没有明显影响,但冲洗法比涂抹法简单易行,且不易发生二次污染,因此更具有实用性。本实验同时也为冷鲜鸡表面细菌的研究提供了数据资料。

关键词： 叉头转录因子类   胚胎干细胞   胰岛  

摘要： 目的 探讨叉头状转录因子O1（FoxO1）对人胚胎干细胞（hESCs）定向分化为胰岛素分泌细胞（IPCs）的调控作用.方法 体外诱导hESCs定向分化为IPCs,应用定量聚合酶链反应（PCR）和Western blotting分析FoxO1的动态表达,采用定量PCR检测八聚体结合转录因子4（Oct4）、叉头转录因子a2（Foxa2）、胰十二指肠同源盒因子1（Pdx1）及胰岛素表达的动态变化.在分化第3阶段细胞（胰腺前体细胞）中通过慢病毒感染敲减或过表达FoxO1,应用定量PCR检测胰腺前体细胞Foxa2、Pdx1及胰岛素的表达;利用酶联免疫吸附试验（ELISA）方法检测葡萄糖刺激的胰岛素分泌.两组数据的比较采用t检验,多组间比较采用单因素方差分析.结果 在hESCs定向分化为IPCs的五个阶段中,FoxO1 mRNA和蛋白水平可见持续稳定表达;Oct4表达水平随着分化进程呈显著进行性降低;Foxa2表达水平呈先升后降的趋势,在分化第3阶段达到高峰;Pdx1和胰岛素表达水平随着分化进程逐渐升高.与相应的对照组相比,敲减FoxO1可显著上调胰腺前体细胞中Foxa2（4.31±0.74比1.00± 0.34,t=7.08,P〈0.01）、Pdx1（2.91±0.24比1.00±0.15,t=11.62,P〈0.01）及胰岛素mRNA（2.60±0.25比1.00±0.12,t=10.08,P〈0.01）表达水平,过表达FoxO1可显著下调胰岛素mRNA表达（0.81±0.07比1.00± 0.03,t=4.19,P〈0.05）,而对Foxa2和Pdx1的mRNA表达未有显著影响.此外,敲减FoxO1既可增加低糖（2 mmol/L葡萄糖）状态下的胰岛素分泌（7.53±2.02比1.00±0.05,t=3.23,P〈0.05）,又可促进高糖（20 mmol/L葡萄糖）刺激下的胰岛素分泌（17.39±3.04比6.45±1.34,t=3.30,P〈0.05）;而过表达FoxO1对低糖状态下的胰岛素分泌无明显影响,但可抑制高糖刺激下的胰岛素分泌（2.02±0.50比4.85±1.42, t=2.61,P〈0.05）,从而使细胞丢失对葡萄糖的反应性.结论 FoxO1在hESCs定向分化为IPCs的过程中发挥负性调控作用,抑制FoxO1表达可能是促进IPCs分化成熟的一种潜在策略.

关键词： GT1-7细胞   启动子甲基化   二代测序   克隆测序  

摘要： 目的:利用二代测序技术检测GT1-7细胞中KISS1和GnRH基因启动子范围内的甲基化状态,并用金标准的亚硫酸氢盐修饰后的克隆测序作为对照,比较二代测序与金标准克隆测序在研究DNA甲基化检测中的差别。方法:提取GT1-7细胞基因组DNA并进行亚硫酸氢盐处理。进行巢式PCR,将PCR产物进行二代测序。同时采用金标准的亚硫酸氢盐修饰后克隆测序的方法作为对照,对相同批次的PCR产物进行克隆测序。结果:PCR产物二代测序结果表明KISS1和GnRH两个基因的27个CpG甲基化位点信息完整,结果准确。挑取10个克隆进行一代测序结果表明序列无丢失,KISS1和GnRH两个基因的27个CpG甲基化位点信息完整。结论:利用高通量的二代测序技术能够有效的对DNA甲基化的PCR产物进行检测,二代测序和克隆测序都是研究DNA甲基化的有效方法,但前者与克隆测序相比每一个读取序列(reads)都相当于一个单克隆,且二代测序每个区段得到成百上千个reads,因此二代测序结果更加精确。

关键词： 行动者网络理论   转基因作物   科学技术   社会  

摘要： 以行动者网络理论架构转基因作物产业化网络,可以揭示出科技与社会中多因素之间互相影响、制约的作用机制。厘清行动者网络理论的基本内容并分析转基因作物产业化网络联盟中不同行动者之间的"转译"关系,探讨行动者之间的责任问题以及科技与人文的复杂交织,充分印证了新科技成果的诞生与发展是科技与社会杂合体中各个行动者合作与博弈的过程与结果。

关键词： 基因工程   研究团队   籼粳杂种   细胞质雄性不育   植物分子生物学   水稻基因   杂种优势   杂交水稻   等位基因   千百十工程   恢复基因   分子机理  

摘要： 三年来,以刘耀光为首的'水稻育性发育机理与基因工程'研究团队,克隆了3个水稻细胞质雄性不育的不育基因、2个恢复基因等,揭示相关分子机理,并在国际权威期刊发表一系列高水平研究论文,奠定了我国在植物育性研究的国际领先地位。这些研究成果能帮助育种工作更有策略。水稻亚种间杂交雄性不育妨碍了水稻产量的进一步提升,本周《自然-通讯》发表的一项研究Genomic structural variationmediated allelic suppression causes hybrid male sterility in rice为了解其背后遗传机制带来了新的见解。论文的通讯记者正是华南农业大学'水稻育性发育机理与基因工程研究团队'的领头人刘耀光。

关键词： 转基因   安全性   环境生物   潜在影响  

摘要： 利用基因工程得到的转基因植物是一种人工创造的新物种。转基因植物在提高作物产量、减少有害物质的使用等方面发挥了巨大作用,但这种未经过"物竞天择,适者生存"的自然法则引入到生态系统的转基因植物对环境生物将产生潜在影响。对转基因植物外源DNA产生的潜在生态风险、转基因植物对生物多样性的影响进行了综述。

关键词： 基因工程   地方性应用型大学   教学改革  

摘要： 基因工程作为生物工程专业的核心课程,占据着人才培养的重要位置。作为地方性应用型大学,基因工程课程的开设应当立足于为学生建立完整的知识架构,通过综合利用教学方法,培养既能继续深造学习、又可以迅速对接和服务地方企事业单位的专业人才。