关键词:
手足口病
空间自相关
空间聚集性
全局Moran’sⅠ系数
局部Moran散点图
空间关联局域指标显著水平图
CV-A5
基因型
起源进化
基因重组
氨基酸变异
摘要:
研究背景手足口病(Hand-foot-mouthDisease,HFMD)是一种由多种人肠道病毒(Enterovirus,EV)引起的儿童常见的全球性急性传染性疾病,主要发生在5岁以下儿童,其中少数患者会出现严重的并发症,如脑炎、肺水肿、肺出血、心肺功能衰竭等,个别重症患者病情进展迅速,甚至引起死亡,因此,是我国面临的重要公共卫生问题之一。自2008年纳入法定报告传染病管理系统以来,HFMD发病率、重症率和死亡率在法定报告传染病排名居高不下,如2010~2017年间我国HFMD发病率持续居于我国法定传染病首位。自2008年以来,我国已对HFMD进行了多层次的流行病学描述性分析,空间统计学中的空间自相关分析方法作为传统统计方法的补充,可利用空间数据和属性探索研究疾病等变量的空间分布特征。目前,我国已开展许多关于HFMD的空间分析,包括不同级别的空间统计分析,但仍鲜有于HFMD相关全国范围和较长时间跨度的空间聚集性研究,本文采用空间自相关分析对2008~2017年中国大陆HFMD监测数据进行分析,阐明我国HFMD空间分布特征,为HFMD防控提供理论及科学依据。研究目的1.探讨中国大陆2008~2017年手足口病空间聚集性及其演化过程;2.利用空间自相关分析技术研究2008年~2017年中国大陆手足口病报告发病率、重症率和报告死亡率在各省(自治区、直辖市)的空间分布模式,确定HFMD发病热点区域,为制定手足口病防治策略、确定重点控制区域、合理分配医疗资源(如疫苗投放)提供科学数据。研究结果1.自2009年起,手足口病报告发病率隔年增高,在2014年达到阶段性高点,手足口病重症率和死亡率呈总体下降趋势。2.全局Moran’s Ⅰ系数结果显示:手足口病发病率在2008~2017年、重症率在2008~2009年、死亡率在2010年、2012年、2015~2017年呈聚集性分布;3.局部自相关分析显示:手足口病发病率持续或多数时间处于第1象限(高高)的地区为海南、广东、广西、湖南、浙江、福建、上海;重症率处于第1象限(高高)或第4象限(高低)的是海南、广东、云南、贵州、湖南、河南;死亡率处于第1象限(高高)的是海南、广东、重庆、贵州、湖南;三种率在第3象限(低低)具有相似性,以西南的四川、西藏,西北(不包括陕西)、东北地区为主。研究结论1.2008~2017年中国大陆地区手足口病报告发病率、重症率、死亡率全局空间分布模式不完全相同,局部自相关提示,海南、广东、湖南三种率均处于高高聚集区,贵州手足口病重症率和死亡率处于高高聚集区,以上省份是HFMD防控的重中之重。2.作为传统统计分析的补充,空间统计分析有助于进一步了解手足口病流行规律和指导防控工作,稳定的空间分布模式仍有待后续数据的积累和追踪。研宄背景HFMD是全球性传染病,尤其在中国疾病负担较重。虽然肠道病毒A组71型(Enteroviruses A71,EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)是全球HFMD最常见的病原体,但近几年我国HFMD实验室网络监测系统显示出现其他EV占比升高的现象,甚至在部分地区取代EV_A71和CV_A16成为当地的优势病原,其中柯萨奇病毒A组5型(Coxsackievirus A5,CV-A5)逐渐引起关注。目前,CVA5虽未在中国大陆引起大规模的HFMD暴发流行,但国内外均有CV-A5引起HFMD/HA暴发的相关报道,且研究发现CV-A5与柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)、柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CV-A4)等引起HFMD大暴发的EV发生重组,这对CV-A5及其他EV毒力增强有着一定意义。目前,CV-A5相关的宏观流行病学和分子流行性学各方面的研究仍比较欠缺,多数CV-A5毒株的研究主要涉及在局部地区/省份HFMD病原谱研宄,CV-A5基因特征等病原学、进化分析研宄受限。故本研宄基于日渐完善的中国疾病预防控制中心(CDC)病毒病预防控制所OVDC)国家脊髓灰质炎&麻疹实验室毒株及标本数据库,对2008~2017年中国大陆CV-A5毒株进行较全面、系统的流行病学、基因特征、起源进化分析,为我国HFMD防控以及研制多价HFMD疫苗提供科学数据。研宄目的1.初步阐述我国大陆2008~2017年CV-A5相关HFMD病例流行规律;2.完善CV-A5基因分型、基因重组、分子进化等基因特征和遗传进化规律;3.建立CV-A5YP1编码区基因序列和全基因组序列RT-PCR、rPCR测定方法;4.添补我国HFMD病原学CV-A5专题研宄空白,为HFMD防控和研制多价疫苗提供科学数据。研宄方法基于中国CDC传染病报告信息管理系统,整理中国大陆各省(自治区