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关键词： 三代基因组测序   DNA 6mA甲基化   LTR逆转录转座子   真菌基因组  

摘要： 羊肚菌属于子囊门真菌,是世界范围内最受欢迎的食用菌之一。本研究通过PacBio单分子实时高质量核基因组组装,大小为53.57Mb,重复序列含量为17.03]%,e"包含42条重叠群(contigs),重叠群N50高达1.82Mb,其中13条重叠群两端均含有端粒重复序列,为完整的染色体。通过链特异性RNA-seq测序和转录本拼接,并结合多种基因预测策略,预测到13182个蛋白编码基因,包括267个碳水化合物活性酶,11个次生代谢产物合成基因簇。通过与内蒙古地区栽培的六妹羊肚菌菌株NZTD180501373基因组比较发现,六妹羊肚菌进化过程中可能发生过染色体重组事件,二者具有33055个SNP和48726个InDel位点差异,并且各自拥有超过6Mb的特有序列。此外,相比于梯棱羊肚菌***,六妹羊肚菌SCLS菌株中与逆转录转座酶有关的orthogroup发生了扩张,并且拥有5个成员数超过100的特有逆转录转座酶基因家族。对SCLS菌株中的DNA N6腺嘌呤甲基化(6mA)修饰进行了鉴定,发现SCLS菌株基因组中0.42%的腺嘌呤被6mA甲基化,其含量显著高于已报道的6种双核亚界(Dikarya)真菌。6mA甲基化位点在逆转录转座子上显著富集,表明六妹羊肚菌中6mA甲基化可能调控逆转录转座子的活性,这也是首次在真菌中报道6mA甲基化与转座子相关。

关键词： 干细胞   诱导多能干细胞   胚胎干细胞   拟胚体   多能性   造血分化   造血干细胞   羊水细胞   尿细胞  

摘要： 背景:通过小分子化合物、质粒转染等方法可成功诱导出无病毒载体整合的诱导多能干细胞。与胚胎干细胞相似,诱导多能干细胞可向造血祖细胞进行自由分化,但外源性因子的转入及不同来源人体细胞是否对诱导多能干细胞的分化及诱导造血祖细胞产生影响,目前尚未清楚。目的:比较人不同细胞来源诱导多能干细胞和胚胎干细胞拟胚体的基因表达差异,为诱导多能干细胞的临床转化进行探索。方法:分别选用羊水细胞及尿细胞来源诱导多能干细胞和人胚胎干细胞进行诱导分化。收集分化不同时间点的拟胚体,检测多能性基因Oct4、Sox2、Nanog以及内胚层标记基因GATA4、中胚层标记基因MSX1、外胚层标记基因PAX6、造血干细胞标记基因CD34和CD43的表达。结果与结论:①羊水细胞来源诱导多能干细胞拟胚体在培养第8天检测不到Oct4、Sox2、Nanog表达,尿细胞来源诱导多能干细胞和胚胎干细胞拟胚体可维持表达至第16天;②羊水细胞来源诱导多能干细胞拟胚体中GATA4、MSX1、PAX6表达量峰值出现在第4天,持续表达到第8-12天,而其他2种细胞拟胚体中GATA4、MSX1、PAX6表达量峰值出现在第4-8天,并且可持续表达至第12-16天;三胚层标记基因在尿细胞来源诱导多能干细胞拟胚体中的表达量明显高于其他2种细胞拟胚体;③在羊水细胞、尿细胞来源诱导多能干细胞拟胚体中造血干细胞比率在第12天达峰值,而胚胎干细胞拟胚体中造血干细胞比率在第4天达峰值,尿细胞来源诱导多能干细胞拟胚体中造血干细胞比率高于其他2种细胞拟胚体;④人不同细胞来源诱导多能干细胞及胚胎干细胞拟胚体分化培养过程中均具有全能性及三胚层分化能力但各具特点。尿细胞来源诱导多能干细胞或许更适合替代胚胎干细胞成为体外研究造血细胞分化的模型。

关键词： Bioethics   Ethics   Medical Law   Public Health   Biomedicine   general   Health Administration  

关键词： medical decision-making   allocation of scarce resources   crisis standards of care   triage algorithm   first come   first served   time-limited trial   pandemic  

摘要： I was a member of the Massachusetts advisory working group that wrote the Commonwealth's crisis standards of care guidance for the Covid-19 pandemic, and I was proud of the work we did, thinking carefully about whether age should matter and whether priority should be given to essential workers if there was a scarcity of medical resources, about whether protocols should address issues of structural racism, and so forth. But as a critical care physician, I have concluded that, no matter how sophisticated the ethical analysis, the fundamental approach we proposed was flawed and virtually impossible to implement. All the existing allocation protocols that states developed are based on the assumption that clinicians will be faced with the task of selecting which patients will be offered a ventilator from among a population of patients who are each in need of one. The protocols then assign patients a priority category, and the protocols specify "tie-breaking" criteria to be used when necessary. The problem with this approach for ventilator allocation is that it has no relationship whatsoever to what happens in the real world.

关键词： 基因治疗   肿瘤微环境   基因工程   CRISPR-Cas9   CAR-T  

摘要： 一直以来,肿瘤的治疗都是医学领域以及大众所关心的重要问题,医学界科研人员利用科学技术、临床实验,结合工作实践,探索出了许多肿瘤治疗的新方法.其中,从基因层面治疗肿瘤成了有目共睹且行之有效的方法,相关治疗手段已经进入了临床试验阶段,可谓发展迅速.理论上来说,基因治疗是最好、最根本的治疗肿瘤的方式,但也是肿瘤治疗方式中面临问题最多、最困难的方式之一.因此,如何解决基因治疗在肿瘤方面的困难成了摆在人们面前的首要问题.

关键词： 高中生物   教学设计策略   任务驱动   遗传与进化   中心法则   基因工程   微观性   科学原理  

摘要： 1教材分析及设计思路“基因工程概述”是高中生物苏教版《选修3•现代生物科技专题》的第一章“基因工程”的第一节。本节需要学生掌握的基因工程的工具和实施过程偏实践性、操作性,是科学原理和知识运用于实践的技术手段。而与其有关的原理是学生在《必修2•遗传与进化》中学过的“DNA的结构和复制”“基因的表达”“中心法则”等内容。鉴于基因的微观性,该部分内容比较抽象,学生难以理解,是高中生物教学中的难点。

关键词： 灵芝酸   合成代谢   基因工程   代谢调控  

摘要： 灵芝酸是药用灵芝菌的次级代谢产物,是灵芝菌的主要活性成分之一,已经在抗癌以及其他医药领域进行了深入研究。为了解决灵芝孢子、子实体生长周期长,生长环境要求高以及灵芝酸含量低等问题,灵芝菌深层液体发酵技术应运而生。尽管已经取得了一定的突破,但是发酵生产灵芝酸的低产量问题依然存在。灵芝酸生物合成途径的解析和调控对于解决发酵生产灵芝酸低产量问题意义重大,本文系统综述了近年来在灵芝酸生物合成和代谢调控方面的研究进展,并提出未来研究重点方向,为进一步通过基因工程手段和代谢通路调控手段实现灵芝酸的高浓度积累提供参考。

关键词： 非天然氨基酸   遗传密码扩展   反式翻译   基因工程   蛋白表达   ssrA  

摘要： 基于遗传密码扩增技术实现向蛋白质中终止密码子处定点引入非天然氨基酸会不可避免地造成截短型蛋白堆积以及产率降低。通过利用细菌天然存在反式翻译机制,即tmRNA介导的蛋白降解机制,作者设计了ssrA-X标签。将ssrA-X插入目标蛋白,利用截短型蛋白的C端暴露出ssrA标签能够被Ssp B识别,进而被clpX降解的特性,完全消除了截短型蛋白,同时增加了含非天然氨基酸的蛋白产量。通过荧光蛋白Cp Venus,融合蛋白GFP-Spycatcher,膜展示蛋白Omp A-Darpins分别验证了ssrA-X标签的可行性。

关键词： 儿童   B抗原减弱   家系遗传   DNA测序  

摘要： 目的:探讨ABO血型B抗原表达减弱样本的分子生物学机制,并对其家系ABO血型反应格局特征进行分析。方法:采用微柱凝集法及盐水试管法进行ABO血型血清学检测;PCR产物直接测序对ABO基因第1~7外显子进行ABO血型基因分型及序列分析。结果:血清学检测结果显示患儿为ABweak,患儿母亲为Bweak,患儿B抗原表达弱于母亲且有抗B抗体的产生;分子生物学结果显示患儿基因型为ABO*A1.02/ABO*B3.02,患儿母亲基因型为ABO*B3.02/ABO*O.01.02。结论:患儿及其母亲ABO血型B抗原表达减弱存在家系遗传性质,均表现为B3型;但二者B抗原表达情况及抗A产生强度均有所不同,可能由于患儿A等位基因竞争抑制作用导致,同时是否与患儿免疫系统未发育完全有关,值得进一步关注。