关键词:
子痫前期
外泌体
miRNA
GEO数据库
差异表达基因
摘要:
目的 基于基因表达数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)分析子痫前期(preeclampsia, PE)患者血浆外泌体miRNA表达特征及调控网络。方法 筛选GEO数据库中PE患者的miRNA表达谱数据。时间截点为2022年12月,筛选条件选择“Preeclampsia”,物种类型选择“Homo sapiens”,获得GSE94721和GSE175807的芯片数据。应用DESeq2分析PE的差异表达miRNA,并对相关通路进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路分析,而后使用蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)分析miRNA的靶基因,基于网络拓扑学degree值筛选出关键基因。结果 共筛选出差异miRNA 10个,其中上调5种,下调5种;KEGG分析显示,PE患者有hsa00230嘌呤代谢、hsa00240嘧啶代谢、hsa00562磷酸肌醇代谢等富集信号通路(P<0.05);基因本体论(Gene Ontology, GO)功能分析显示,生物过程(biological process, BP)包括细胞核核糖体大亚基、DNA损伤检查点、细胞有丝分裂G1S周期转变等,细胞组分(cellular components, CC)包括组蛋白脱乙酰酶复合物、组蛋白乙酰转移酶复合物、乙酰转移酶复合体等,分子功能(molecular function, MF)包括脂肪酰辅酶A结合、可溶性N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白受体结合、核苷酸结合等条目;STRING分析发现PE患者外泌体表达的关键miRNA为has-miR-223-3p、has-miR-26a-5p及has-miR-370-3p,排名前10的分别是ZNF608、STOX2、FOXO1、TAOK1、NF1、CDC6、PANK3、UBN2、CDK8及TRPS1。结论 PE患者血浆外泌体表达的关键miRNA为has-miR-223-3p、has-miR-26a-5p及has-miR-370-3p,并可能通过调控ZNF608、STOX2、FOXO1等关键基因参与了PE的疾病进程。