关键词： 鸡源大肠杆菌   耐药性   流行病学调查   tet(X4)  

摘要： 碳青霉烯、多粘菌素和替加环素是临床面对多重耐药感染病人常用药物,但碳青霉烯类耐药肠杆菌(CRE)的广泛流行和耐药基因mcr的不断发现,给治疗临床多重耐药菌感染带造成了巨大的阻碍。替加环素是一种新型四环素类抗生素,是应对“超级细菌”的“最后防线”。然而,近几年不断出现对可转移的高水平替加环素耐药基因的报道,因此存在替加环素治疗失败的可能。所以,为了进一步阐明tet(X)变异体及携带菌在我国养鸡场的分布流行、耐药特征及遗传环境。本研究以2022年采集河北地区蛋鸡和肉鸡养殖场的样本为对象,调查多重耐药大肠杆菌的流行情况及tet(X)变异体的流行特征,研究其传播机理,并为我国畜禽养殖中限制tet(X)的传播提供一定的理论基础。 2022年3-6月份从河北邯郸地区蛋鸡和肉鸡养殖场中采集400份样品,分离纯化后菌株利用MOLDI-TOF-MS进行菌种鉴定。采用肉汤稀释法测定了25株大肠杆菌的敏感性。结果显示:磺胺甲噁唑-甲氧苄啶、氨苄西林和四环素的耐药率较高,耐药率达100%;对其它抗生素有一定程度的耐药性。所有分离的大肠杆菌均为多重耐药菌,且以9耐药为主。本研究分离的鸡源大肠杆菌中存在大量多重耐药菌,尤其是蛋鸡来源对替加环素耐药的菌株,需要对其进行长期监测。 采用PCR法检测25株大肠杆菌(包括13株携带有tet(X4)的菌株)的血清型、系统进化群、质粒复制子和MLST分型。共计检测到9种血清型,所有菌株具有唯一的血清型;系统发育群分析显示:C和B1为优势群;质粒复制子分型以Inc F、PO111为主,多数株携带3种质粒;MLST分型共有9种,所有大肠杆菌仅有一种ST型。不同菌株血清型,质粒复制子分型及ST型呈现一定的多样性。 对13株tet(X4)阳性大肠杆菌进行遗传环境分析及传播特性研究,结果显示有8株菌可以将tet(X4)基因及对应的替加环素抗性转移至J53中,且其基因均被定位到质粒上。1株菌的全基因组测序结果显示tet(X4)的上下游不仅有其他的抗性基因还携带有其他的移动元件,结合基因定位试验推测部分菌株以移动元件带动抗性基因传播。同时大部分接合子对比亲本株其生长能力无明显差别,推测这些携带抗性基因的质粒未对宿主菌造成较大的适应性代价。 本研究分析了河北邯郸地区鸡源大肠杆菌的流行病学特征,并揭示了tet(X4)基因的遗传环境,为控制tet(X4)在我国畜禽养殖业中的传播扩散提供理论依据。

关键词： 肝片吸虫   绵羊   淡水螺   分子鉴定   转录组  

摘要： 肝片吸虫病是由于肝片吸虫(Fasciola hepatica)寄生于人和牛、羊等动物的肝脏和胆管内,进而引起肝炎、胆管炎以及全身性营养障碍的一种人畜共患寄生虫病。肝片吸虫广泛分布于世界各地,主要在亚洲、欧洲和美洲等地区流行,分布范围广,控制难度大。据统计,全世界约有1 700万人感染肝片吸虫病。由于高通量测序技术的迅速发展,转录组学测序已被广泛应用到不同发育阶段生物个体的基因差异表达研究中。目前,吸虫类寄生虫转录组学研究也越来越受到重视,但肝片吸虫的基因组数据集相对其他吸虫较少,特别是虫卵和不同发育阶段幼虫的基因组数据集,这限制了肝片吸虫病早期诊断技术的研究和开发。 本研究采用间接ELISA法对鄂尔多斯地区绵羊肝片吸虫病进行血清学调查,并利用kappa检验判定血清抗体检测和粪便虫卵检测结果的一致性。同时为调查鄂尔多斯地区的淡水螺种类和分布及其体内的吸虫感染情况,本文广泛采集该地区分布的淡水螺进行形态学鉴定,并借助分子生物学方法对淡水螺COI基因和ITS2基因进行PCR扩增,同时采用直接压片镜检法观察淡水螺体内的吸虫幼虫感染情况,并对吸虫进行分子生物学鉴定。采用DNBSEQ真核链特异性转录组resequencing技术对肝片吸虫虫卵、童虫和成虫进行转录组测序,并对童虫时期高表达基因进行qRT-PCR验证。结果显示: (1)在1 570份绵羊血清样品中,有337份样品检测为血清学抗体阳性,总感染率为21.46%(337/1 570)。 (2)共抽取74份血清学检测相应的绵羊粪样检查虫卵,根据一致性检验kappa值为0.466,表明血清抗体检测和粪便虫卵检测两种检测方法一致性中等。 (3)所采集的1 796只淡水螺归属2目、3科、4属,即环棱螺属(Bellamya)、萝卜螺属(Radix)、土蜗属(Galba)、旋螺属(Gyraulus)。镜检结果发现7-9月的螺体内吸虫感染率明显高于5-6月。且采集的吸虫鉴定为5种,分别为Cotylurus marcogliesei、肝片吸虫(Fasciola hepatica)、大片吸虫(Fasciola gigantica)、前后盘吸虫(Paramphistomum cervi)、Parastrigea robusta。 (4)利用RNA-seq技术,分析不同发育阶段虫体的差异表达基因在GO功能分类和KEGG代谢通路方面的生物学特性,并从中筛选出5个童虫阶段高表达的差异基因。这些基因与肝片吸虫的生长发育及免疫功能有关,为后续开展肝片吸虫蛋白质组学研究和早期诊断候选基因的筛选等研究提供了理论依据。 本研究首次对内蒙古鄂尔多斯地区绵羊肝片吸虫感染情况进行了血清学调查,研究结果揭示了内蒙古鄂尔多斯各地区绵羊均存在肝片吸虫感染。首次对鄂尔多斯地区淡水螺进行形态学和分子生物学鉴定以及体内吸虫分离鉴定,综合鄂尔多斯淡水螺种类及螺体内吸虫感染情况可知,大量淡水螺感染吸虫,特别是在雨水较多、气候适宜的7至9月份,对当地家畜造成严重危害。同时,应用RNA-Seq技术研究了不同发育阶段肝片吸虫转录组学,筛选出的5个童虫阶段高表达的差异基因,多与肝片吸虫的生长发育及免疫功能有关,为肝片吸虫相关理论研究、药物靶点发掘、早期免疫学诊断和防治奠定了基础。

关键词： 犬后肢瘫痪   流行病学   针灸治疗   疗效分析  

摘要： 后肢瘫痪是犬临床常见的一种病症，在中医上属“痿证”范畴。最常见的症状是受影响肢体的肌肉功能丧失，导致多种问题并降低患病犬和饲主的生活质量，增加护理成本以及时间负担。其确切病因诊断较为复杂，需要结合一系列精确影像学检查如X线检查，磁共振等。不仅对于临床兽医师的诊断技术以及所处医院的设备条件要求较高，且检查价格较高，诊断技术尚未完善，是目前小动物临床存在的一项难题。目前国内外对本病的治疗主要以手术为主，少数地区采用保守针灸治疗方法，但由于手术治疗费用昂贵且预后具有不确定性而导致很多患病犬猫没有得到治疗。中兽医对犬痿证病机辨证从而分证论治。然而，其辨证较为复杂，且当前具有熟练诊治能力的中兽医师人员缺乏，所以掌握后肢瘫痪犬的发病特征，优化分型，针对不同分型定制合适的针刺组合方案尤为重要。　　本文通过收集2021.12-2023.12在西北农林科大西安动物医院及西安派仕佳德动物医院的患有后肢瘫痪犬的病例基本信息、影像学信息（包括X线和磁共振）、血液学信息（包括血常规、血流变、CRP、CK和细胞因子）进行瘫痪犬的流行病发病特征分析，阐述其发病的规律。在此基础上，根据瘫痪犬的临床特征将其分为后肢僵硬型和后肢痿软型两种临床表型，并根据中兽医辨证分为四型：肝肾亏损型、脾胃受损型、肺热津伤型以及湿热浸淫型，对24个病例分类并采用两种不同针灸治疗方案来进行治疗，以探讨不同针灸治疗方案的疗效。其中，治疗方案一所采用的穴位包括肝腧（BL-18）、胆腧（BL-19）、脾腧（BL-20）、胃腧（BL-21）、肾腧（BL-23）、膀胱腧（BL-28）、腰百会、环跳（GB-38）、二眼，阳陵泉（GB-34）、足三里（ST-36）、委中（BL-40）、足六缝、头百会（GV-20）;治疗方案二所采用穴位包括肾腧（BL-23）、膀胱腧（BL-28）、腰百会、环跳（GB-38）、二眼、阳陵泉（GB-34）、足三里（ST-36）、委中（BL-40）、足六缝、头百会（GV-20）、太溪（KID-3）、太冲（LIV-3）。此外，两种方案同时使用电针和激光照射，电针的参数为：断续波、频率2Mhz、强度1，刺激时间30min;激光参数为：波长：660nm和780nm，照射30min。以简化针灸穴位组合，方便临床兽医师对瘫痪犬诊断和治疗。　　研究结果显示，后肢瘫痪犬的临床发病特征具有明显的品种倾向性，软骨营养不良的品种犬多发，如法国斗牛犬、迷你贵宾犬，且有明显性别倾向性，雄性犬多发。同时中年犬多发且在夏季易发生瘫痪。影像学调查结果显示，X线影像检查发现瘫痪犬只多在腰椎部位（L2-L7）发生变形性脊椎病，占比53.6%，而胸椎以及胸腰椎结合处是狭窄性脊椎病的最常发病部位，占比54.5%。对进行MRI诊断的后肢瘫痪犬分析发现，脊椎疾病占比最高，达91.38%，其中椎间盘疾病（IntervertebralDiscDisease,IVDD）发病率最高，占比63.79%，发病部位多在颈椎（56.8%）。其次为脊髓炎，占比12.07%。血液学研究发现，在血常规中，瘫痪组部分白细胞指标显著高于健康组（plt;0.001）;在血液流变学中，瘫痪组的全血还原黏度、纤维蛋白原、血液黏度以及红细胞变形指数均显著升高（plt;0.01）;瘫痪组C-急性期反应蛋白（CRP）、肌酸激酶（CK）指标显著高于健康组（plt;0.05）。细胞因子研究中，瘫痪组TNF-α显著高于健康组（plt;0.05），纤溶因子组织型纤溶酶原激活剂（TissuePlasminogenActivator,t-PA）极显著低于健康组（plt;0.01）且其纤溶酶原激活物抑制剂（PlasminogenActivatorInhibitor,PAI）极显著高于健康组（plt;0.01）。在治疗效果的研究中得出，随着瘫痪分级增高，治愈率下降。48h内接受针灸治疗的瘫痪犬痊愈率最高，可达到100%。从发病到开始接受针灸治疗的时间间隔越长，治疗效果越不理想。两种针灸治疗方案各有优势，方案一对临床表型为痿软型的瘫痪犬、中兽医诊断为湿热浸淫和脾胃亏损的瘫痪犬治疗效果优于方案二;方案二对临床表型为僵硬型的瘫痪犬、对中兽医诊断为肝肾亏损型的瘫痪犬治疗效果优于方案一;总体而言，方案二的治疗效果优于方案一。　　本研究通过阐明后肢瘫痪犬的流行病学特征、影像学特征以及血液学变化，初步说明其发病规律以及发病特征：后肢瘫痪犬多发于软骨营养不良的犬种，且中年雄性犬多发，夏季易发。后肢瘫痪犬的血液黏稠度显著升高，炎症指标升高且肌肉受损萎缩。腰椎节段易发生变形增生，胸椎及胸腰椎结合处易发生狭窄病变，病因大多为椎间盘疾病。针灸对犬瘫痪的治疗效果显著，其中方案一更适合后肢痿软的瘫痪犬以及辨证为湿热浸淫和脾胃亏损的瘫痪犬;治疗方案二适用于后肢僵硬的瘫痪犬以及辨证为肝肾亏损型的

关键词： 呼吸道合胞病毒   儿童   流行病学   气候环境  

摘要： 目的: 探讨并分析南昌地区儿童呼吸道合胞病毒（Respiratory syncytial virus,RSV）感染的临床流行病学特征及与气候环境因素的相关性。 方法: 回顾性收集2019年1月1日至2023年12月31日在江西省儿童医院门诊、急诊及住院部进行了RSV检测的来自南昌地区的急性呼吸道感染患儿病例;采集以上患儿的呼吸道标本和（或）血液标本的RSV检测结果及患儿的临床资料,分析RSV感染的临床流行病学特征;并从中国气象数据网和江西省生态环境厅收集同时间段的南昌地区气温、风速、降水量、PM2.5、PM10、CO浓度等气候环境数据;分析RSV阳性检测患儿的临床特征及与气候环境因素的相关性。通过SPSS26.0系统对以上所获取的南昌地区儿童RSV感染临床流行病学特征及与气候因素进行统计学分析。 结果: 1、本研究共有178127名患儿进行了RSV相关检测,总体阳性检出率8.35%; 2、男性RSV阳性检出率（8.92%）高于女性（7.35%）,具有明显统计学意义（P<0.01）; 3、RSV阳性检出率在不同年龄段中（0～<1岁,12.67%;1≤～<3岁,8.30%;3≤～<6岁,6.20%;6≤～<18岁,3.22%）存在差异,其中0～<1岁组RSV阳性检出率最高,且具有明显统计学意义（P<0.01）; 4、RSV阳性检出者在2019年、2020年、2022年(M2019=0.696;M2020=0.367;M2022=0.450)表现为冬春季节性,发病高峰时间段主要集中于11月至次年3月,在2023年(M2023=0.457)则表现为春夏季节性,发病高峰时间段主要集中于2月至7月,而在2021年(M2021=0.045)无季节性。 5、RSV阳性检出率与平均相对湿度、平均气压、月PM2.5及月CO均值呈正相关（r=0.340,P=0.008;r=0.335,P=0.009;r=0.274,P=0.034;r=0.310,P=0.016）,与平均风速、平均气温、月O3最大8小时值呈负相关（r=-0.303,P=0.018;r=-0.429,P=0.001;r=-0.405,P=0.001）,而与月降水总量、月SO2均值、月NO2均值、月PM10均值及AQI指数（r=0.085,P=0.519;r=-0.085,P=0.517;r=0.229,P=0.078;r=0.089,P=0.497;r=-0.011,P=0.935）无相关性。通过多元回归分析法对各种环境因素之间相互作用对结果的影响进一步分析提示,对RSV阳性检出率具有较显著影响的变量为月平均温度（调整后R2=0.237,回归系数=-0.292,t=-2.894,P=0.005）和月O3均值（调整后R2=0.195,回归系数=-0.066,t=-2.179,P=0.034）。 结论: 1、南昌地区急性呼吸道感染儿童总体RSV阳性检出率为8.35%;男性RSV阳性检出率较女性高;在不同年龄组中,0～<1岁组的RSV阳性检出率最高。其结果得出对于急性呼吸道感染的患儿,年龄越小越需注意RSV感染的可能。 2、RSV在南昌地区呈现冬春季节性流行,主要集中于11月至次年3月,由此结果提示,在RSV流行期间需要提高对患儿RSV感染的早期识别、诊断和治疗的意识。 3、低气温、低风速、高湿度、高PM2.5浓度及高CO浓度均能够在一定程度上增加RSV感染率,基于两者间相关性的结果,可指导普通人群通过获取天气信息,在高风险因素的气候环境条件下相应减少室外活动,提高防范意识,降低RSV感染的可能。

关键词： 急性呼吸道感染   鼻病毒   型别鉴定   分子流行病学   基因特征  

摘要： 研究背景: 急性呼吸道感染（acute respiratory infections,ARIs）是5岁以下儿童发病和死亡的主要原因,全球每年约有130万5岁以下儿童死于急性呼吸道感染。鼻病毒（Rhinovirus,RV）是引起婴幼儿、老年人及免疫力低下人群发生ARIs重要的病原体。RV为正向单链RNA病毒,编码11种蛋白质。基因组全长约7200bp,共编码VP1～VP4、2A～2C和3A～3D 11种蛋白质。其中5’UTR的序列高度保守,对RV的复制、转录和翻译等功能具有重要作用,可用于RV与其他呼吸道病原以及其他肠道病毒的鉴定;VP1蛋白与病毒的多样性有关,也是诱导人体产生保护性抗体的主要抗原,目前已用于RV的分型。依据P1（capsid proteins）、2C和3C区的氨基酸序列差异,将RV分为3个种,结合VP1分型,RV共分为A种80个型别、B种32个型别和C种57个型别。近年来,在中国、美国等地区的监测中,RV为最常检测到的呼吸道病毒之一。一些研究显示,相较RV-B,感染RV-A和C可引起较重的疾病,且感染RV-C与患者哮喘症状加重有关。目前尚无针对RV感染的抗病毒药物,而由于RV型别较多,不同型别的RV抗体交叉反应性弱,RV疫苗的研发受到极大的阻碍。因此加强RV感染监测和分子分型研究,对我国非法定呼吸道传染病的预防控制具有重要意义。 研究目的及方法: 本研究通过收集2021—2023年我国北方吉林省长春市、北京市和河南省漯河市,南方重庆市、江西省和广东省广州市ARIs病例的呼吸道标本、基本临床信息和多病原检测结果。分析2021—2023年我国部分地区ARIs病例中RV的感染状况,阐述RV在ARIs病例中的流行情况、型别组成和基因特征,丰富我国RV的基因组数据库,为我国RV的疾病监测和防治提供数据基础。 使用实时荧光定量PCR法对病例的呼吸道标本进行RV鉴定,进行RV流行病学分析;使用巢式逆转录PCR法扩增VP1区基因全长,结合国际病毒分类委员会推荐的RV标准参考株进行型别鉴定和基因特征分析;使用全基因组测序技术,扩增特定型别的全基因组序列,进行进一步的生物信息学分析。 研究结果: 1、本研究共收集我国六省市ARIs病例标本5648份,RV检出率为11.93%（674/5648）。男性和女性的RV检出率分别为12.82%（431/3361）和10.63%（243/2287）,差异具有统计学意义（χ2=6.258,P=0.012）。不同年龄组间RV检出率具有差异统计学意义（χ2=89.401,P<0.001）,以2～<5岁（15.85%,296/1868）年龄组中检出率最高。我国RV在秋季（17.54%,254/1448）检出率最高,其次为春夏季,不同季节间RV检出率差异具有统计学意义（χ2=70.191,P<0.001）。RV在我国北方的夏季和初秋季存在检出高峰,在南方的春季、秋季和冬季检出率较高。 2、结合哨点医院的多病原筛查结果,本研究共227例RV阳性标本检测9种常见呼吸道病毒。其中48例合并检出其他病毒,合并检出率为21.15%,以RV与EV（5.29%,12/227）双重合并检出最常见。 3、本研究共获得538条RV VP1序列,型别鉴定结果显示,其分属RV三个种的88个型别。RV-A检出341条,包括46个型别;RV-B检出23条,包括9个型别;RV-C检出174条,包括33个型别,其中6条序列无法确定具体型别。检出前五的型别为A49（32条）、A63（29条）、A78（26条）、A12（21条）和C15（21条）。南北方主要检出型别不同,北方检出前三的型别为A63（6.94%,25/360）、A49（6.67%,24/360）和A78（6.11%,22/360）;南方检出前三的型别为C17（7.30%,13/178）、A68（6.18%,11/178）、A49（4.49%,8/178）和A101（4.49%,8/178）,RV-A49在南北方中均检出较多。 4、本研究共19份标本同时检出2种或以上RV型别,其中一份标本同时检出A、B和C三种RV。RV-A与RV-B合并检出中,主要检出型别为RV-A58;RV-B与RV-C合并检出中,主要检出型别为RV-C15。 5、基于VP1区构建系统发育树显示,RV-A49随年代的递进形成不同的Lineage,不同Lineage间的平均核苷酸遗传距离为0.055～0.096。其标准参考株和其他3条检出较早的序列属于Lineage 1;2003—2006年美国、芬兰、冰岛检出的RV-A49属于Lineage 2;2007年以后中国、美国、柬埔寨和日本等国家检出的RV-A49属于Lineage 3。本研究检出的RV-A49均属于Lineage 3。其中

关键词： 手足口病   肠道病毒   Joinpoint回归模型   流行趋势  

摘要： 目的 分析贵阳市手足口病流行病学和病原学趋势变化，为手足口病的科学防控提供依据。方法 通过中国疾病预防控制信息系统收集2008—2022年贵阳市报告的手足口病病例及病原学监测数据，采用Joinpoint回归模型比较不同特征人群的手足口病及其病原学的变化趋势及特点。结果 2008—2022年贵阳市累计报告手足口病124 288例，年均发病率为187.54/10万。2008—2010年手足口病年发病率呈快速上升趋势(APC=144.59%,P=0.002)。2010—2022年缓慢下降(APC=-13.07%,P<0.001)。其中，男性发病率2008—2010年呈上升趋势(APC=137.14%,P=0.003),2010—2022年呈下降趋势(APC=-13.54%,P<0.001);女性发病率2008—2010年快速上升(APC=157.49%,P=0.001),2010—2022年呈下降趋势(APC=-12.41%,P<0.001),女性相较男性呈现“上升快、下降慢”特点。同时，病原学分析结果显示EV71型呈下降趋势，Cox A16型呈“先降后升”的趋势变化，其他EVs型呈上升趋势。结论 贵阳市手足口病总体呈下降趋势，但发病率依然较高，优势病原株已由以往的EV71型转为其他EVs型，建议手足口病的免疫接种策略应适度有针对性调整，关注女性的防控措施。

关键词： PRRSV   PCV2   双重qPCR方法   流行病学调查  

摘要： 猪繁殖与呼吸综合征(Porcine Reproductive and Respiratory Syndromes,PRRS)和猪圆环病毒2型(Porcine Circovirus Type 2,PCV2)是生猪养殖中需要重点防控的疾病,也是长期影响猪群健康的最重要的疾病。二者的共同感染在各种规模、各种养殖模式的猪群中广泛存在,不仅会影响疫苗免疫效果,还可能引发猪呼吸道疾病综合征(PRDC)、细菌等病原微生物继发感染等更为严重的问题,给临床防控造成巨大困难。因此,在掌握总体疾病流行情况基础上,快速、准确诊断PRRSV和PCV2感染,对疫病防控和猪群健康具有重要意义。 本研究通过对Gen Bank中登录的PRRSV和PCV2基因组序列进行分析,选择相对保守的PRRSV ORF6和PCV2 ORF2区域分别进行特异性引物和探针设计,在p UC57载体上构建两种病毒的重组质粒标准品。通过对引物探针组合的筛选和反应体系以及反应程序等进行优化,建立PRRSV荧光定量PCR方法和PCV2荧光定量PCR方法,结果显示两种方法均具有良好的特异性和敏感性,检测下限可达10copies/μL。为进一步提高检测的便捷性,在PRRSV和PCV2荧光定量PCR方法的基础上,开展双重荧光定量PCR方法的建立工作。将PRRSV ORF6和PCV2ORF2基因序列串联后连接到p UC57载体上,通过对浓度、温度等试验条件的优化,建立PRRSV和PCV2双重荧光定量PCR检测方法。试验结果显示,建立的PRRSV和PCV2双重荧光定量PCR检测方法具有良好的特异性;其检测下限为10copies/μL,敏感性较高;组内和组间变异系数均小于2.52%,具有良好的重复性。用本试验所建立的TaqMan和双重qPCR方法,对已知背景的88份临床样品进行检测,结果显示检测结果与本实验室已经建立的常规PCR方法检测结果符合率为96.8%,与商品化荧光定量PCR试剂盒检测结果符合率为100%。上述结果证实本研究建立的PRRSV、PCV2双重荧光定量PCR方法,能够快速准确的对PRRSV和PCV2进行检测,具有良好的临床应用前景。 采集866份出现发热、腹泻、呼吸困难、流产等临床症状的猪只血清样品,运用本实验建立的双重qPCR方法对其进行PRRSV和PCV2检测,结果显示:PRRSV阳性样品数为323,阳性率为37.3%;PCV2阳性样品数为207,阳性率为23.9%;PRRSV和PCV2均为阳性的样品数为116,双阳性率为13.39%。检测结果表明我国PRRSV、PCV2感染率均较高,临床上二者混合感染仍非常普遍。对部分PRRSV阳性样品的ORF5以及部分PCV2阳性样品的ORF2基因进行测序并分析其序列,结果显示:多数检测的PRRSV位于HP-PRRSV、NADC30进化分支上,提示HP-PRRSV和NADC30-like毒株仍然是田间流行的主要毒株;大多数PCV2属于PCV2d,表明PCV2d目前仍是我国流行的PCV2的优势基因型。选取部分PRRSV阳性样品进行病毒分离获得27株PRRSV分离株,对分离的病毒全基因组序列进行分析,结果显示:有24株PRRSV分离株被归类于以HP-PRRSV为代表的lineage 8;有3株PRRSV分离株归于以NADC30株和NADC34株为代表的lineage 1。同时,重组分析结果表明,lineage 1的3株PRRSV分离株均为重组毒株,重组主要发生在NADC30/34-like、HP-PRRSV和QYYZ-like毒株之间,这种重组病毒可能成为影响生猪养殖的重要因素。 本研究建立的PRRSV和PCV2的双重荧光定量PCR方法具有良好的特异性、敏感性和稳定性,适用于临床上对PRRSV和PCV2及二者混合感染的快速诊断。同时利用该方法对PRRSV和PCV2流行和变异情况进行监测和分析,本研究结果为分析PRRSV和PCV2的遗传演化规律和指导二者临床防控提供了技术手段和数据支撑。