关键词:
诺如病毒
基因型
分子进化
表位预测
摘要:
目的了解2022—2023年我国诺如病毒急性胃肠炎暴发及聚集性疫情GII.3[P12]重组株的分子进化特征。方法收集2022年至2023年诺如病毒暴发及聚集性疫情流行病学信息、病例信息、临床样本以及检测和基因分型信息;对GII.3[P12]重组株阳性样本进行核酸提取、全基因组扩增及序列分析;利用同源模拟方法,构建三维结构并预测抗原表位。结果2022年1月至2023年12月,我国诺如病毒暴发监测网络共报告1136起诺如病毒暴发及聚集性疫情,942起疫情成功获得基因型分型结果,以GII为主,占76.0%(716/942),GI和混合基因型占比分别为15.8%(149/942)和8.2%(77/942)。GII引起的诺如病毒疫情以GII.3[P12]为主(22.5%,161/716),其他主要基因型包括GII.17[P17](18.7%,134/716)、GII.4_Sydney 2012[P16](11.6%,83/716)和GII.6[P7](11.3%,81/716)。2022—2023年GII.3[P12]引起的疫情集中发生在2~3月份(54.0%,87/161),主要暴发场所为托幼机构和小学(87.5%),传播途径以人传人为主(68.9%),3~7岁儿童为主要易感人群(93.3%)。本研究获得25株GII.3[P12]重组株基因组序列,根据系统进化分析表明,我国2022—2023年GII.3[P12]重组株属于Cluster IV簇的sublineage b(7株)和sublineage c(18株)。通过表位预测分析,共预测得到11个线性表位和8个构象性表位,预测得到的线性表位与构象性表位存在重合位置,每一个构象性表位都是预测的线性表位的一部分,其潜在的抗原结合位点与受体结合位点均保守。结论GII.3[P12]重组株是2022—2023年引起我国诺如病毒暴发及聚集性疫情的流行株之一,其基因组未发生明显变异。