关键词:
脊柱炎,强直性
程序性死亡基因
PD-L1
PD-L2
Asporin
多态现象(遗传学)
全基因组扫描
肿瘤坏死因子
Meta分析
摘要:
目的:探讨程序性细胞死亡基因(PD-1)及其配体PD-L1、PD-L2的单核苷酸多态性(SNP)对山东汉族人群强直性脊柱炎(AS)患者易感性的影响;分析Asporin(ASPN)基因天冬氨酸(D)重复多态性与AS的关联;评估AS全基因组扫描研究结果,进一步确定AS遗传易感基因的染色体区域定位;探讨AS与肿瘤坏死因子α基因启动子—308位点多态性的关联情况。
方法:1、收集2006年1月至2007年10月在山东省立医院就诊的AS患者196例和180例正常对照,采用PCR-RELP和real time PCR熔解曲线方法,分析PD-1rs2227981、PD-1rs2227982及配体PD-L1 rs822336、PD—L2 rs6476985、PD—L2rs1009759等在AS和正常对照人群的分布情况,基因测序鉴定SNP分型结果。结合AS患者临床表型进行统计学分析。
2、引物荧光标记,采用PCR-毛细管电泳法,检测ASPN天冬氨酸(D)重复多态性在AS和正常对照人群的分布情况,分析其与AS临床表型的关联。
3、检索分析已发表的有关AS和SpA的全基因扫描文献结果,采用GSMA软件进行Meta分析。
4、检索分析已发表的有关AS与肿瘤坏死因子α基因启动子—308位点多态性的文献结果,采用Review Manager4.2软件进行Meta分析。
结果:1、经HWE检测,PD-1 rs2227981C/T各基因型在AS组和正常对照组的分布符合遗传平衡(P=0.711;P=0.17668)。统计分析显示,PD-1 rs2227981各等位基因及基因型在AS患者组和正常对照组的分布无明显差异(P=0.226;P=0.283)。
2、经HWE检测,PD-1 rs2227982C/T各基因型在AS组和正常对照组的分布符合遗传平衡(P=0.1712;P=0.0556)。统计分析显示,AS患者组PD-1 rs2227982T/T、C/T和C/C基因型频率分别为9.69%、36.22%和54.08%,正常对照组为5%、24.44%和70.56%,二者分布有统计学差异(P=0.004);PD-1rs2227982T在AS组频率明显增高(28.53%Vs17.22%;P=0.000)。按性别因素进行亚群分析,在男性亚群中,PD-1 rs2227982各等位基因及基因型在AS组频率亦明显增高(P=0.004;P=0.019);在女性亚群中,PD-1 rs2227982T在AS组频率增高(P=0.004),各基因型则未见统计学差异(P=0.089)。
3、PD-1 rs2227981、rs2227982单倍体分析表明,CT单倍体在AS组频率明显高于对照组(19.2%Vs11.4%;P=0.003),CC单倍体在对照组常见(47.1%Vs59.9%;P=0.001)。
4、PD-1 rs2227982各基因型与AS临床表型的关联分析表明,TT基因型组AS患者双髋关节和单侧膝关节受累频率明显增加(P=0.000;P=0.003),骶髂关节破坏程度较重(P=0.000)。
5、经HWE检测,PD-L1 rs822336C/G各基因型在AS组和正常对照组的分布符合遗传平衡(P=0.1477;P=0.0794)。统计分析显示,AS患者组PD-L1 rs822336C/C、C/G和G/G基因型频率分别为9.69%、48.98%和40.31%,正常对照组为10%、34.44%和55.56%,二者分布有统计学差异(P=0.007)。PD-L1 rs822336C在AS组频率明显增高(34.69%Vs27.22%;P=0.027)。按性别因素进行亚群分析,男性亚群中PD-L1 rs822336各等位基因及基因型在AS组频率亦明显增高(P=0.005;P=0.002),在女性亚群各等位基因及基因型均未见统计学差异(P=0.454;P=0.731)。
6、PD-L1 rs822336各基因型与AS临床表型的关联分析表明,CC基因型组AS患者腰痛和虹膜炎阳性率明显升高(P=0.037;P=0.000);骶髂关节炎则以CC和CG基因型两组较重(P=0.002)。
7、经HWE检测,PD-L2 rs1009759各基因型在AS组和正常对照组的分布符合遗传平衡(P=0.1740;P=0.1902)。统计分析显示,PD-L2 rs1009759各等位基因及基因型在AS患者组和正常对照组的分布无明显差异(P=0.371;P=0.695)
8、经HWE检测,PD-L2 rs6476985各基因型在AS组和正常对照组的分布符合遗传平衡(P=0.6747:P=0.0517)。统计分析显示,PD-L2