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ISBN: (纸本)9787300312385

关键词： 医学统计学   文献导向   混合式教学   效果评价  

摘要： 【目的】探讨基于文献导向的混合式教学模式在临床医学专业本科生医学统计学教学中的效果及满意度。【方法】以同济大学医学院2018级共83名临床医学本科生为研究对象，开展基于文献导向自主学习（reference-induced self-education,RISE）的混合式教学模式在医学统计学课程中的效果评价；通过自行设计学生问卷调查学生满意度。【结果】与传统教学组相比，RISE混合式教学组学生总评成绩优良率和及格率分别为53.7%和96.3%；学生评价总体授课效果的满意率为83.3%。RISE混合式教学在激发学习兴趣（满意率90.7%,P=0.034）和科研能力培养（满意率96.3%,P=0.048）方面满意度更高。【结论】RISE混合式教学通过文献引导、线上线下相结合，将统计学知识与临床科研问题有机地结合起来，在医学统计学课程教学中应用效果良好，有助于激发学习兴趣和培养科研创新能力。

关键词： 医学研究统计学规范   医学文献   医学生   知晓   需求  

摘要： 背景:统计学在科学数据的产生、分析及推断方面发挥关键作用,是保证医学研究结果重现性和可重复性的关键前提之一。目前,已发表文献中统计学方法的应用呈上升趋势,然而统计学设计、分析及报告不恰当的现象仍较为普遍。既往研究显示医学期刊文献统计学质量存在较多问题,文献作者对统计学相关知识掌握情况不容乐观。针对上述问题,鉴于国内外尤其是国内的相关情况尚不明确,本研究拟分别从期刊文献和作者角度出发,首先对综合类医学期刊文献统计学质量及其可能相关因素进行初步调查,其次对期刊作者（主要是未来主力军的医学生）的统计学相关规范知晓、态度及需求情况进行分析,旨在从不同视角反映国内医学综合类期刊文献的统计学质量,并探讨可能提升其质量的因素和途径,为未来提升医学研究统计学质量提供实证参考依据。 目的:（1）对综合类医学期刊文献中常见统计学报告质量及相关因素进行初步调查。（2）对医学院校学生中医学研究统计学规范知晓、态度及需求情况及相关因素进行初步探索。 方法:（1）选择综合医药卫生类2种Medline和6种中文核心期刊2010年和2020年发表原始研究文献480篇。基于文献中统计分析和方法学（Statistical Analyses and Methods in the Published Literature,SAMPL）指南和相关规范建立调查表,对文献的统计学质量进行调查。中文医学文献中常见统计学报告情况相关因素分析采用多水平统计模型。（2）设计医学生中统计学设计、分析及报告规范的知晓、态度及需求的电子调查问卷,主要包括调查对象基本信息,对于统计学相关规范指南的知晓情况,对于相关规范的态度,对于相关规范的学习需求。通过数所医学院校学生QQ群、微信群传播电子调查问卷二维码及链接。医学生中医学研究统计学相关规范的知晓、态度及需求情况相关因素分析采用有序logistic回归。医学生中统计学规范知晓、态度及需求的路径分析采用结构方程模型,并且对不同学历、性别、地域、是否为“双一流”高校及学科与曾发表文章学生群体进行多群组分析。 结果:（1）医学文献统计学质量的总分值为（40.0±8.6）%。统计设计部分分值为（43.2±6.8）%,统计描述部分分值为（67.0±24.3）%,t检验部分分值为（23.6±17.5）%,方差分析部分分值为（26.8±17.2）%,χ2检验部分分值为（24.2±13.7）%,秩和检验部分分值为（45.5±18.4）%,相关分析部分分值为（41.9±13.2）%,回归分析部分分值为（40.5±14.8）%,生存分析部分分值为（45.6±14.9）%。相关因素分析显示,Medline期刊、以人为研究对象、2020年发表文献总分值较高。（2）医学生中统计学规范知晓、态度及需求问卷的内部一致性及结构效度良好。本研究有效问卷率为96.3%。共纳入339名调查对象,平均年龄为（23.4±4.0）岁。对于统计学规范,18.0%（61/339）医学生较为了解,51.0%（173/399）一般了解,31.0%（105/339）不太了解。49.9%（169/339）、54.0%（182/339）、53.0%（181/339）医学生较为认同适宜的医学研究统计学设计、正确的医学统计学分析及规范的医学统计学报告有利于增强研究质量/透明度。46.9%（159/339）、49.0%（166/339）、48.4%（164/339）医学生有较高的系统学习统计学设计、分析及报告规范的需求。知晓情况相关因素分析结果显示,男性、研究生、口腔医学、公共卫生专业医学生及曾发表文章医学生得分较高,中部机构医学生得分较低。态度情况的相关因素分析结果显示,研究生得分较高。需求部分的相关因素分析结果显示,研究生、口腔医学、公共卫生专业医学生得分较高,西部机构医学生得分较低。态度、知晓均与医学生统计学规范的学习需求有关联。结构方程模型多群组分析验证模型适用于不同学历、性别、地域、是否为“双一流”高校及学科、是否曾发表文章人群。学历、是否为“双一流”高校及学科均对知晓→需求具有调节效应。 结论:8本期刊中医学研究统计报告不规范情况普遍存在。2020年、Medline和以人为研究对象的文献质量较好。医学生对医学研究统计学规范知晓有提升空间,亦有学习需求。可针对不同期刊、医学生群体推广统计学规范。

关键词： 单细胞转录组测序   缺失值插补   批次效应   统计学   深度学习   博弈论  

摘要： 近年来,随着单细胞测序技术的迅速发展,单细胞转录组测序(single-cellRNA sequencing,scRNA-seq)正在成为当前基因组学研究中的一项关键技术,与传统测序方法相比,其突出优势是可以获取单个细胞的遗传信息,从细胞图谱角度探索细胞特异性以及细胞间的差异,从而探索细胞间的协同运作方式,研究组织异质性问题。相比批量转录组测序(bulkRNA-seq)数据,scRNA-seq数据中包含更多的零值,这些零中夹杂着大量被称为缺失值事件(dropout events)的技术噪声导致的假阴性零值。在scRNA-seq数据,过多的缺失值会扭曲细胞的基因表达谱的结构和特征水平,对下游分析的结果会带来很大的偏差。因此,针对高稀疏的scRNA-seq数据的去噪问题,我们提出一种轻度的缺失值插补方法AGImpute,该方法为了保留更多的数据原生物信息,只对极少的缺失值进行插补。AGImpute包括统计模块和深度学习模块两个部分;在统计模块中,构建混合嵌入的概率统计模型计算基因的缺失值概率,并提出一种动态阈值估算算法估算每个细胞基因表达中缺失值个数的阈值,结合缺失值概率和缺失值个数实现缺失值定位;深度学习模块结合了自动编码器和生成对抗网络对缺失值进行模拟生成,最终将两个模块的输出进行结合实现插补。识别并插补的方法可以降低插补量并保留更多原有的生物信息。使用模拟和真实的scRNA-seq数据集进行实验,将所提出的AGImpute方法与SAVER、sc Impute、MAGIC、ENHANCE、VIPER、sc IGANs和sc LRTC七种方法进行下游分析实验比较。实验结果证明AGImpute在保留更多原数据信息的情况下,获得更好的scRNA-seq数据的下游分析实验性能,并且具有更强的可解释性。针对AGImpute方法只考虑了scRNA-seq数据的缺失值问题而忽视了数据本身存在的批次效应(batch effect)问题。基于同类型细胞的scRNA-seq数据基因表达总量一致性的假设,使用结合皮尔逊相似性和一致性假设作为收益函数的随机动态非完全信息博弈论算法来校正批次效应问题,提出解决缺失值问题的同时解决批次效应问题的插补方法(sc DIIG)。该方法使用了随机抽取参与者,并通过相同类型细胞内的博弈和进化达到纳什均衡的方式,使sc DIIG在进行缺失值插补的同时校正批次效应。使用相同的真实scRNA-seq数据,将sc DIIG与上述AGImpute、SAVER、sc Impute、MAGIC、ENHANCE、VIPER、sc IGANs和sc LRTC八种缺失值插补方法的实验结果进行对比分析。实验结果表明sc DIIG方法在解决scRNA-seq数据缺失值问题的同时解决了批次效应问题,在不抛弃过多原生物信息的情况下,在下游分析实验中取得优于其他八种方法的结果。综上所述,本文针对scRNA-seq平台和数据的特点、缺失值插补问题和批次效应问题进行了探讨分析,设计了两种有效的缺失值插补方法,为scRNA-seq分析的上游预处理方法研究提供了两种不一样的解决思路和应用工具。

ISBN: (纸本)9787300311333

关键词： 新文科   建构主义   研究性   混合式   统计学  

摘要： 本研究顺应新文科建设的要求，以培养创新性人才为目标，针对传统教学中重教轻学、忽视学生自主探究能力培养的问题，探讨了基于新型建构主义理论开展统计学研究性教学的方法：坚持教师主导、学生为主体的教育思想，从教师科研项目中提炼案例，在精讲模块知识后创设研究情境，引导学生结合案例发现、分析并解决问题，并结合细致、规范的评价，促进学生发散思维、批判思维和创新思维的养成。

摘要： 按照GB/T 3358.1～3-2009《统计学术语》的有关规定,统计学符号一律采用斜体排印。常用:（1）样本的算术平均数用英文小写x或mean （中位数英文叙述中用M或median）;（2）标准差用英文小写s或大写SD（限英文文献中）;（3）标准误用英文小写sx或大写SE（限英文文献中）;（4） t检验用英文小写t;（5） F检验用英文大写F;（6）卡方检验用希文小写χ2;（7）相关系数用英文小写r;

关键词： 统计学  

ISBN: (纸本)9787030717672

摘要： 本书主要包括描述统计 (数据的收集、数据整理与显示、数据分布特征的测度)、推断统计 (抽样与参数估计、假设检验、方差分析)、社会经济中常用的统计方法与技术 (列联表、相关与回归分析、时间序列分析与预测、统计指数、统计综合评价) 等三部分内容。

ISBN: (纸本)9787561589274

摘要： 按照GB/T 3358.1～3-2009《统计学术语》的有关规定,统计学符号一律采用斜体排印。常用:（1）样本的算术平均数用英文小写x或mean （中位数英文叙述中用M或median）;（2）标准差用英文小写s或大写SD（限英文文献中）;（3）标准误用英文小写sx或大写SE（限英文文献中）;（4） t检验用英文小写t;（5） F检验用英文大写F;（6）卡方检验用希文小写χ2;（7）相关系数用英文小写r;