关键词:
仔猪
初生重
哺育期
微生物多样性
优势菌属
摘要:
【目的】分析不同初生重仔猪哺乳期肠道微生物组成和丰度的差异,辨识影响后续发育的关键菌群标志物,为仔猪保健策略的制定提供科学依据。【方法】选取10头体况相近的二胎妊娠母猪统一进行饲喂,仔猪出生后,根据体重在每窝中分别选择低初生重仔猪和正常初生重仔猪各1头,组成正常初生重仔猪组(NBWP,1.58 kg±0.04 kg)和低初生重仔猪组(LBWP,0.98 kg±0.02 kg),每组10头,公母各半。于3、7、14、21日龄时采集各组仔猪粪便样本,提取DNA并进行质量过滤和操作分类单元(OTU)聚类。通过数据库比对分析物种组成,使用QIIME2计算Alpha和Beta多样性。使用R语言mixOmics包进行PL-DA分析。【结果】3、7、14、21日龄时,NBWP组仔猪体重均极显著高于LBWP组(P<0.01)。NBWP组获得2 478个OTUs,LBWP组获得1 721个OTUs。两组在相同日龄的Alpha多样性和Beta多样性变化趋势相似,但LBWP组菌群多样性和丰度显著低于NBWP组。两组仔猪肠道中的优势菌门均为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria);3日龄时,LBWP组仔猪肠道中厚壁菌门相对丰度显著高于NBWP组,变形菌门相对丰度显著低于NBWP组。拟杆菌属(Bacteroides)、乳杆菌属(Lactobacillus)和普雷沃菌属(Prevotella)是两组仔猪肠道中的优势菌属,LBWP组仔猪肠道中拟杆菌属的相对丰度高于NBWP组,乳杆菌属相对丰度低于NBWP组。进一步研究发现,LBWP与NBWP组仔猪体重差异与拟杆菌门、厚壁菌门及其他细菌的丰度变化密切相关。【结论】仔猪初生重差异能对肠道微生物的早期定植过程产生影响,进而作用于仔猪的生长发育进程。本研究探析了不同初生重仔猪的肠道微生物差异,可为后续通过调控肠道微生物以改善仔猪生长发育状况提供参考。