关键词： 舟山群岛地区   蝙蝠   博卡病毒   进化分析  

摘要： 为进一步了解我国蝙蝠携带博卡病毒(Bocavirus)的分布状况和遗传多样性特征,本研究采集舟山群岛地区4种蝙蝠的肠组织样本,使用套式PCR方法进行蝙蝠博卡病毒检测,分析该地区蝙蝠携带博卡病毒的遗传多样性。结果显示,从141只蝙蝠(菲菊头蝠、马铁菊头蝠、大卫鼠耳蝠和渡濑式鼠耳蝠)体内共检测出7份博卡病毒的DNA目的条带,经测序后获得5条博卡病毒序列,系统进化分析表明蝙蝠源博卡病毒同已发现的其他博卡病毒属于不同的进化分支。序列遗传进化分析显示,5条序列的同源性介于98.9%~100%之间,与其他博卡病毒的同源性介于50.8%~77.2%之间;根据ICTV关于博卡病毒属新种的判定标准,该地区检测出蝙蝠源博卡病毒为新的博卡病毒种类。

关键词： 蝙蝠   粪便   病毒   聚合酶链式反应(PCR)   肠道病毒   轮状病毒   冠状病毒  

摘要： 主要内容:蝙蝠种类多、分布广,研究发现蝙蝠是具有“飞行能力的病毒库”,是多种人兽共患病和新发传染病的储存宿主。蝙蝠粪便污染水源、食物后会传播病原体,造成疾病流行。2010年以来国内外多个团队对蝙蝠肠道粪便标本做了宏基因组学以及PCR特异性扩增,从蝙蝠肠道中检测发现多种病毒,其中冠状病毒、肠道病毒、轮状病毒与人类疾病有密切关系,既往报道提示从蝙蝠粪便标本中分离到冠状病毒和轮状病毒,而未见肠道病毒分离的相关报道。目的:本文主要对蝙蝠肠道携带的病毒的地域分布进行描述以及整理,为今后对病毒在地域分布方面的研究提供线索。

关键词： 蝙蝠,重症急性呼吸综合征样冠状病毒   WIV1   浣熊狗   人类血管紧张素转换酶Ⅱ   跨膜丝氨酸蛋白酶2  

摘要： 目的研究蝙蝠来源的重症急性呼吸综合征(SARS)样冠状病毒WIV1刺突蛋白利用浣熊狗血管紧张素转换酶Ⅱ(ACE2)受体侵入细胞的能力,并探究SARS样冠状病毒WIV1潜在的跨宿主传播风险。方法构建来自浣熊狗、果子狸、中华菊头蝠和人等不同动物来源的ACE2表达质粒,转染至293T细胞并利用免疫印迹方法检测其在293T细胞中的表达水平;建立SARS冠状病毒(Tor2株系)及蝙蝠SARS样冠状病毒(WIV1株系)假病毒感染系统,并进行假病毒感染实验;利用假病毒感染系统及荧光素酶报告基因检测WIV1刺突蛋白对浣熊狗等不同动物来源ACE2受体利用能力;构建跨膜丝氨酸蛋白酶2(TMPRSS2)质粒,并转染至T Rex 293细胞,借助假病毒感染系统检测TMPRSS2对WIV1侵入能力的影响。结果本研究所获赠及构建的不同动物来源的ACE2质粒可经瞬时转染至细胞进行表达;与pc DNA3.1载体相比,浣熊狗、中华菊头蝠、果子狸和人的ACE2均可使蝙蝠SARS样冠状病毒WIV1侵入细胞的能力增加上万倍,上述ACE2组与载体组的荧光素酶活性差异均具有统计学意义(t=27.744、P<0.001,t=18.740、P<0.001,t=32.297、P<0.001,t=15.902、P<0.001);与TMPRSS2阴性组相比,TMPRSS2在靶细胞的表达可使WIV1假病毒的感染能力增加10倍以上,两组荧光素酶活性差异具有统计学意义(t=29.460、P<0.001)。结论蝙蝠SARS样冠状病毒WIV1的刺突蛋白除了利用人类、果子狸及中华菊头蝠的ACE2受体感染细胞,还可利用浣熊狗的ACE2受体侵入细胞,且TMPRSS2可显著促进其侵入能力,提示WIV1可能存在多种跨宿主传播的风险。

关键词： 星状病毒   蝙蝠   人兽共患   跨种传播  

摘要： 星状病毒分为禽星状病毒属和哺乳动物星状病毒属,蝙蝠星状病毒属哺乳动物星状病毒属.蝙蝠感染星状病毒并不表现临床症状,但是近年来的研究显示出星状病毒具有流行广泛性、宿主和基因多样性的特点.而蝙蝠作为唯一能飞行并且携带多种人兽共患病病毒的哺乳动物,研究其星状病毒的流行情况及人兽共患潜力变得尤为重要,本综述就近年来蝙蝠中星状病毒相关研究及星状病毒中存在的人兽共患潜力进行综述,为后续星状病毒的研究提供参考.

关键词： 桂越边境地区   蝙蝠   病毒宏基因组学   遗传多样性  

摘要： 桂越地区包括越南和我国广西,地理位置的战略意义突出,该地区蝙蝠资源丰富,且越南境内的蝙蝠携带多种人兽共患病毒.为了监测桂越边境地区蝙蝠病毒的跨境传播,防范蝙蝠病毒引发新发传染病,掌握该地区蝙蝠携带病毒的病原本底和重要病毒遗传进化特征具有重要意义.本研究在桂越边境采集蝙蝠样本并对其进行病毒宏基因组学分析,结果发现了49个科的病毒,包括脊椎动物病毒、植物病毒、昆虫病毒和噬菌体.根据病毒宏基因组学结果,对注释到的嗜肝DNA病毒、博卡细小病毒、A型轮状病毒、星状病毒、弹状病毒和冠状病毒进行检测和进化分析,结果发现星状病毒广泛分布,且具有丰富的遗传多样性;其他病毒则呈局部分布,其中嗜肝DNA病毒、冠状病毒、轮状病毒与各自参考毒株进化关系较近,为这些病毒的变异毒株;而博卡细小病毒和弹状病毒与已知病毒具有很明显的遗传差异性,可能为病毒新种;值得注意的是,发现的蝙蝠轮状病毒与广西当地人轮状病毒具有很高的同源性,提示该病毒的跨种传播和基因重排.本研究获得了桂越边境地区蝙蝠携带病毒的本底数据以及部分重要病毒在该地区蝙蝠中的流行情况和遗传进化特征,为监测蝙蝠病毒的跨境传播、防范新发病毒病提供了重要的基础数据.

关键词： 蝙蝠   轮状病毒   进化分析  

摘要： 为监测东南沿海舟山地区蝙蝠携带轮状病毒的流行情况,探索其流行机制,2015—2018年,在浙江省舟山地区采集蝙蝠,以蝙蝠肠组织为模板,设计针对轮状病毒VP3序列的特异引物进行RT-PCR检测。结果显示,2015年采集的65只蝙蝠,轮状病毒阳性率为6.15%(4/65),2016年采集的48只蝙蝠,阳性率为2.08%(1/48),2017年采集的70只蝙蝠,阳性率为2.86%(2/70),而2018年采集的101只蝙蝠,未检测到轮状病毒序列。针对2017年小菲菊头蝠Rhinolophus hipposideros体内发现的一株轮状病毒进行基因组扩增,获取部分基因组序列并进行生物信息学分析,发现VP7基因序列与蝙蝠源轮状病毒相似度最高,同源性为96%;VP3基因序列与人源轮状病毒同源性为90%;VP6基因序列与猫同源性为95%。根据上述结果,我们推测舟山蝙蝠来源轮状病毒是一株重组病毒株,具有潜在跨种传播给人类的可能性。本研究系首次在东南沿海舟山地区蝙蝠体内检测到轮状病毒,对该地区轮状病毒的监测和预警具有一定的公共卫生意义。

关键词： 高通量测序   细小病毒   蝙蝠   核酸检测  

摘要： 为了研究中国东南沿海地区蝙蝠作为媒介和宿主携带重要人兽共患病毒的种类及分布情况,分析蝙蝠传播病毒的可能性,从东南沿海地区多个采样点采集了一定数量的成年蝙蝠样本,取部分肠道组织样本进行处理后,用高通量测序和生物信息学对其携带病毒的核酸序列进行了提取和分析。结果显示,蝙蝠携带多种昆虫病毒、植物病毒和脊椎动物病毒,其中细小病毒读长占比最多,15 012个病毒读长中有12 894个是细小病毒序列。针对高通量测序结果,对蝙蝠携带的细小病毒进行了鉴定与分析,并获取了大部分编码区基因,同源比对发现与BtRf-PV病毒株和SX2013株同源性最高,为91%。在采集的268只蝙蝠中,检测到16只携带细小病毒,阳性率为5.9%。

关键词： 汉坦病毒   自然传播   肾综合征出血热   蝙蝠   啮齿动物   人兽共患   人类健康   自然宿主  

摘要： 汉坦病毒(HV)是严重威胁人类健康的重要人兽共患病原体。啮齿动物是该病原公认的自然宿主和传播动物,人感染后引起肾综合征出血热(Hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)和汉坦病毒心肺综合征(Hantavirus cardiopulmonary syndrome,HCPS)二种疾病。前者主要在欧亚大陆流行,而后者主要在美洲流行。每年全球报告约10万例肾综合征出血热和近千例汉坦病毒心肺综合征。我国是肾综合征出血热流行比较严重的国家,仅2017年发病人数就高达11 262例,其中死亡病例64人。

关键词： 吸血蝙蝠   牛   狂犬病   基本再生数  

摘要： 根据吸血蝙蝠与牛之间狂犬病毒的传播机理建立数学模型,获得了吸血蝙蝠中狂犬病毒的传播阈值,分析了吸血蝙蝠系统中平衡点的稳定性,进一步讨论了牛群中狂犬病毒的传播,获得了正平衡点存在的条件。最后,对模型中的免疫率进行了敏感性分析。

关键词： 蝙蝠   蜱虫   宏病毒组学   微小RNA病毒   病毒分离  

摘要： 蝙蝠种类多、分布广,是多种人兽共患病的自然宿主,如严重急性呼吸综合征病毒(Severe acute respiratory syndromes virus)、中东呼吸综合征病毒(Middle-east respiratory syndromes vius)、尼帕病毒(Nipah virus)、狂犬病毒(Rabies virus)及埃博拉病毒(Ebola virus)等。广西因独特的地理位置具有十分丰富蝙蝠资源,但该地区蝙蝠的种类、分布及携带的病毒多样性等还不完全清楚。本研究利用形态学和分子生物学方法,对在桂林、柳州、河池等地区的18个县、区采集到的617只蝙蝠样品进行分类和鉴定。结果鉴定出12种蝙蝠,分别为大蹄蝠(Hipposideros armiger)、中蹄蝠(Hipposidero larvatus灰蹄蝠(Hipposideros cineraceus)、果树蹄蝠(Hipposiderospomona)、普氏蹄蝠(Hipposideros partti)、皮氏菊头蝠(Rhinolophus pearsoni)、托氏菊头蝠(Rhinolophus thomasi)、大耳菊头蝠(Rhinolophus macrotis)、小菊头蝠(Rhinolophus pusillus)、普通长翼蝠(Minipopterus schreibersii)、小黄蝠(Scotophilus kuhlii)和南长翼蝠(Miniopterus pusillus),其中小黄蝠共有133只(21.5%),果树蹄蝠132只(21.4%),中蹄蝠129只(20.9%),其他蝙蝠数量在1-51只之间不等。应用高通量测序技术(High-throughput sequencing,HTS)对这些蝙蝠的肠道组织开展宏病毒组学研究。结果共得到89825条reads注释到病毒序列,其中有37426条(41.7%)reads与噬菌体相关,49828条(55.47%)与真核生物病毒相关,另外还有2571条(2.8%)reads未注释到已知病毒序列。与真核生物相关的病毒序列,主要涉及副黏病毒科(Paramyxoviridae)、弹状病毒科(Rhabdoviridae)、丝状病毒科(Filoviridae)、冠状病毒科(Cornaviridae)、细小病毒科(Parvoviridae)、双顺反子病毒科(Dicistroiridae)、软腐病毒科(Iflaviridae)、小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)、星状病毒科(Astroviridae)、杆状病毒科(Baculoviridae)和嗜肝病毒科(Hepadnaviridae)等30多个病毒科。其中脊椎动物病毒有51种,主要有蝙蝠冠状病毒(Bat coronavirus)、蝙蝠星状病毒(Bat astrovirus)、蝙蝠嗜肝病毒(Bat hepatitis B virus)、甲型肝炎病毒(Hepatitis A virus)和人双埃柯病毒(Human parechovirus)等。昆虫病毒有18种,主要为茶尺蠖病毒(Ectropis obiqua virus)和直尺蠖病毒(Perina nuda virus)。植物病毒主要为斐济病毒属(Fijvirus)的斐济病毒(Fijivirus)。噬菌体主要是一些肠道细菌的噬菌体,涉及基尾噬菌体科(Myoviridae)、短尾噬菌体科(Podoviridae)、长尾噬菌体科(Siphoviridae)、丝状噬菌体科(Inoviridae)、微小噬菌体科(Microviridae)和光滑噬菌体科(Leviviridae)。将这些脊椎动物病毒相关的reads进行组装后,得到485条Contigs,比对发现共有342条(75%)Contigs能够比对到NCBI数据库中已知的病毒序列。基于这些序列信息,进行分析后发现,广西蝙蝠中的蝙蝠星状病毒与已知的蝙蝠星状病毒的差异较大,可能是新的蝙蝠星状病毒;广西的蝙蝠冠状病毒与Bat coronavirus(BtCoV/512/2005)核苷酸相似性为98%,亲缘关系较近;广西蝙蝠中的杯状病毒和嗜肝病毒与已知病毒相似性较高,可能是已知病毒的变异株;广西蝙蝠中的蝙蝠博卡病毒与已知蝙蝠博卡病毒相似性较低,可能是蝙蝠博卡病毒中新的病毒株。利用PCR方法,对广西蝙蝠携带的微小RNA病毒目(Piconrnfaviriales)中的相关病毒进行验证。结果显示广西蝙蝠主要携带七种微小RNA病毒,分别为:甲型肝炎病毒(Hepatovirus A virus)、南蝠微小RNA病毒(Ia io picornavirus)、Shanbavirus、蝙蝠双埃柯病毒(Bat parechovirus)、直尺蠖小RNA样病毒(Perina nuda picorna-