关键词： 羊呼吸道疾病   病原菌   流行病学   耐药性分析   延边地区  

摘要： 延边地区具有独特的自然禀赋及丰沛资源，为羊群提供适宜的生长环境。截止至2023年12月，延边地区羊总存栏量有12.20万头。羊源细菌性呼吸道疾病是危害羊群健康发展的关键因素，羊呼吸道病原菌种类繁多，导致难以确定呼吸道疾病的病因。由于病原菌耐药性较为复杂，为后期制定防控策略带来巨大挑战。为了了解吉林省延边地区羊源细菌性呼吸道疾病的流行情况、微生物群落结构及耐药性，进行系统的流行病学调查，本研究针对延边地区八个县市的规模化养殖场和散养户养殖的高风险羊群建立抽样框架，根据疫情上报系统采集延边地区不同养殖场/户羊只的鼻拭子样本，并通过革兰氏染色、显微镜观察、生化鉴定以及16SrDNA序列分析对细菌进行分离鉴定，探究引起羊呼吸道疾病的主要细菌种类和分布情况。使用药敏纸片法对分离的细菌进行耐药性测试，通过测量抑菌圈的大小评估细菌对20种如大环内酯类、磺胺类、氨基糖苷类等不同类别抗生素的敏感性，并通过PCR技术对分离到最多的菌株的耐药基因进行测序分析。　　分离结果显示，从延边地区各县市的67个散养户和10个规模化养殖场采集209份鼻腔样本，共分离到151株与呼吸道疾病相关的细菌，延边地区总体分菌率为72.25％,延吉市的分菌率最高为80.65％,安图县的分菌率最低仅为57.89％。延吉市、敦化市、珲春市高于延边地区总体平均分菌率，图们市、和龙市、龙井市、汪清县、安图县低于延边地区总体平均分菌率。在延边地区共检测出肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、变形杆菌、金黄色葡萄球菌、嗜麦芽窄食单胞菌、肺炎链球菌等18种病原菌。金黄色葡萄球菌所有县市均检测到，但该细菌在各县市的阳性率并不高;铜绿假单胞菌在延吉市、敦化市、图们市、龙井市、珲春市、汪清县检出;变形杆菌在敦化市、和龙市、珲春市、龙井市检出;肺炎克雷伯菌在延吉市的检出率最高为35.71％;鲍曼不动杆菌在敦化市检出率最高29.41％;肺炎链球菌在敦化市的检出率最高66.66％。耐药性结果显示，细菌分离株对选取的20种药敏纸片呈现出不同程度的耐药，对磺胺嘧啶、青霉素、磺胺异唑、克林霉素、复方新诺明相对耐药，对四环素、恩诺沙星、庆大霉素、加替沙星、环丙沙星、左氧氟沙星相对敏感，在针对延边地区的用药习惯选取的两种磺胺类药物耐药率均在50％以上。有145株显示对两种或两种以上抗生素具有耐药性，占分离总数的96.03％。共鉴定出58种不同的耐药组合，这反映出延边地区病原体的耐药性不仅广泛，而且具有多样性。延边地区的耐药表型情况不同，其中存在仅耐一种抗生素和耐多种抗生素的情况，分离到的细菌最多存在耐十二种抗生素。其中，耐七种抗生素的占所有耐药类型比例最高为22.41％,耐六种抗生素的占所有耐药类型比例为18.97％。最常见的七耐耐药表型为SUZ/CTX/CTR/PEN/CC/S/AMP;最常见的六耐耐药表型为SUZ/SF/PEN/CC/SXT/AMP。对全部28株肺炎克雷伯菌进行耐药基因检测，检测结果显示，β-内酰胺类blaTEM的检出率为21.43％ (6/28),blaSHV的检出率为89.29％ (25/28)，blaKPC的检出率为17.86％ (5/28);四环素类未检测出耐药基因;氯霉素类cat1的检出率为10.71％(3/28);氨基糖苷类aac(6'')-Ib的检出率为7.14％ (2/28)，Aph(3 '' )-I的检出率为10.71％ (3/28);喹诺酮类未检测出耐药基因;磺胺类未检测出耐药基因;大环内酯类ereA的检出率为14.29％ (4/28),ermA的检出率为7.14％ (2/28)。耐药基因的分析为理解细菌耐药机制提供分子层面的证据，为制定防治措施奠定基础。　　综上所述，延边地区羊源呼吸道分离的主要细菌具有多样性和多重耐药性，不同抗生素的使用频率和选择压力之间存在差异。延边地区羊源呼吸道细菌对抗生素的耐药与耐药基因的存在有一定关联。本试验为吉林省延边地区提供系统的羊源细菌性疾病的相关调查数据，为延边地区羊养殖业的发展规划提供基础数据。本试验将延边地区多种抗生素的耐药性进行归纳总结，并对分离到最多的细菌进行耐药基因的分析，为防治延边地区羊源呼吸道细菌性疾病提供科学依据，以此牢筑公共卫生防护屏障。

关键词： 恶性肿瘤   流行病学   疾病负担   防控策略  

摘要： 目的：本研究对 2013-2019年蒙自市恶性肿瘤发病死亡状况及其变化趋势进行分析，并评估恶性肿瘤对当地居民造成的疾病负担，旨在明确该市恶性肿瘤防控的重点人群及主要癌种，为当地评价肿瘤防控工作效果、制定具有针对性的防控策略提供基础信息和参考依据，同时也为相关病因学研究提供线索。　　方法：收集“中国肿瘤信息登记平台”中登记的发病死亡时间在2013年1月1 日至 2019 年 12 月 31 日期间，户籍地址为蒙自市的所有恶性肿瘤病例资料。用发病（死亡）率、年龄标化发病（死亡）率、发病（死亡）顺位等指标描述恶性肿瘤总体及主要癌种流行特征，用 Joinpoint 回归模型分析恶性肿瘤总体及主要癌种发病（死亡）率的时间及年龄趋势，通过伤残调整寿命年（Disability-adjusted Life Years，DALYs）及 DALY率评估恶性肿瘤疾病负担。　　结果：1. 发病情况：2013-2019 年，蒙自市共登记恶性肿瘤新发病例 5262 例（男性2839例，女性2423例），年均粗发病率和标化发病率分别为183.13/10万（男性为199.45/10万，女性为167.01/10万）、184.22/10万（男性为203.44/10万，女性为 166.74/10 万）。年均粗发病率男性显著高于女性，差异具有统计学意义（x2=39.116，P＜0.001）。发病率呈上升趋势（粗发病率：Average Annual Percent Change，AAPC=9.19%，P＜0.001;标化发病率：AAPC=8.20%，P＜0.01），上升趋势有统计学意义。恶性肿瘤总体发病率在 15 岁以下处于低发状态，在15-19岁年龄组开始上升，在 45-49岁年龄组快速上升，在 80-84岁年龄组达到峰值（960.91/10万），随年龄增加整体呈上升趋势（Average Age Percent Change， AAPC=5.81%，P＜0.001）。在地域分布上，各乡镇均有恶性肿瘤新发病例报告，文澜镇年均发病率最高（783.98/10万），西北勒乡（66.19/10万）最低，各乡镇年均发病率差异具有统计学意义（x2=9558.362，P＜0.001）。发病率排名前五的恶性肿瘤依次为肺癌（35.88/10 万）、女性乳腺癌（26.05/10 万）、肝癌（22.41/10 万）、结直肠癌（19.39/10 万）和子宫颈癌（16.79/10 万）。男性胃癌发病率呈下降趋势（AAPC=-8.06%，P＜0.05），女性乳腺癌（AAPC=11.10%， P＜0.05）、甲状腺癌（AAPC=22.10%，P＜0.05）及结直肠癌（AAPC=9.38%， P＜0.05）发病率均呈上升趋势。　　2. 死亡情况：2013-2019年，蒙自市累计登记恶性肿瘤死亡病例2819例（男性1799例，女性1020例），年均粗死亡率和标化死亡率分别为98.15/10万（男性为126.28/10万，女性为70.41/10万）、98.16/10万（男性为128.82/10万，女性为 69.10/10 万）。年均粗死亡率男性显著高于女性，差异具有统计学意义（x2=228.745，P＜0.001）。死亡率呈上升趋势（粗死亡率：AAPC=8.16%， P=0.067;标化死亡率：AAPC=6.02%，P=0.116），上升趋势无统计学意义。恶性肿瘤总体死亡率30岁以下处于低发状态，在30-34岁年龄组开始上升，在50-54岁年龄组快速上升，在80-84岁年龄组达到峰值（792.27/10万），随年龄增加整体呈上升趋势（AAPC=7.31%，P＜0.001）。在地域分布上，各乡镇均有死亡病例报告，文澜镇年均死亡率最高（359.98/10万），鸣鹫镇最低（35.85/10万），各乡镇年均死亡率差异有统计学意义（x2=3216.914，P＜0.001）。死亡率排名前五的恶性肿瘤依次为肺癌（25.67/10 万）、肝癌（18.38/10 万）、结直肠癌（8.91/10 万）、胃癌（8.52/10 万）和女性乳腺癌（5.85/10 万）。男性肺癌（AAPC=8.62%，P＜0.05）和结直肠癌（AAPC=8.27%，P＜0.05）及女性肺癌（AAPC=14.50%，P＜0.05）死亡率均呈上升趋势。　　3. 疾病负担情况：2013-2019年，蒙自市恶性肿瘤所致的DALYs为60437.90人年（男性：35757.17 人年，女性：24680.73 人年），DALY 率为 21.09‰（男性：25.15‰;女性：17.08‰）。YLLs占DALYs的96.08%（男性：96.75%;女性：95.10%）。DALY 率在 30 岁以下处于较低水平，在 30-34 岁年龄组开始上升，在65-69岁年龄

关键词： 人鼻病毒感染   宏基因组下一代测序   微生物多样性分析   宿主反应   抗生素耐药性  

摘要： 呼吸道感染在全球范围内构成重大健康威胁,其中人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)是导致儿童和成人从轻度到重度呼吸道感染的主要病原之一。在中国,HRV感染普遍存在,成为一个重要的公共卫生负担,但获得的关注较少,因此亟需深入研究,以了解其流行病学、微生物特征及宿主反应。 本研究旨在全面调查武汉地区儿童感染HRV的情况,包括确定其在大型队列中的流行率,阐明流行HRV的基因型多样性,探索年龄和性别等人口统计学关联,分析感染率的时间趋势,表征与HRV感染相关的微生物多样性,了解宿主在分子水平上的反应,并评估抗生素耐药基因的存在及其模式。 采用双重诊断方法,结合Taqman探针定量聚合酶链反应(quantitative Polymerase Chain Reaction,q PCR)和靶向下一代测序(Targeted Next-Generation Sequencing,tNGS),分析了从2021年9月到2023年9月收集的武汉地区来自不同人群的共1797份咽拭子样本。此外,还对一些阳性样本进行了宏基因组下一代测序(Metagenomic Next-Generation Sequencing,mNGS)。结果表明,Taqman探针q PCR检测到42例阳性病例,tNGS检测到206例HRV阳性病例,总阳性率为13.8%。HRV-A(46.6%)和HRV-C(47.6%)的流行率高于HRV-B。年龄和性别影响HRV感染率,其中幼儿(1-3岁)感染率最高,男患儿阳性结果比例更高。时间分析显示了HRV感染率的动态变化趋势,有明显的高峰感染时期。 微生物多样性分析显示,HRV阳性样本的微生物丰富度和多样性高于健康对照,HRV感染者与健康个体之间的β多样性也存在显著差异。微生物差异分析显示,在HRV感染者中,嗜血杆菌、奈瑟菌、链球菌和弓形虫是最丰富的属。宿主差异基因表达分析显示,HRV感染样本中有3257个基因上调,19064个基因下调。主成分分析(principal component analysis,PCA)突出显示了HRV感染组与健康组之间的明显差异,特别是在免疫激活和细胞生物学过程方面。耐药基因分析确定了对18类抗生素具有耐药性的基因,其中氟喹诺酮耐药基因最为丰富。值得注意的是,健康个体的耐药基因比HRV感染患者更多。 本研究为HRV感染的流行病学、基因型多样性、微生物特征、宿主反应和抗生素耐药谱提供了全面宝贵的见解。这些发现有助于更深入地理解HRV的流行病学和发病机制,为制定针对HRV相关呼吸道疾病的干预措施提供信息,从而减轻其对公共卫生的负担。

关键词： 手足口病   流行病学   病原学  

摘要： 【目的】 1、研究2013年～2022年云南省红河州手足口病流行病学特征和病原构成特征。为手足口病防治策略制定提供依据。 2、对2023年1～7月红河州检出的其他肠道病毒（非肠道病毒71型和非柯萨奇病毒A组16型）进行型别分析,获得红河州手足口病病原谱构成。为免疫策略制定和疫苗研发提供依据。 【方法】 通过中国疾病预防控制信息系统以病例发病日期为限定条件,下载2013～2022年红河州手足口病监测数据,采用描述流行病学分析方法,对手足口病流行特征和病原学特征进行分析;收集2023年1～7月红河州13县（市）疾控中心手足口病核酸检测结果为其他肠道病毒阳性的标本,使用荧光定量逆转录聚合酶链式反应（Reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR）、逆转录半巢式PCR（RT-seminested PCR,RT-sn PCR）和基因片段测序方法对其他肠道病毒进行病毒型别分析。 【结果】 1、2013年～2022年红河州手足口病累计报告病例83 252例,其中重症病例360例,死亡病例11例。年发病率介于262.43/10万～110.27/10万之间,呈现出以2018年为拐点,先上升（122.18/10万～262.43/10万）后下降（262.43/10万～110.27/10万）的趋势。手足口病重症率和病死率呈现下降趋势（120.20/万～12.25/万,5.38/万～0.00/万）。 2、红河州手足口病发病具有季节性,除2013年5月和2020年10月呈现单个发病高峰外,其余各年均呈现双发病高峰,分别位于4月～7月和10月～12月。 3、手足口病0～7岁儿童高发;男性发病率高于女性（1.37:1）;以散居儿童和幼托儿童为主,占总发病人数的95.80%。在各年龄组中,1岁组的发病率、重症率均为最高（4 223.04/10万,572.61/10万）,发病率与年龄呈负相关。死亡病例集中于3岁以下儿童,0岁组病死率最高。死亡病例以散居儿童为主,占比为90.91%。 4、红河州北部地区发病率和重症率高于南部地区(243.33/10万（29）59.49/10万,372.76/10万（29）231.42/10万),且差异性具有统计学意义(χ2=19 625.297,（49）(27)0.05;χ2=11.003,（49）(27)0.05)。 5、病原谱分析结果显示,2013年、2015年以肠道病毒71型（Enterovirus A71,EV-A71）为优势病原体,其次分别为柯萨奇病毒A组16型（Coxsackievirus A16,CV-A16）和其他肠道病毒。2014年CV-A16为优势病原体,EV-A71位列第二。2016～2022年其他肠道病毒成为优势病原体,CV-A16位列第二。在重症病例中,2013～2017年EV-A71为主要病原体,其次为其他肠道病毒。2018年EV-A71和其他肠道病毒（EV-A71和其他肠道病毒均为22例）同为主要病原体,CV-A16位列第二。2019～2022年其他肠道病毒为主要病原体,EV-A71位列第二。在死亡病例中,EV-A71为优势病原体,其次为CV-A16和其他肠道病毒。 6、2016年EV-A71疫苗接种后,EV-A71在手足口病病原中的占比、重症病例病原中的占比和死亡病例病原中的占比相对于疫苗接种前明显降低。 7、2023年1～7月其他肠道病毒分型结果显示手足口病病原呈现多样性,CV-A6为优势病原,其次为CV-A4。 【结论】 1、2013年～2022年红河州手足口年发病率呈现出以2018年为拐点,先上升后下降的趋势。手足口病重症率和病死率呈现下降趋势。 2、2013～2022年红河州手足口病发病呈现季节性和地区性,7岁以下儿童高发。 3、EV-A71疫苗接种后EV-A71引起的重症率和死亡率相对于疫苗接种前均有显著降低。 4、手足口病病原呈现多样性,因此有必要进行手足口病多价疫苗研发。散居儿童和幼托儿童是防控重点。提高EV-A71疫苗适种儿童（6月～5岁）的接种率,有助于降低EV-A71造成的重症和死亡。

关键词： 肉牛   寄生虫病   流行病学   临床症状   治疗措施   预防措施  

摘要： 近年来，随着人民生活质量的提高，对绿色食品的需求量越来越大，肉牛的饲养规模也越来越大。然而，在肉牛饲养过程中，各种疾病的感染，会直接影响到肉牛食品品质。其中，寄生虫的感染率逐年上升，其通过粪便、血液和尿液等途径传播虫体。牛属于群居动物，健康牛群中一旦发生寄生虫病的感染，则会迅速传播至其他健康牛，严重影响肉牛生长，也导致养殖户经济效益降低，进而影响我国肉牛养殖业的发展。笔者主要对三种寄生虫病的流行病学、临床症状、治疗措施、预防措施等进行详细阐述，以期为广大肉牛养殖户和畜牧兽医工作者提供参考。