关键词:
肝细胞癌
磷酸肌醇3-磷酸5-激酶基因
TCGA数据库
磷脂酰肌醇信号系统
摘要:
目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库和临床样本的实验验证分析肝细胞癌(HCC)中含FYVE的磷酸肌醇3-磷酸5-激酶(PIKFYVE)基因mRNA的表达情况及其临床意义。方法基于TCGA数据库中的424例临床样本数据资料(包括HCC组织374例,非肿瘤肝组织50例),采用Kaplan-Meier法和Cox回归分析评估PIKFYVE基因表达与HCC患者生存预后及其临床特征的关系。通过PIKFYVE基因与24种免疫细胞的相关性分析,考察PIKFYVE基因与免疫细胞浸润的关系。此外,通过分析HCC组织中PIKFYVE基因的表达与RAC-α-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、磷脂酰肌醇-3-激酶抑制蛋白(PTEN)、蛋白激酶C,α(PRKCA)、肌醇多聚磷酸5磷酸酶(INPP5D)、磷酸肌醇3激酶调控亚基1(PIK3R1)、肌醇多聚磷酸-4-磷酸酶Ⅱ型(INPP4B)和磷酸肌醇特异性磷脂酶-C4(PLCB4)基因的mRNA表达水平的相关性。同时收集新疆医科大学第一附属医院病理科HCC患者的高分化、中分化、低分化以及非肿瘤肝组织石蜡切片各30份,通过苏木精-伊红染色法进行组织病理学观察;且用免疫组织化学法对各临床样本中PIKFYVE、Ki67蛋白表达水平进行验证。计量资料组间数据比较采用t检验,计数资料组间比较采用χ^(2)检验、Wilcoxon秩和检验,生存分析采用Kaplan-Meier法。结果PIKFYVE基因在HCC肿瘤中的表达水平高于正常肝组织(P<0.01),PIKFYVE低表达组患者的总生存期明显长于高表达组(HR=1.57,95%CI:1.10~2.25,P=0.014)。单因素Cox回归分析结果显示肿瘤分期、病理分期、肿瘤状况和残余肿瘤对总体生存期存在影响(P<0.05),PIKFYVE的表达水平对总体生存期存在影响(P<0.05);PIKFYVE预后风险模型评分比HR=1.533(95%CI:1.077~2.181,P=0.018)。多因素Cox风险比例回归分析显示PIKFYVE预后风险模型评分比HR=1.481(95%CI:0.886~2.476,P=0.134),且受试者操作特征曲线下面积为0.559,表明PIKFYVE预后风险模型在生存预测中具有预测价值。相关性分析结果显示PIKFYVE的表达水平与免疫细胞浸润以及TP53高度相关(P<0.01)。免疫组织化学染色结果显示,HCC组织样本中的PIKFYVE表达水平显著高于非肿瘤肝组织(P<0.01),且与分化程度呈负相关。结论PIKFYVE作为HCC的独立危险因子,有望开发成HCC临床诊断的生物标志物,为研发治疗HCC的新药提供参考依据。