关键词:
细菌群落多样性
高通量测序
微小扇头蜱
长角血蜱
粒形硬蜱
摘要:
目的 了解贵州省少数民族自治州蜱的种类、分布以及蜱携带微生物群的多样性情况。方法在贵州省黔东南州、黔南州和黔西南州采集牛、羊及鼠体表寄生蜱进行16S rDNA高通量测序,测序结果经操作分类单元(OTU)聚类分析并与核糖体数据库(RDP)进行比对获得物种注释,然后通过物种组成分析、非度量多维尺度(NMDS)分析和组间相似性分析等了解蜱的细菌群落组成情况。结果 共从18个采样点采集了1463只蜱,包括微小扇头蜱(Rhipicephalus microplus,83.87%)、长角血蜱(Haemaphysalis longicornis,14.22%)、粒形硬蜱(Ixodes granulatus,1.71%)和褐黄血蜱(Haemaphysalis flava,0.20%)。高通量测序结果经质量控制后共产生1682个OTU。细菌群落鉴定发现变形菌门(Proteobacteria)、立克次体目(Rickettsiales)、立克次体科(Rickettsiaceae)和立克次体属(Rickettsia)为优势物种,平均相对丰度分别为75.52%、 52.47%、 50.88%和50.88%。蜱中还检出柯克斯体属(Coxiella,4.45%)、埃立克体属(Ehrlichia,0.93%)和无形体属(Anaplasma,0.66%)等菌属。微小扇头蜱中以立克次体属(89.45%)和柯克斯体属(2.82%)为主,长角血蜱中以立克次体属(18.06%)和假单胞菌属(Pseudomonas,11.98%)为主,粒形硬蜱中以螺原体属(Spiroplasma,33.19%)和葡萄球菌属(Staphylococcus,22.22%)为主。非度量多维尺度分析结合组间相似性分析显示不同组样本的细菌群落组成不同(R=0.599,P <0.01)。结论 贵州省三个少数民族自治州蜱细菌群落组成丰富,蜱中存在多种病原体属,不同蜱种细菌群落组成不同,应加强该地区蜱传病原体的研究,预防蜱传疾病的发生。