关键词:
微小RNA
荧光定量逆转录聚合酶链式反应
miR-196a
生物标志物
生物信息学
宫颈癌
HPV16
HPV18
摘要:
目的 探索高危型人乳头瘤病毒(HPV)16或18亚型感染后宫颈细胞中miR-196a的表达水平。方法 利用基因表达综合数据库(GEO)筛选HPV16或18亚型阳性宫颈癌细胞与正常宫颈细胞中表达差异miRNAs;利用在线生物学软件https://***/analysis/分析差异最大的miRNA表达情况与宫颈癌生存期的关系;收集经实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)基因分型检测HPV16或18亚型阳性的宫颈拭子标本作为研究对象,以同期体检人群中经qPCR基因分型检测HPV16或18亚型阴性的宫颈拭子标本作为阴性对照,采用qRT-PCR方法检测宫颈细胞中的miR-196a水平,数据处理使用2-△△Ct法。结果 通过对GSE86100数据做差异分析发现miR-196a在HPV16或18亚型阳性宫颈细胞中表达降低(log2FC=-6.60,P<0.001),miR-3188在HPV16或18亚型阳性宫颈细胞中表达显著增加(log2FC=6.22,P<0.001);利用在线分析工具https://***/analysis发现miR-196a表达高的宫颈癌患者生存期较miR-196a表达低的宫颈癌患生存期长(HR=1.87,95%CI:1.17~3.00,P=0.008),而miR-3188与宫颈癌患者生存期无相关性(HR=1.47,95%CI:0.92~2.37,P=0.110);特异性qRT-PCR对检测结果显示HPV16阳性、HPV18亚型阳性的宫颈细胞中miR-196a表达水平为(0.93±0.09,0.51±0.07)较正常对照组(1.89±0.13)降低(P<0.05),与测序分析结果一致。结论 HPV16或18亚型感染宫颈细胞后可导致miR-196a表达降低,且miR-196a表达水平与宫颈癌患者生存期呈负相关。