关键词： 空气质量   手足口病   多尺度地理加权回归模型   混合多尺度地理加权回归模型   空间异质性   尺度效应  

摘要： 多尺度地理加权回归(MGWR)模型是一种较新的空间分析方法,通过对回归关系在不同空间尺度上运行,能够准确地捕捉解释变量在不同空间尺度上对响应变量影响的空间异质性.因此得到越来越多的研究与应用.本文主要从以下两方面开展研究:第一,基于空间自相关性以及MGWR模型的基本理论,以2017年黄河流域城市空气质量监测数据为研究对象,首先利用空间自相关分析得出黄河流域上游大部分地区的空气质量存在”低-低聚集”空间分布特征,而黄河流域中下游许多地区的空气质量为”高-高”聚集区.其次给出了空气质量的时空变化特征,然后利用多尺度地理加权回归(MGWR)模型分析各因素在不同尺度下对空气质量作用的空间异质性.结果显示:(1)2017年黄河流域中下游大部分地区的空气质量指数(AQI)处于轻度污染水平,季度的AQI呈冬高夏低的特征.月度的AQI呈“U”型分布,其拐点出现在8月份;(2)第二产业比重、城镇人口比例、总人口数、降雨量和温度对空气质量的影响显著,其中,第二产业比重和城镇人口比例全局影响空气质量,总人口数在中等异质水平下影响空气质量,降雨量和温度在较高异质水平下影响空气质量;(3)第二产业比重、城镇人口比例和总人口数对空气质量的影响为正向,而降雨量和温度对空气质量的影响为负向,其中,总人口数对黄河中游地区影响较大,降雨量对黄河上游地区影响较大,温度对黄河中下游地区影响较大.第二,为弥补混合GWR模型所有变系数具有单一带宽的不足,构建了混合多尺度地理加权回归模型,并基于2012年内蒙古自治区102个旗县手足口病数据,利用bootstrap法识别模型中的常系数、变系数,结果表明月均温度(AT)、月均相对湿度(AH)、月均气压(AP)为局部变量,而月均风速(AW)为全局变量,累积降雨量(AR)为无关变量.进一步构建混合多尺度地理加权回归模型,探究气象因素在不同尺度下对手足口病(HFMD)发病率的空间异质性.结果表明,AT对内蒙古所有地区的HFMD发病率呈正相关关系.AH对内蒙古大部分地区的HFMD发病率存在正相关关系.AP对内蒙古地区的HFMD发病率既存在正相关关系,又存在负相关关系.

关键词： 柯萨奇病毒A组6型   手足口病   构象表位   生物信息学   分子进化  

摘要： 目的:1.手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)是由多种人肠道病毒引起的儿童常见传染病。柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)是引起手足口病的重要病原体之一。利用本实验室发展的人肠道病毒构象表位预测算法,对CV-A6的构象表位进行系统性地预测,并与柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)的构象表位进行对比,探索肠道病毒构象表位的分布规律。2.利用本地Nextstrain平台重构CV-A6进化树,探索构象表位在病毒分支进化过程中的作用,分析CV-A6的进化关系及其在中国的分布和时空传播规律。方法:1.从PDB和NCBI数据库中分别下载CV-A6(A颗粒)和CV-A10(A颗粒和成熟颗粒)结构蛋白的三维结构文件和氨基酸序列。利用MEGA X软件的MUSCLE工具和ESPript 3.0在线工具进行二级结构注释。利用Py Mo L软件绘制病毒衣壳表面结构图。利用实验室发展的人肠道病毒构象表位预测算法进行构象表位预测。通过查阅文献获得实验鉴定的构象表位,利用RIVEM绘制衣壳足迹图来评估预测准确性,同时分析抗体与构象表位之间的相互作用关系。2.从VIPR病毒数据库和NCBI Nucleotide数据库中检索并下载CV-A6的全基因组序列和结构蛋白VP1序列(915nt),并导入本地化部署的Nextstrain平台,搭建CVA6本地基因组和VP1数据库,利用Nextstrain平台的augur生物信息工具包分别构建CV-A6全基因组和VP1基于时间尺度的系统发育树。分析构象表位在CV-A6分支进化过程中的作用;分析CV-A6在中国的进化关系和时空传播规律。结果:***-A6的构象表位在病毒衣壳表面呈现site 1、site 2和site 3三簇分布。Site 1位于峡谷北侧(north rim),包括VP1的BC环、EF环和HI环。Site 2位于puff区,主要包括VP2的EF环、VP1的GH环和C-端的部分残基。Site 3由两部分组成,一部分位于knob区,包括VP3的N-端上游和VP1的C-端部分残基组成,另一部分靠近三倍轴,由VP2和VP3的HI环构成。中和抗体1D5结合的构象表位以及线性表位P42、P59与site 1、site 2和site 3高度重叠,说明预测算法具有较高的准确性。***-A6(A颗粒)和CV-A10(A颗粒)的构象表位分布高度一致,这种一致性超过了CV-A10两种颗粒状态(A颗粒和成熟颗粒)的一致性。但是,二者共享的构象表位中,保守的残基较少,提示构象表位残基的差异可能造成了CV-A6和CV-A10之间的血清型差异。***-A6的系统发育树显示,除了原株Gdula,自1992年至2019年,全球CV-A6可划分为B1、B2、C1、C2、D1、D2和D3(包括D3a和D3b)七个分支。其中,D3分支为CV-A6流行的优势分支。VP1的S194T(GH环)和F261L(C-端)是D分支形成的关键氨基酸突变;VP2的V179I(EF环)是D2分支形成的关键氨基酸突变;VP2的I132V(EF环)和VP3的V49I(N-端)是D3分支形成的关键氨基酸突变。4.2013年前,中国主要流行CV-A6的D2分支和D3b分支;2013年之后,D3a分支成为中国流行的绝对优势分支。CV-A6在中国七大地理区域的传播路线图显示,CVA6总体上是从中国的华南、华东地区逐渐向华中、西南和华北等地区传播,然后在各地区间交叉传播,引发多地区的疫情。结论:***-A6的构象表位与CV-A10一样,在衣壳表面呈site 1、site 2和site 3三簇分布。构象表位上的残基突变在病毒分支进化过程中具有重要作用。***-A6的优势流行分支主要为D3,2013年之后中国主要流行分支为D3a。CVA6在中国的传播路线总体上是由南向北传播。

关键词： 小儿手足口病   热毒宁   安全性  

摘要： 目的 对热毒宁注射液在小儿手足口病治疗中的临床应用效果进行研究.方法 回顾性分析我院收治的220例小儿手足口病患儿的临床资料,按照治疗方式将其分为A组和B组,每组110例.两组患者均使用基础药物(退热药、开喉剑喷雾剂)进行对症治疗,A组在此基础上增加热毒宁注射液,B组在此基础上增加利巴韦林.对比两组的临床疗效.结果 A组治疗总有效率显著高于B组,A组退热时间,皮疹症状消失时间与B组相比均明显较短,均P<0.05,组间比较差异显著.结论 热毒宁注射液应用于小儿手足口病的治疗中,疗效好,安全性高,值得应用.

关键词： NLRP3炎症小体   手足口病   重症化   免疫  

摘要： 目的本研究旨在探讨NLRP3炎症小体即核苷酸结合寡聚化结构域样受体3（Nucleotide-binding oligomerzation domain-like receptors 3 inflammasome,NLRP3inflammasome）是否参与手足口病（Hand foot and mouth disease,HFMD）的病情进展,明确NLRP3炎症小体是否可作为HFMD重症化的临床预警指标,同时进一步研究NLRP3水平与HFMD患儿免疫功能的关联性。方法选取西安市儿童医院2018年10月至2020年10月住院的0-5岁HFMD患儿共148例为病例组,其中普通型99例,重症49例。并选择同期0-5岁健康儿童90例为对照组。通过ABC-ELISA检测比较病例组及对照组两组间NLRP3、IL-18、IL-1β的水平差异有无统计学意义,以及普通组、重症组及对照组三组间NLRP3、IL-18、IL-1β水平差异有无统计学意义。进一步比较不同时期病例组患儿NLRP3、IL-18、IL-1β水平的变化趋势。比较HFMD病例组NLRP3水平分别与IL-18及IL-1β水平的相关性。多因素分析比较HFMD重症化的影响因素,绘制ROC曲线求得NLRP3水平的最佳界值。进一步分析比较NLRP3水平与外周血淋巴细胞亚群水平的相关性。结果（1）HFMD病例组较对照组NLRP3、IL-1β及IL-18水平明显升高,差异均有统计学意义（P<0.05）。（2）HFMD普通组较对照组NLRP3、IL-1β、IL-18水平高;HFMD重症组较普通组NLRP3、IL-1β、IL-18水平高,差异均有统计学意义（P均<0.05）。HFMD恢复期NLRP3、IL-1β、IL-18水平较急性期明显降低,差异均有统计学意义（P均<0.05）。（3）HFMD病例组NLRP3水平分别与IL-1β水平及IL-18水平正相关,差异均有统计学意义（P均<0.05）。（4）多因素Logistic回归分析提示热程、血糖>8.3 mmol/L、NLRP3水平均为HFMD重症化的危险因素（P均<0.05）。绘制NLRP3水平受试者工作特征曲线（Receiver operating characteristic curve,ROC）求得NLRP3最佳临界值为29.99ng/ml,对应的灵敏度为81.6%,特异度为59.6%。（5）与普通组相比,重症组患儿T细胞（CD3+,CD4+,CD8+）及NK细胞（CD16+CD56+）水平降低,B细胞（CD19+）水平升高,差异有统计学意义（P均<0.05）。（6）Spearman相关性分析表明NLRP3水平与CD3+水平呈负相关,差异有统计学意义（P<0.05）。而NLRP3水平与CD19+水平、NLRP3水平与CD16+CD56+水平无明显相关性（P均>0.05）。结论（1）NLRP3炎症小体与HFMD重症化相关,HFMD病情进展与NLRP3、IL-1β及IL-18水平正相关,NLRP3水平>29.99ng/ml具有一定预测价值,可能作为HFMD重症化的预警指标。（2）NLRP3水平与HFMD患儿的T细胞免疫功能负相关,表明NLRP3水平可能通过T细胞免疫功能影响HFMD病情进展。

关键词： 手足口病   组合模型   ARIMA   XGBoost   小波变换   遗传算法   粒子群优化算法  

摘要： 在流行病学领域,传染病的发病情况往往存在以年为单位的周期性以及季节性的高峰特征。而现代传染病的控制策略中,最根本的做法是提高患者的发现率,进而有效遏制传染,因此精准地预测传染病发病数量具备重要的意义。手足口病作为一种常见于婴幼儿的传染病,具有传染病的典型特征,因此本文以手足口病作为样例来构建流行病学特征分析及预测系统。现有的手足口病分析方法有传统统计学分析模型和新型机器学习模型,以及基于这些单模型的组合模型,组合模型的预测效果好于单一模型但提升有限。本研究首先对机器学习领域中的集成学习模型XGBoost进行优化。针对普通XGBoost预测系统调参难的缺陷,引入粒子群优化算法PSO和遗传算法GA构建了基于PSO-GA-XGBoost的传染病预测系统。遗传算法基于优胜劣汰思想对XGBoost的模型进行参数寻优,但它存在着容易陷入局部极小的缺点,因此引入粒子群优化算法来克服局部极小,发挥更好的搜索能力,从而优化参数组合,达到更好的模型预测精度。通过实验验证了PSO-GA-XGBoost相比于普通XGBoost模型的优越性。手足口病序列往往混合着趋势部分和非线性部分,可能造成了PGXGBoost即PSO-GA-XGBoost在建模过程中特征提取的不完备。而小波变换可以一定程度上分离开趋势部分和非线性部分,因此引入小波变换来对手足口病序列进行分解。同时使用统计学预测方法ARIMA处理经小波变换分解后的趋势序列,PGXGBoost用于处理非线性序列,ARIMA和PGXGBoost分别擅长于处理趋势和非线性部分。综上,本研究构建了一个基于小波变换的ARIMA-PGXGBoost传染病预测系统,通过实验验证了它具有非常优良的预测性能,为制定防治举措和策略提供了良好的理论支撑,对于传染病的特征分析及预测具有很好的应用前景。

关键词： 手足口病   病原谱   柯萨奇病毒A组6型   VP1基因   基因特征  

摘要： 目的　　了解2016-2019年陕西省渭南市手足口病的流行病学特征和病原谱，以及优势毒株基因特征,为该病在渭南地区的防控提供科学依据。　　方法　　1.疫情分析：病例、标本信息收集和统计，用描述性流行病学方法对2016-2019年渭南市手足口病的流性特征进行统计分析。　　2.基因分型：对收集到的2016-2019年渭南市中心医院及妇幼保健院HFMD患儿标本（包括肛拭子、咽拭子、疱疹液）进行核酸提取后运用实时定量逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）方法进行基因分型。　　3.病毒分离：鉴定为CA6型阳性的标本用RD细胞进行病毒分离，盲传三代。　　***6VPl区扩增和测序：采用传统RT-PCR方法，将鉴定为CA6型阳性的核酸标本进行扩增，反应体系、扩增参数和引物序列按照标准选用，扩增阳性产物纯化后进行双向测序。　　5.序列拼接和进化分析：从GenBank下载相关CA6型VP1区的核苷酸序列，利用MEGA7.0软件与本研究测序成功的序列进行比对，应用邻接法（N-J法）构建系统发育树。　　结果　　1.2016-2019年渭南市HFMD流行病学特征　　2016-2019年渭南市共收集HFMD病例25765例，男女比为1.30∶1;以小年龄组儿童为主，五岁以下儿童占全部报告病例的96.8%。人群类型以散居儿童为主（64.7%）。2016-2019年期间，全年各月均有病例报告，其中，2016年主要集中于5-7月份和11-12月份;2017年集中于4-6月份和10-11月份;2018年集中于4-7月份和10-11月份;2019年主要集中于5-7月份和10-11月份。渭南市十二个区县中不同地区的优势病原体不同。4年重症病例共150例（5.8‰），死亡4例（0.15‰）。　　2.2016-2019年渭南市HFMD病原学特征　　渭南市2016-2019年实验室确诊病例共6556例，其中，2016年主要病原体为EV71，占60.0%;2017年主要病原体为EV71，占53.3%;2018年主要病原体为CA6，占42.8%;2019年主要病原体为CA6，占41.0%。4年重症病例共150例（5.8‰），死亡4例（0.15‰）。不同年份手足口病例中病原体型别分布（P=0.000）差异有统计学意义。　　3.渭南市CA6病毒VP1基因特点　　2016-2019年渭南市实验室确诊病例CA6共计1799例。从中挑选12份符合标准的样本进行毒株分离，成功分离出阳性标本2份，1份标本测序成功。渭南市的1株分离株离株与2013年广州分离株亲缘关系最近，但与Gdula原型株差异较大。　　结论　　1.系统全面地总结分析了渭南市2016-2019年手足口疫情的流行病学特征，4-7月、10-12月是该地HFMD高发期。3岁以下男童、散居儿童及幼托儿童是重点防控人群。　　2.阐明了渭南市HFMD的病原变迁、病毒分子进化特点及病原分子流行病学特征。发现EV71是2016-2017年主要病原体，2018年开始CA6呈逐年上升趋势，成为渭南市HFMD主要病原体。　　***6自1948年首次分离鉴定后，全世界很多国家和地区均报告CA6的暴发或散发流行，在此之前渭南地区未见对该型病毒的正式报道。本研究结果将为陕西省HFMD疫情防控提供重要科学数据，并有利于HFMD的预防和控制。

关键词： 优化皮肤管理   手足口病   患儿   依从性  

摘要： 目的:探究优化皮肤管理方案对手足口病患儿的口腔溃疡、皮疹等临床症状及治愈皮肤依从性的影响。方法:选取本院2019年10月至2020年8月收治的107例手足口病患儿为研究对象,根据护理方式不同分为观察组(n=50)及对照组(n=57)。对照组实施口腔清洁、皮肤上药等常规护理操作,观察组制订皮肤质量管理优化方案,在一般操作的基础上加以质量控制。比较两组患儿临床资料及依从性评分。结果:观察组高温、咳嗽、溃疡、皮疹消退时长及住院时长显著短于对照组,组间比较,差异均具有统计学意义(P<0.05);观察组患儿口腔清洁、静脉注射、抹药、保护皮疹、皮疹清洁配合度评分及总分均显著高于对照组,组间比较,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论:在针对传染性强的手足口病患儿进行新技术、新方法的管理应用,帮助儿科护士更好地为患儿提供精准皮肤护理,从而提高处理手足口病患儿皮肤感染的能力及护理管理水平。

关键词： 手足口病   科学预防  

摘要： 手足口病是一种儿童常见且高发的急性传染性疾病,由肠道病菌所致,患儿以"发热、手足出现疱疹"症状为主,此病主要通过接触、飞沫等途径传播,病情较重者甚至会引发肺水肿、脑炎等并发症,从而严重威胁患儿生命安全。

关键词： 成都市   手足口病   EV71疫苗   传播动力学模型  

摘要： 目的本次研究旨在了解成都市手足口病流行病学特征及其传播规律,分析EV71疫苗接种前后手足口病流行特征的变化,为成都市因地制宜制定手足口病防控策略,尤其是EV71疫苗接种策略等提供科学依据,为全省乃至全国手足口病的防控工作提供参考。对象与方法从《国家疾病监测报告管理系统》中提取2009-2018年成都市手足口病病例资料,选择现住址为成都市的手足口病临床诊断病例及实验室确诊病例为研究对象,并从成都市疾病预防控制中心中心获取2016年8月至2018年12月EV71疫苗各接种剂次时间及年龄分布数据。运用描述性流行病学方法,分析成都市手足口病的流行病学特征及其病原谱的变化。构建时间序列易感-感染-康复模型,分析成都市手足口病的传播规律及基本繁殖数。比较EV71疫苗接种前期(2010年-2015年)、过渡期(2016年)和疫苗接种后期(2017年-2018年)中,手足口病人群分布特征、肠道病毒病原谱、发病和重症的变化情况。结果(1)手足口病流行病学特征2009-2018年,成都市累计报告手足口病病例367439例,年平均发病率为244.29/10万,发病率整体呈上升趋势。累计报告重症病例3852例,年平均重症率为2.61/10万。历年间EV71、CVA16和其他肠道病毒阳性病例均有报道,2013年至2018年间,轻症病例中其他肠道病毒的比例最高。重症病例中以EV71和其他肠道病毒占比较高。发病多见于5岁以下儿童,男性及散居儿童占比较多。发病多集中于中心城区,周边城区发病率较低。病例发病呈季节性分布,两个发病高峰常见于4-6月及10-12月。EV71和CVA16感染以1-2年为单位呈周期性流行。(2)手足口病传播动力学特征分析两血清型双重循环的时间序列易感-感染-康复(TSIR)模型分析结果显示,季节性传播率在我国历年的4-7周和28-31周达到低估值。EV71和CVA16两肠道病毒血清型感染的手足口病之间存在交叉免疫保护作用,其中感染EV71后将对CVA16血清型感染产生交叉免疫保护,持续时间为6周(95%CI:1,38),感染CVA16后对EV71的交叉免疫保护持续时间约为18周(95%CI:1,52)。成都市EV71感染手足口病的基本繁殖数中位数为16.82(IQR:14.81-18.24),CVA16型手足口病基本繁殖数的中位数为48.58(IQR:35.63-50.90),其群体免疫阈值分别为94.05%和97.94%。(3)EV71疫苗接种前后手足口病流行特征的变化2016年8月至2018年12月,共有616179位儿童接种EV71疫苗的,种第二剂次EV71疫苗共420151人,春夏季接种剂次数较多。EV71疫苗累计接种率约为60.82%。与EV71疫苗接种前(2010-2015年)相比,疫苗接种后(2017-2018年)手足口病的年龄与性别分布均发生明显改变,24-59月龄病例构成比呈下降趋势。手足口病总体发病率显著升高(219.28/10万vs 352.63/10万)。血清型特异性分析结果显示,手足口病发病率的升高主要是由于其他肠道病毒型和CVA16阳性手足口病发病率显著上升(all P<0.001),而EV71阳性手足口发病率显著降低(P<0.001)。CVA16和其他肠道病毒感染手足口病各年龄组的发病率均显著增加(all P<0.001),EV71感染手足口病病例的发病率在12-23月龄、24-59月龄和5-9岁年龄组中显著下降(all P<0.001),而在其他年龄组中没有显著改变(all P>0.05)。手足口病病例重症发生率显著降低,从1.40%下降至0.34%(P<0.001)。结论2009-2018年成都市手足口病发病率整体呈上升趋势。EV71和CVA16阳性手足口病的发病均呈周期性和季节性规律,两血清型间存在交叉免疫保护作用。EV71疫苗上市后,手足口病的重症发生率及EV71感染手足口病的发病率均显著下降。其他肠道病毒型逐渐超过EV71和CVA16,成为引起手足口病的优势血清型。