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关键词： 信息论   司法语篇   庭审对话   反馈方法  

摘要： 判决书是司法机关发布的具有法律效力的公文,是公众和法院等司法机关部门之间的重要纽带。在信息论视角下,通过从动态庭审过程至其产生的静态判决书文本两个方面探讨了司法语篇信息传播途径,并基于该路径分析了信息传播的影响因素。研究发现判决书信息传播经历传播者—信道—受播者三个阶段,庭审过程及交际者对信息传播过程产生影响。要改善和推进该模式下信息的传递,传播者应选择更为可靠和高效的信道,并减少负反馈。信道的控制对司法语篇信息的传播具有指导作用。

关键词： 《读杜姑妄》   杜诗校注   声病   四声递用   文学经典化  

摘要： 吴梯《读杜姑妄》可算晚清一部规模较大、体例划一的杜诗全集校注,成于兵燹时期是其流传不广、鲜为人见的原因之一,今人曾误以为是诗话,疑其已佚。此书校注杜诗1434首,反对“傅会穿凿”,追求“以杜解杜”;怀疑精神和立异心态极强,创见与曲解兼有;强调“老朴”为杜诗“本色”“胜人处”;屡因“避声病”“避复”、求“对(仗)工”而改杜诗,一厢情愿地制造“诗律细”文本,是为杜诗经典化进程中的极端崇杜表征。全书既具自家特色,又带有鲜明的清代学术印记,其“声病”说尤能折射当时风尚的一个侧面。杜甫近体诗辨声校勘法自李因笃、朱彝尊提出后又衍生出“四声递用”说,影响深远,聚讼至今,吴梯的全面实践为评估此法是否正确提供了绝佳的参考样本。

关键词： 沉默信息调节因子   细胞焦亡   去乙酰化   氧化应激   炎症  

摘要： 背景:不同于非炎症性细胞凋亡,细胞焦亡是炎症性细胞死亡的一种形式,它伴随着膜完整性的破坏和促炎性细胞内物质的释放,因而与多种疾病有关。沉默信息调节因子家族是依赖于烟酰胺腺嘌呤二核苷酸的组蛋白去乙酰化酶家族。除了去乙酰化外,还具有其他酶活性,如脱琥珀酸化、脱丙酰化和腺苷二磷酸-核糖基化等,在参与细胞焦亡调控中发挥重要的作用。目的:综述沉默信息调节因子家族在细胞焦亡中的作用及影响。方法:第一作者通过检索PubMed、Web of Science、中国知网、万方数据库,检索时限为各数据库建库至2024年3月,中文检索词为“沉默信息调节因子,沉默信息调节因子1,沉默信息调节因子2,沉默信息调节因子3,沉默信息调节因子4,沉默信息调节因子5,沉默信息调节因子6,沉默信息调节因子7,细胞焦亡”,英文检索词为“Sirtuins,Sirtuin1,Sirtuin2,Sirtuin3,Sirtuin4,Sirtuin5,Sirtuin6,Sirtuin7,pyroptosis”,最后纳入71篇文献进行综述。结果与结论:①沉默信息调节因子家族均参与了对细胞焦亡的调控;②过表达沉默信息调节因子1、沉默信息调节因子4可通过多种通路抑制细胞焦亡,从而缓解细胞焦亡对机体的损害;③沉默信息调节因子3除了影响细胞焦亡经典通路外,还能通过增强线粒体活性氧的清除能力、有丝分裂来抑制细胞焦亡;④沉默信息调节因子5参与细胞内代谢和能量平衡的调节,包括能量的摄入、储存和消耗;⑤沉默信息调节因子6既能通过多种通路影响细胞焦亡,还能影响巨噬细胞M1极化、活性氧的生成以及细胞焦亡相关因子消皮素D的裂解以抑制细胞焦亡;⑥过表达沉默信息调节因子7可抑制细胞焦亡;⑦沉默信息调节因子2与其他家族成员不同,其被敲降后才可抑制细胞焦亡,但报道较少,需要更为深入与全面的研究。

关键词： 骨关节炎   内质网应激   WGCNA   机器学习   人滑膜细胞   免疫浸润分析   生物标志物   实验验证   细胞实验   差异基因  

摘要： 背景:内质网应激和骨关节炎的发生、发展密切相关,但其关键基因及调控机制尚不明确。目的:基于生物信息学筛选骨关节炎内质网应激关键基因,并加以细胞模型实验验证,以期从内质网应激角度为防治骨关节炎提供新策略。方法:从GEO数据库下载骨关节炎相关数据集GSE55235,运用生物信息学分析方法筛选获取骨关节炎滑膜差异基因,与GeneCard数据库中内质网应激基因取交集得到骨关节炎内质网应激差异基因,随后对其进行GO/KEGG富集分析;构建蛋白-蛋白互作网络;在外部数据集验证其疾病预测效能。构建人原代关节滑膜成纤维细胞骨关节炎模型,对照组不作处理,实验组接受20 ng/mL脂多糖模拟骨关节炎滑膜细胞造模后进行实时荧光定量PCR实验验证各差异基因表达水平并进行免疫浸润分析。结果与结论:①共获得骨关节炎内质网应激关键基因27个。②GO富集分析结果显示其主要富集在胶原蛋白代谢过程、趋化因子、抗原结合及免疫球蛋白受体结合等过程中。③KEGG分析表明其主要富集在类风湿性关节炎、松弛肽信号通路等通路中。④构建蛋白-蛋白互作网络,使用Cytoscape软件中Degree算法筛选得分最高的5个基因,包括基质金属蛋白酶1、肿瘤坏死因子配体超家族成员11(tumor necrosis factor ligand superfamily member 11,TNFSF11)、基质金属蛋白酶9、Ⅰ型胶原α1重组蛋白(collagen type Ⅰ alpha 1,COL1A1)和趋化因子配体12(chemokine C-X-C motif ligand 12,CXCL12)。⑤免疫浸润分析结果显示,免疫细胞主要分布于M2型巨噬细胞,CXCL12与静息的肥大细胞呈显著正相关(r=0.70,P<0.001),与静息的记忆CD4^(+)T细胞呈显著负相关(r=-0.72,P<0.001);基质金属蛋白酶9与M0巨噬细胞呈显著正相关(r=0.94,P<0.001);COL1A1与静息的NK细胞(r=0.77,P<0.001)和M0巨噬细胞(r=0.76,P<0.001)呈显著正相关。⑥外部数据集GSE77298和GSE1919中进行受试者工作曲线分析表明5个关键基因具有较好的疾病预测价值。⑦体外细胞实验证明,骨关节炎细胞模型组中基质金属蛋白酶1,TNFSF11,CXCL12及基质金属蛋白酶9表达水平相比于对照组有显著差异。⑧结果显示,骨关节炎内质网应激关键基因基质金属蛋白酶1,TNFSF11,CXCL12及基质金属蛋白酶9通过胶原蛋白降解和免疫调控等环节影响着骨关节炎的发生发展,有望为骨关节炎的靶向治疗提供新见解。

关键词： 激素性股骨头坏死   衰老   WGCNA分析   机器学习   免疫浸润分析   实验验证  

摘要： 背景:激素性股骨头坏死与衰老紧密相连,但调控靶点和机制尚不明确。通过生物信息学联合机器学习分析并加以实验验证,确定细胞衰老介导激素性股骨头坏死发生发展的关键基因,将为激素性股骨头坏死的防治提供新思路。目的:使用生物信息学分析筛选激素性股骨头坏死的衰老核心基因并进行实验验证,以探讨其作用机制。方法:从GEO数据库的GPL15207平台获取了GSE123568数据集,其中包含了30例激素性股骨头坏死患者与10名健康对照的外周血清样本基因表达谱;从CellAge数据库获取了279个细胞衰老相关基因的数据。对激素性股骨头坏死基因谱进行差异分析及加权基因共表达网络(WGCNA)分析,两者与衰老相关基因取交集再取并集得到激素性股骨头坏死衰老潜在基因,并进行GO和KEGG富集分析。机器学习方法筛出枢纽基因,构建Nomogram模型,进行共识聚类及免疫浸润分析。最后收集临床股骨头样本通过qPCR及Westernblot检测方法进行验证。结果与结论:①共获得41个潜在基因,主要富集在衰老及氧化应激反应等生物过程,以及FoxO及肿瘤坏死因子信号通路中。②机器学习鉴定后得到枢纽基因过氧化氢酶、结缔组织生长因子、叉头框蛋白O3、胰岛素受体底物2和丝裂原活化蛋白激酶激酶11,Nomogram模型预测能力良好。③共识聚类分析将患者分为a,b和c共3组,过氧化氢酶、叉头框蛋白O3、胰岛素受体底物2和丝裂原活化蛋白激酶激酶11在3个分子亚型之间表达存在差异(P<0.05),免疫浸润结果显示活化CD4+T细胞、活化CD8+T细胞、嗜酸性粒细胞等免疫细胞的丰度在3个分子亚类中存在差异(P<0.05)。④qPCR和Western blot结果显示,激素性股骨头坏死组过氧化氢酶、结缔组织生长因子、叉头框蛋白O3和丝裂原活化蛋白激酶激酶11比对照组表达降低(P<0.05),胰岛素受体底物2的表达升高(P<0.05)。⑤上述结果证实,通过结合生物信息学与机器学习深入分析,并进一步实验验证,最终确定了5个激素性股骨头坏死衰老相关枢纽基因,分别是过氧化氢酶、结缔组织生长因子、叉头框蛋白O3、胰岛素受体底物2及丝裂原活化蛋白激酶激酶11,这些基因可能通过调控细胞衰老过程为未来激素性股骨头坏死的预防和治疗提供潜在的分子靶点。