关键词： 沙门菌   多重耐药   多位点序列分型   β-内酰胺酶基因  

摘要： 目的 了解贵州省多重耐药沙门菌临床分离株的分子流行病学特征，明确菌株携带β-内酰胺酶耐药基因的情况，为贵州省多重耐药沙门菌的防治提供参考依据。方法 以70株多重耐药沙门菌为研究对象，采用微量肉汤稀释法对其进行抗生素敏感性分析，采用多位点序列分型（Multilocus sequence typing, MLST）方法进行分子流行病学分析，应用PCR方法检测多重耐药沙门菌β-内酰胺酶耐药基因的携带情况。结果 贵州省70株多重耐药沙门菌以同时对4～5类抗生素耐药为主，占64.3%,有4.3%的菌株出现了泛耐药。70株多重耐药沙门菌被分为15个序列型，分属于13个eBurst Group,其中ST34、ST11和ST19是最常见ST型。ST型别最多的是铜仁市，部分地区出现独有的ST型，不同优势ST型其耐药谱不同。80.0%菌株至少携带一种β-内酰胺类耐药基因，其中blaTEM（78.6%）最常见，blaCTX-M基因占2.9%,包括blaCTX-M-55和blaCTX-M-64亚型，blaSHV、blaOXA-2和blaPER基因未检出。结论 贵州省多重耐药沙门菌ST34、ST11和ST19为常见序列型，不同地区多重耐药沙门菌有一定的同源性，这些菌株可能在不同地区进行了传播，对β-内酰胺类抗生素耐药主要由blaTEM介导。

关键词： 猩红热   流行特征   云南  

摘要： 目的 分析2010—2022年云南省猩红热监测数据，以初步掌握其发病水平和流行病学特征，为进一步做好防控工作提供科学依据。方法 2010—2022年云南省猩红热数据来源于中国疾病预防控制信息系统，描述三间分布，用季节指数分析季节趋势；随机抽取省内22家医疗机构报告的92例猩红热病例，核查其诊断准确性。结果 2010—2022年，云南省报告猩红热21 081例，其中确诊病例仅占5.25%；年均发病率3.44/10万，无死亡；每年有春夏季、冬季两个流行高峰，分别占全年发病数的49.78%和17.43%。10岁以下儿童高发，发病率为23.75/10万，男童发病高于女童；年均发病率居前列的州市为丽江市、玉溪市、大理州、普洱市，分别为10.49/10万、7.67/10万、5.54/10万、5.21/10万，2020年前后发病率上升幅度较大的州市为迪庆州、怒江州、曲靖市、文山州，上升幅度较大的县区为文山州丘北县、迪庆州维西县、曲靖市罗平县、怒江州兰坪县；抽查22家医疗机构2021—2022年报告的92例猩红热病例，诊断准确率为56.52%。结论 2010—2022年，云南省猩红热发病总体呈上升趋势，建议在丽江、玉溪、大理等重点流行区开展以健康教育为主的综合预防措施，并开展病原学哨点监测；建议在近两年发病上升幅度较大的文山州丘北县、迪庆州维西县、怒江州兰坪县等地开展病例诊断质量核查，掌握猩红热发病的真实情况。

关键词： 猪流行性腹泻病毒   S基因片段   分子流行病学特征   防治效果  

摘要： 猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED)是我国养猪业常见的急性肠道性传染疾病,以食欲降低、呕吐、水样腹泻、脱水衰竭等为基本特征。PED主要通过口鼻、粪便、乳汁等途径传播,可侵犯小肠肠系膜淋巴结、损伤微绒毛,影响猪肠道吸收,引发腹泻。PED具有传播范围广、危害大等特点。仔猪易感染且感染死亡率高。PED的发生会给猪场带来严重的损失。因此时刻监测猪场PED分子流行病学趋势,并分析其防治措施成效及不足等,对于针对性防控PED,减少猪场损失具有重要意义。2023年,广西地区爆发了严重的PED疫情,为了解广西某集团PEDV流行态势,本试验进行了以下研究。 1.2023年广西某集团24个规模化猪场PEDV分子流行病学调查情况 本研究在2023年1月～2023年12月期间,对广西某集团来宾片区、南宁片区和钦州片区总计24个规模化猪场采集了粪便,肛拭子、环境、乳汁、肠道样品共计20388份,其中粪便样品7889份,肛拭子样品9504份,环境样品2672份,乳汁样品315份,肠道样品8份。在采集的样本中,进行混样检测5437份。在5437份检测样本中,PEDV阳性数1985份,阳性率为36.51%,RV阳性数663份,阳性率为12.19%。PEDV阳性率在春季、冬季的阳性率最高,分别为35.45%、44.58%,且一年四季均可发生,季节性逐渐模糊。RV的阳性率在春季最高,阳性率为28.37%。从地区来看,来宾片区的PEDV阳性率高于南宁片区,钦州片区RV阳性率为三个地区中最高。 为了研究该集团PEDV分子流行病学,本试验对PEDV阳性样品进行了PEDV S基因全长扩增,共获得了25条PEDV S基因序列。对测序毒株进行分析,结果表明,测序毒株之间的同源性最高达100%,与国内外参考毒株的核苷酸同源性为93.5%-99.4%,氨基酸同源性为92.4%-99.6%。遗传进化显示12株测序毒株属于G2b分支,13株测序毒株属于S-INDEL-LIKE分支。与CV777相比,本试验测序毒株在COE、SS6存在多处氨基酸突变;对其糖基化位点预测,进化分支为S-INDEL-LIKE的PEDV毒株与经典毒株CV777、S-INDEL-LIKE毒株CH-HNBR-01-2021相比,差异较大,将测序毒株为G2b的毒株与CH-HBSY-12-2020比较,仅测序毒株2023-22,2023-27,2023-28,2023-69在787aa多了NFSV;对其进行抗原指数预测,其差异主要表现在S蛋白N端。将本试验测序毒株与CV777相比,测序毒株核苷酸存在多处点突变和插入以及缺失。对跨膜区进行预测显示,本试验测序毒株均存在跨膜区,并且在1-20aa处存在信号肽。 2.广西某规模化猪场流行性腹泻防治效果研究 广西某规模化猪场2023年7月17日爆发PED疫情,采取腹泻疫苗免疫(A公司WH-1株+AJ1102灭活苗)、高同源性的疫苗免疫、紧急处理措施以及返饲措施等,历时25天成功控制PED疫情,无大规模腹泻,但是环境带毒,仔猪偶有零性腹泻。该猪场因PEDV死亡的仔猪总数为8481,仔猪死亡率31.59%(8481/26848),各线因PED死亡仔猪占比最高的是一线、七线、六线,分别为46.08%、42.86%和31.07%。总体死亡率较相对较低,并及时控制住PED疫情,与该场及时采取紧急措施,并使用高同源性的疫苗紧急免疫有很大的关系。 对该规模化猪场爆发PED疫情进行反思,可能的原因是(1)引种与后备猪入群时未进行排毒检测:该猪场在4月16日曾经从猪场C引种405头,并于5月5日采集粪便样送检,结果为阳性,且该批次后备猪于2023年6月29补入各生产线;(2)生物安全存在漏洞:生产人员与非生产人员进入猪场存在安全隐患;(3)员工责任心不强:前期大龄仔猪出现腹泻情况未重视并且员工更换工作服未及时用消毒水浸泡和清洗;(4)腹泻疫苗免疫:对场内的腹泻疫苗免疫进行复核发现免疫记录和疫苗领用记录不完善,每月疫苗领用可免头数大于每月应免头数,存在着往前或往后免疫情况等原因。因此仍需加强PED防控管理,提高PED防控水平。总之,通过此次研究具有一定的价值,能够为广西规模化猪场有效防控PEDV,及时快速处置PED疫情提供有益指导。

关键词： 弓形虫   水牛   流行病学   双氢青蒿素   治疗  

摘要： 弓形虫（Toxoplasma gondii）是隶属于顶复亚门的专性胞内寄生原虫,能够感染绝大部分温血动物。弓形虫病呈全球性分布,掌握弓形虫病在各地区的流行病学情况对其防控至关重要。目前临床上常用药形式主要为乙胺嘧啶和磺胺嘧啶联用,但这种疗法存在不良反应大,易复发等缺点,因此寻找更多有效的抗弓形虫药物至关重要。双氢青蒿素（DHA）是一种有效的抗疟疾药物,能诱导肿瘤细胞发生铁死亡,它具有潜在的抗弓形虫活性,但其杀死弓形虫的机制尚未完全清楚。本研究采用间接ELISA的方法对广西壮族自治区水牛血清中弓形虫抗体Ig G进行检测,同时对双氢青蒿素的抗弓形虫效果进行全面评价并且初步探索其杀虫机制。本研究旨在确定广西地区水牛弓形虫血清抗体阳性率,同时寻找可能有效的抗弓形虫药物。 研究结果显示,广西地区水牛整体的血清抗体阳性率为52.9%（551/1041）。在检测的14个地级市中,贺州市的水牛血清阳性率甚至高达81.0%（68/84）,而南宁市低至24.7%（22/89）。此外,我们发现DHA具有较好的体外抑制弓形虫效果,半数最大有效浓度(EC50)为0.22μM。小鼠体内治疗实验结果显示,DHA没有改变急性感染弓形虫小鼠的存活情况,但能够降低Ⅱ型速殖子感染后小鼠的脑包囊数目。进一步深入研究发现,DHA能明显增加弓形虫体内的ROS水平并降低线粒体膜电位,而铁死亡抑制剂（DFO）能逆转这一现象。此外,我们发现铁死亡诱导剂RSL3具有较好的抑制弓形虫效果,同时DHA和RSL3的联合用药具有更好的抗弓形虫效果。 本研究不仅成功获取了广西地区水牛弓形虫血清流行率,也对DHA的抗弓形虫效果以及机制进行初步探索,为弓形虫病的治疗与预防提供了新的思路与方向。这些结果将为抗弓形虫药物筛选和临床用药指导提供新的策略。

关键词： 犬乳腺肿瘤   流行病学调查   临床组织病理特征   良恶性   COX-2   相关性分析   预后  

摘要： 随着我国饲养宠物犬的数量增加,肿瘤性疾病是造成患犬死亡的主要原因之一,而犬乳腺肿瘤是雌性犬中最常见的肿瘤性疾病,因此对肿瘤的良恶性做出正确的判断及及时开展流行病学调查对于后续的治疗十分重要,而目前我国对于犬乳腺肿瘤的流行病学调查资料较少。病理学检查是犬乳腺肿瘤诊断的“金标准”,临床组织病理特征易于观察和记录,对于判断肿瘤的良恶性及预后十分重要,此外COX-2是与犬乳腺肿瘤的发生、发展、转移和预后密切相关的免疫组化标志物,而目前国内的研究中缺少临床组织病理特征与犬乳腺肿瘤的良恶性、COX-2的相关性分析研究。 1.武汉地区犬乳腺肿瘤流行病学调查 本研究旨在通过收集武汉市的208例犬乳腺肿瘤,统计年龄、绝育情况、性别、品种等基本临床信息并进行组织学诊断,探究武汉地区犬乳腺肿瘤的发病特点和流行规律,结果表明武汉地区犬乳腺肿瘤的高发品种为贵宾犬和杂交犬,平均发病年龄为9.7岁,发病高峰为8-12岁,患犬以雌性未绝育犬为主,良恶性肿瘤比例接近1:1,高发良性肿瘤类型为混合瘤、复杂瘤和导管瘤,高发恶性肿瘤类型为混合癌、导管癌和管状癌,恶性肿瘤以Ⅱ级为主。 2.二元logistic模型的建立 通过观察并统计分析临床组织病理特征在良恶性肿瘤中差异,并建立与犬乳腺肿瘤良恶性相关的二元logistic回归模型,探究犬乳腺恶性肿瘤的危险因素和良性肿瘤的保护因素,结果表明年龄、坏死灶数量和坏死面积百分比、出血灶数量和出血灶面积百分比、瘤内淋巴细胞浸润程度和面积百分比、微血管面积、微血管密度、肌上皮增生在良恶性肿瘤中差异显著,并建立了以肿瘤良恶性为因变量,临床组织病理特征为自变量的二元logistic回归模型,在本模型中,多灶性坏死、微血管密度是恶性肿瘤的危险因素,微血管面积为良性肿瘤的保护因素。 ***-2在犬乳腺肿瘤中的表达及临床组织病理特征的相关性分析 通过分析组织学分级、脉管侵袭与临床组织病理特征的相关性,初步筛选与预后相关的临床组织病理特征,结果表明组织学分级与坏死灶数量、微血管密度、核多形性、有丝分裂象、TIL浸润程度、肌上皮增生相关;脉管侵袭与微血管密度、组织学分级、核多形性、有丝分裂象、TIL浸润程度、肌上皮增生相关。 对208例犬乳腺肿瘤进行COX-2的免疫组化染色,验证COX-2在犬乳腺肿瘤中作用,同时分析COX-2与公认的预后临床组织病理特征(脉管侵袭、组织学分级)进行相关性分析,验证COX-2在犬乳腺肿瘤判断预后中的作用;将犬乳腺肿瘤COX-2的表达与临床组织病理特征进行相关性分析,并与脉管侵袭、组织学分级与临床组织病理特征的相关性分析结果对比,筛选出可能具有预后价值的临床组织病理特征,结果表明COX-2的表达在瘤旁和乳腺肿瘤组织中差异显著,在良性肿瘤和恶性肿瘤中表达差异显著,说明COX-2的表达与犬乳腺肿瘤的发生相关,可作为鉴别犬乳腺肿瘤良恶性的参考指标。COX-2与脉管侵袭、组织学分级相关,验证了COX-2在判断犬乳腺肿瘤预后中的作用;微血管密度、脉管侵袭、组织学分级、核多形性、有丝分裂象、TIL浸润程度、肌上皮增生可作为判断犬乳腺肿瘤预后的临床组织病理特征,预后型组织学分类、微血管面积、坏死灶数量可作为潜在的判断预后的临床组织病理特征。 综上所述本研究收集了武汉市208例犬乳腺肿瘤病例,评估了若干临床组织病理特征在良恶性肿瘤中的差异,筛选出了影响恶性肿瘤发生的危险因素和良性肿瘤的保护因素,验证了COX-2在犬乳腺肿瘤中的作用并筛选出与判断预后相关的临床组织病理特征,为了解武汉市犬乳腺肿瘤的发病特点和流行规律提供了一定的参考,为临床诊断犬乳腺肿瘤的良恶性、判断预后和治疗选择提供了更多的思路。

关键词： 肾综合征出血热   流行病学特征   Joinpoint回归   空间自相关   时空聚集性  

摘要： 目的探索杭州市肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome, HFRS)的流行病学及时空分布特征, 为HFRS防控提供科学依据。方法通过中国疾病预防控制信息系统传染病监测报告信息系统, 收集杭州市2010年1月1日至2022年12月31日报告的HFRS病例信息, 采用描述流行病学方法分析杭州市HFRS流行概况及三间分布特征。采用Joinpoint回归分析杭州市2010 - 2022年HFRS发病率的变化趋势。分别采用全局和局部空间自相关分析杭州市HFRS空间分布规律和发病热点区域;并采用时空扫描分析杭州市HFRS时空聚集区域。结果 2010 - 2022年, 杭州市累计报告HFRS病例224例, 年均发病率为0.18/10万。病例分布呈现明显的季节性, 春季(3 - 5月)和秋季(9 - 11月)为发病高峰, 分别占30.80%(69/224)、26.34%(59/224);全市各区(县、市)均有HFRS病例报告, 其中萧山区(66例, 29.46%)、淳安县(41例, 18.30%)、建德市报告病例数(25例, 11.16%)居前3位;病例主要为31 ～ 60岁(65.18%, 146/224)、男性(74.55%, 167/224)、农民(46.43%, 104/224)。Joinpoint回归分析显示, 2010 - 2022年杭州市HFRS发病率整体呈下降趋势[平均年度变化百分比(average annual percent change, AAPC) = - 5.01%, 95%置信区间(confidence intervals, CI):- 9.46% ～ - 0.34%, t = - 2.10, P = 0.036]。全局空间自相关分析显示, 2011 - 2014、2018、2020年杭州市各街道(乡镇)HFRS发病率均存在空间正相关聚集性(莫兰指数均> 0, 均Z > 1.96, 均P < 0.05)。局部空间自相关分析显示, 2010 - 2022年杭州市热点区域(高-高)街道(乡镇)数分别为0、2、3、3、3、3、0、0、4、0、1、0、1个, 且相对固定在西南部区(县、市)。时空扫描共探测到3个聚集区, 一类聚集区的时间为2011年8月至2015年1月, 以淳安县汾口镇为中心, 涉及淳安县的5个乡镇;二类聚集区1的时间为2012年8月至2016年3月, 以萧山区浦阳镇为中心, 涉及萧山区的5个乡镇;二类聚集区2的时间为2019年6月至2020年6月, 以建德市下涯镇为中心, 不涉及其他街道(乡镇)。结论 2010 - 2022年, 杭州市HFRS病例以中年男性农民为主。HFRS疫情整体呈现下降趋势, 主要集中于杭州市西南部区(县、市)。今后应当对重点地区和重点人群开展精准防控。

关键词： 弯曲菌   流行病学调查   全基因组   耐药性   地方鸡  

摘要： 为调查湖北地区鸡源弯曲菌的流行与耐药情况,本研究于2022年至2023年从湖北武汉、荆州、黄冈、孝感4个家禽主产区采集鸡源样品进行弯曲菌的PCR检测及分离鉴定;选用临床上常用的6类抗菌药物基于K-B试纸法对分离株进行药物敏感性测试;并通过全基因组测序及生物信息学分析方法对湖北地区江汉鸡源弯曲菌分离株的遗传分布信息、毒力及耐药基因分布情况进行调查。结果如下: 1、本研究共采集鸡泄殖腔拭子、肠内容物等869份样品,检出弯曲菌阳性样品126份,总阳性率为14.5%。空肠弯曲菌为优势种群,占整体阳性样品的69.8%。不同地区之间,武汉地区弯曲菌阳性率最高(19.0%),其次为孝感(18.2%)、黄冈(14.6%)、荆州(12.0%)。泄殖腔拭子的PCR阳性检出率为14.9%,高于鸡盲肠内容物(10.3%)。对阳性样品进行弯曲菌分离纯化及鉴定,共成功分离到93株弯曲菌。弯曲菌分离株对四环素、环丙沙星、林可霉素的耐药率分别达77.4%、75.3%、71.0%,对头孢噻肟最为敏感(耐药率为28.0%),54.8%的弯曲菌对红霉素耐药;69.9%的弯曲菌分离株表现出多重耐药性。 2、在湖北地区江汉鸡源弯曲菌分离株中,CC-354、CC-828分别是空肠弯曲菌和结肠弯曲菌的优势种群;96.7%的测序菌株基因组中含有耐药相关的GyrA T86I突变和tet(O),90.0%的菌株含有blaOXA型耐药基因,ant(6)-Ia、aac(6')-aph(3")以及erm(B)的携带率分别为26.7%、23.3%、13.3%,tet(L)、aph(3')-III、ant(9)、cat等基因仅在3.3%的弯曲菌菌株中发现。弯曲菌的耐药表型与基因型的相关性在不同抗生素中存在较大差异(15.4%～100.0%),其中弯曲菌对环丙沙星和四环素的耐药性和耐药基因或耐药点突变具有较高相关性。所有测序株均携带多种毒力基因,其中空肠弯曲菌携带的毒力相关基因更多,且这些基因大多涉及侵袭性、免疫调节和运动性。此外,在两株空肠弯曲菌中识别出与格林-巴利综合征有关的wla N、nue A1,nue B1,nue C1。 综上所述,从湖北地区4个家禽主产区分离的弯曲菌普遍存在多重耐药现象。同时在该地区江汉鸡中传播的弯曲菌菌株具有较强的遗传多样性且包含多种毒力基因,与耐药相关的GyrA T86I突变和tet(O)具有高流行性。