关键词： Antimicrobial responses   Evolutionary genetics   SARS-CoV-2   Virology  

摘要： There have been several major outbreaks of emerging viral diseases, including Hendra, Nipah, Marburg and Ebola virus diseases, severe acute respiratory syndrome (SARS) and Middle East respiratory syndrome (MERS)-as well as the current pandemic of coronavirus disease 2019 (COVID-19). Notably, all of these outbreaks have been linked to suspected zoonotic transmission of bat-borne viruses. Bats-the only flying mammal-display several additional features that are unique among mammals, such as a long lifespan relative to body size, a low rate of tumorigenesis and an exceptional ability to host viruses without presenting clinical disease. Here we discuss the mechanisms that underpin the host defence system and immune tolerance of bats, and their ramifications for human health and disease. Recent studies suggest that 64 million years of adaptive evolution have shaped the host defence system of bats to balance defence and tolerance, which has resulted in a unique ability to act as an ideal reservoir host for viruses. Lessons from the effective host defence of bats would help us to better understand viral evolution and to better predict, prevent and control future viral spillovers. Studying the mechanisms of immune tolerance in bats could lead to new approaches to improving human health. We strongly believe that it is time to focus on bats in research for the benefit of both bats and humankind.

摘要： In this study, we analyzed the viral population in oropharyngeal samples from T. brasiliensis using a viral metagenomic approach. Genomes corresponding to members of the families Circoviridae, Genomoviridae, Herpesviridae, Paramyxoviridae, Coronaviridae, and Astroviridae were detected. This study provides the first preliminary understanding of the oropharyngeal virome of T. brasiliensis, which may guide the discovery and isolation of novel viruses in the future and highlights the need for continuing investigations in this regard.

关键词： Bats   Viruses   Evolution   Anthropocene   Transmission   Cross-Species  

摘要： Bats have populated earth for approximately 52 million years, serving as natural reservoirs for a variety of viruses through the course of evolution. Transmission of highly pathogenic viruses from bats has been suspected or linked to a spectrum of potential emerging infectious diseases in humans and animals worldwide. Examples of such viruses include Marburg, Ebolavirus, Nipah, Hendra, Influenza A, Dengue, Equine Encephalitis viruses, Lyssaviruses, Madariaga and Coronaviruses, involving the now pandemic Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Herein, we provide a narrative review focused in selected emerging viral infectious diseases that have been reported from bats. (C) 2020 The Author(s). Published by Elsevier Ltd on behalf of International Society for Infectious Diseases.

关键词： 弹状病毒   动物宿主   地理分布   分子流行病学  

摘要： 蝙蝠是世界第二大类哺乳动物，其独特的免疫系统与特殊的生活习性使其成为多种新发及再发传染性病毒的携带者与传播者，其中最为人所熟知的蝙蝠相关病毒之一是来自弹状病毒科（Rhabdoviridae）的狂犬病毒(Rabies virus)。弹状病毒科的成员拥有丰富的遗传多样性，目前为止，该科包含30个病毒属，超过200个病毒种，分布于除南极洲外的世界各个大陆。同时，弹状病毒科成员的宿主种类也异常丰富，其可感染的生物包括:植物、无脊椎动物、爬行动物、鱼类、鸟类和多种哺乳动物。与蝙蝠有关的弹状病毒分布于4个弹状病毒属:狂犬病毒属（Lyssavirus）、水疱口炎病毒属（Vesiculovirus）、勒当泰病毒属（Ledantevirus）和阿尔法线虫弹状病毒属（Alphanemrhavirus），其中狂犬病毒属包含多种致命病毒，且绝大多数都被检测或分离于蝙蝠，因此蝙蝠也被认为是狂犬病毒属成员的自然宿主。但是，蝙蝠相关狂犬病毒以及其他弹状病毒的地理分布，以及在不同地区的流行情况还不是十分清楚，尤其是在以中国为主的广大东亚地区。　　为了填充该地区蝙蝠狂犬病毒的研究空白，我们使用分子检测技术对来自中国21个省级行政区的4576份蝙蝠样品（1044份蝙蝠脑组织样品，3532份蝙蝠咽拭子样品）进行狂犬病毒筛查，结果显示，所有蝙蝠样品均为狂犬病毒阴性，在蝙蝠脑组织样品中检测到6株新型弹状病毒。全基因组序列分析显示，这6株弹状病毒分别属于水疱口炎病毒属和勒当泰病毒属的3个病毒种，并被命名为太乙蝙蝠病毒(Taiyi bat virus，TYBV)、隐水蝙蝠病毒(Yinshui bat virus，YSBV)和琼中蝙蝠病毒(Qiongzhong bat virus，QZBV)。随后，我们设计和优化了一种广谱的弹状病毒巢式定量RT-qPCR和标准检测流程。通过测试来自非洲与欧洲九个国家的1962份蝙蝠样品（423份蝙蝠咽拭子样品，816份蝙蝠血液样品和723份蝙蝠脑组织样品），发现23份弹状病毒阳性样品，高通量测序和病毒序列分析显示这些病毒均为水疱口炎病毒属的一个新病毒种，并被命名为地中海蝙蝠病毒(Mediterranean bat virus，MBV)。在进行蝙蝠相关弹状病毒研究的同时，我们还使用高通量测序的技术获得了20条宿主多样的弹状病毒基因组序列，这些弹状病毒的宿主包括昆虫、鸟类、鱼类和牛。病毒序列分析显示，这些病毒来自4个弹状病毒属，15个弹状病毒种。这些研究结果不仅极大的拓展了我们对弹状病毒的认识，也为有关弹状病毒遗传进化的研究提供新的思考方向，并为弹状病毒相关领域更深入的研究打下基础。

关键词： 蝙蝠   粪便   直肠   腺病毒  

摘要： 目的了解云南省蝙蝠粪便携带病毒的情况有利于采取相关的防控措施阻断疾病的传染源和传播途径,对新发传染病的预防、防控提出指导意见,具有深远的公共卫生学意义。方法本研究通过对祥云县的蝙蝠粪便样本核酸提取、逆转录制备cDNA文库、PCR扩增的方法检测祥云县蝙蝠携带的RNA病毒和DNA病毒的情况,将阳性样本送出测序。结果 1种DNA病毒(腺病毒扩增1种基因片段)和5种RNA病毒(轮状病毒扩增3个基因片段,其余4种病毒包括肠道病毒、黄病毒、乙脑病毒、甲病毒每种病毒扩增1种基因片段)的探查,共扩增8个基因。腺病毒扩增DPOL基因后有84份标本阳性,随机选取5份送去测序。其余的基因片段扩增均为阴性。腺病毒与2010年发现的蝙蝠源哺乳动物腺病毒1285-YN-Mr核苷酸序列相似度为96%。结论本次测序的腺病毒阳性样本均在进化树蝙蝠腺病毒分支上,与云南蝙蝠、中国北方的蝙蝠腺病毒处于同一分支,说明还是具有一定的相似性,但本次5个病毒株在次级分支是独立成一支,说明与之前发现的蝙蝠腺病毒还是稍有不同,尤其是XYBF201710、XYBF201730、XYBF201740、XYBF201755在同一簇,而XYBF201784独立成一簇,表明XYBF201784与其他几株还是有不同,可能存在变异。

关键词： 蝙蝠   呼肠孤病毒   蛛蝇   体表寄生虫   系统进化分析  

摘要： 目的明确云南省不同地区蝙蝠及其体表寄生虫来源呼肠孤病毒的种群分类情况,分析其与同属其他病毒之间的进化关系,探讨我国西南边境地区蝙蝠携带呼肠孤病毒的基本情况以及蝙蝠源呼肠孤病毒对人的潜在致病性。方法本课题组前期从云南省西双版纳州棕果蝠体表吸血昆虫蛛蝇(2株)和德宏州棕果蝠脾脏组织(1株)中分离获得3株病毒分离物,样本编号为MLBC1302、MLBC1313、WDBP1716。为进一步鉴定和明确这3株病毒所处的分类地位,本研究使用RNA提取试剂盒提取3株病毒分离物中的RNA,通过病毒核酸琼脂糖凝胶电泳实验观察病毒的基因组模式,然后设计合成相关引物进行反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增3株病毒分离物的全基因序列;得到病毒序列信息后先通过Blast在线软件进行序列同源比对,再利用Clustal X(1.83)软件和DNAStar软件包中的Meg Align完成多序列核苷酸和氨基酸同源性分析;对拼接完整的基因节段使用ORFfinder在线工具寻找开放阅读框,并进行蛋白预测;最后使用MEGA7.0软件完成基于Neighbour-Joining(NJ)方法的进化树绘制,Bootstrap值设定为1 000。结果1.病毒提取RNA后直接进行琼脂糖凝胶电泳,3份病毒样本出现几乎相同的电泳条带类型,并且符合正呼肠孤病毒的基因组迁移模式特征。2.通过RT-PCR扩增实验成功获得WDBP1716病毒株几乎完整的全基因序列,以及MLBC1302和MLBC1313病毒株的部分基因序列,经序列同源性比对,他们与正呼肠孤病毒属中的PRV种群成员相似度最高,各基因节段之间存在序列同源性差异,其中WDBP1716病毒株的S1节段是独特的三顺反子,具有与PRV物种成员相似的蛋白编码排列模式,并且编码细胞黏附蛋白σC的氨基酸序列与感染人类的卡姆帕病毒和HK 46886/09病毒株之间的相似度最高,表明其可能具有感染人类的潜力。3.对MLBC1302、MLBC1313、WDBP1716病毒分离株的系统进化分析表明,3个病毒分离株都和PRV病毒种群成员聚在一起,他们主要和云南省沧源县蝙蝠中分离的沧源病毒和马来西亚人类咽拭子标本中分离的马六甲病毒、卡姆帕病毒、西卡马特病毒等密切相关。结论1.云南省西双版纳州勐腊县棕果蝠体表吸血昆虫蛛蝇(2株)和德宏州畹町镇棕果蝠脾脏组织(1株)中分离获得的3株病毒分离物MLBC1302、MLBC1313、WDBP1716被鉴定为PRV种群成员。2.在云南省与东南亚接壤的勐腊和畹町两个边境县地区,蝙蝠携带的正呼肠孤病毒可能与马来西亚感染人的一些正呼肠孤病毒发生了基因重配。***1716病毒株的全基因特征分析表明其可能具有感染人类的潜力,应加强我国蝙蝠源正呼肠孤病毒引起人和动物感染的调查研究。

摘要： Bats harbor diverse viruses and manifest distinct antiviral immune responses. Recently in Cell Host & Microbe, Boys et al. demonstrated that bat receptor transporter protein 4 (RTP4) is an innate antiviral effector that inhibits flavivirus replication, revealing an evolutionary arms race between flaviviruses and their hosts.

关键词： 蝙蝠   病毒   天然免疫   炎症反应   干扰素  

摘要： 近年来,健康的蝙蝠体内检测到了很多与人类传染病相关的病毒,包括狂犬病病毒(Rabies virus)、埃博拉病毒(Ebola virus)、严重急性呼吸综合征病毒(SARS-CoV)以及最近新出现的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)等。与其他哺乳动物不同,蝙蝠在感染了这些病毒后不会表现出明显的临床症状。因此,人类可以通过研究蝙蝠的免疫系统获得抗病毒免疫的新知识。本文综述了蝙蝠抗病毒天然免疫研究的最新进展,指出了蝙蝠在天然免疫方面的特殊性:蝙蝠独有的飞行能力可能导致其演化出一套独特的抗病毒免疫响应机制,同时具有一套独特的机制限制炎症反应。蝙蝠物种的多样性丰富(超过1 400种),超过了哺乳动物的五分之一。因此对蝙蝠免疫基因的多样性研究,将促进对蝙蝠特殊免疫机制的理解,对人类传染病防治和畜牧业发展具有重要意义。

摘要： The isolation of Hendra and Nipah viruses from bats in the vicinity of the outbreaks, and the subsequent detection of coronaviruses similar to the severe acute respiratory syndrome coronavirus from various bat species, led to speculation that bats may be reservoirs for potentially zoonotic viruses. The book Bats and Viruses, Current Research and Future Trends, edited by Eugenia Corrales-Aguilar and Martin Schwemmle, aims to compile current (as of 2018 and some cases, late 2019) information on bat viruses, bat immunological responses to viral infection, the search for new bat viruses by metagenomics technologies and isolation techniques, and the establishment bat colonies to explore bat–virus interactions. In the book's final chapter the authors address the question “Are bats special?” and speculate how the need to detoxify by-products of heightened activity required for flight may have led to the evolution of increased threshold for detection of pathogen and damage-associate molecular patterns and a decrease in the threshold for protective responses once triggered.