关键词:
前列腺癌
昼夜节律基因
癌症预后
生物钟
前列腺癌
昼夜节律基因
miR-6883-5p
AR-V7
恩杂鲁胺
摘要:
前列腺癌(Prostate cancer,PCa)是男性最常见的恶性肿瘤之一,目前前列腺癌已经成为男性泌尿系统恶性肿瘤中发病率排名第一的癌症。根据2020年全球癌症统计数据,前列腺癌占所有男性癌症的约13.6%,是男性癌症死亡的第四大原因,占男性癌症死亡的约7.1%。在美国,根据美国癌症协会(American Cancer Society,ACS)的数据,估计2023年将有约288,300名男性被诊断出前列腺癌,约34,700名男性死于前列腺癌。
昼夜节律基因是控制人体昼夜节律的基因,以适应地球的自转周期。这些基因编码了蛋白质,它们构成了生物钟的核心,这个核心负责调节一系列生理过程,如睡眠—觉醒周期、体温和代谢率等。目前已经发现了一系列昼夜节律基因,包括 CLOCK、BMAL1、PER1、PER2、PER3、CRY1、CRY2、CSNK1D、CSNK1E、NR1D1、RORA、NR1D2和RORB等。这些基因通常以负反馈回路的形式调控相关基因的表达,它们编码的蛋白质能够抑制它们自己的表达,从而形成周期性的表达模式。研究表明,生物钟的紊乱与多种疾病的发生有关,包括肥胖、糖尿病、心血管疾病、精神疾病以及癌症等。
昼夜节律对前列腺癌有一定的影响。研究表明,昼夜节律紊乱可能会增加前列腺癌的风险,如夜班工作可能会打乱人体的生物节律,从而增加前列腺癌的发生率。前列腺细胞的昼夜节律基因与癌症的发生和发展密切相关,如CLOCK和BMAL1基因的表达在前列腺癌组织中明显下降。这可能会导致前列腺细胞的生物节律失调,从而促进肿瘤的生长和扩散。此外,昼夜节律基因的突变也与前列腺癌的风险增加有关,如PER1和PER2基因的突变被认为是前列腺癌的潜在风险因素,这些基因的突变可能会导致昼夜节律紊乱、DNA损伤修复异常以及细胞周期的改变。
最近有研究表明,miRNA与昼夜节律之间存在着复杂的相互作用关系。miRNA是一类长度约为22个核苷酸的非编码RNA,其作用机制复杂,目前研究比较多的是通过与靶基因mRNA的3' UTR结合,以调控目标基因的表达。昼夜节律基因的表达和miRNA的表达存在周期性的变化,它们之间可能存在着相互调节的关系。研究发现PER2能够抑制miR-183的表达,从而影响视网膜色素上皮细胞的功能;而一些miRNA也能够影响昼夜节律基因的表达,如miR-132和miR-212能够调控CLOCK基因的表达,从而影响昼夜节律的调节。对这种相互作用关系的深入研究有助于更好地理解生物节律和调节机制的复杂性,并有可能为预防和治疗与生物钟有关的疾病提供新的思路和策略。
miRNA与前列腺癌的关系已经得到了广泛的研究,miRNA在前列腺癌的发生发展、诊断、治疗以及预后评估中都具有重要作用。深入研究miRNA与前列腺癌的关系,将有助于更好地理解前列腺癌的分子机制。
目前对昼夜节律基因与前列腺癌发生发展的关系还需要进一步的研究。虽然已经发现了一些相关的基因和生物发展过程,但是具体的调节机制和相互作用关系还需要更深入地探究。对于预防和治疗前列腺癌,深入了解这种关系对于制定更有效的预防和治疗策略也具有潜在的价值。
第一部分:核心昼夜节律基因的表达水平与前列腺癌预后的关系
目的:通过生物信息学技术挖掘公共数据库以试图进一步阐明核心昼夜节律基因的表达水平在前列腺癌预后预测中的重要作用。
方法:(1)从癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中收集了 605例前列腺癌患者,分别对每个昼夜节律核心基因进行生存分析。(2)用Cox回归分析考察核心昼夜节律基因的预后能力,提取独立的预后特征,建立基于核心昼夜节律基因的风险预后评分模型。(3)探索TCGA训练集和独立GEO数据集中风险评分模型的预测能力。(4)评估了核心昼夜节律基因的风险预后评分模型与临床病理参数、生物学过程和信号通路之间的关系。
结果:(1)核心昼夜节律基因的表达水平与前列腺癌患者年龄、肿瘤分期、淋巴结转移、无病生存期(DFS)、无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)广泛相关。(2)9个核心昼夜节律基因,包括CSNK1D、BTRC、CLOCK、CSNK1E、FBXL3、PRKAA2、DBP、NR1D2和RORB,被确定为前列腺癌的重要预后因素,并用于构建基于生物钟的风险评分模型。(3)对于DFS,3年或5年受试者特征曲线下的面积在0.728-0.821之间,具有更好的预测能力。(4)与T3-4N1期相比,T2N0期前列腺癌患者可能更受益于基于核心节律基因的风险评分模型。(5)此外,较高的风险评分与较短的DFS(p<0.0001),早期进展(p<0.0001),以及更高的前列腺