关键词： 蝙蝠   β冠状病毒   RT-PCR   qRT-PCR  

摘要： 目的 对云南省清华洞蝙蝠粪便中冠状病毒（coronavirus，CoV）进行定性和定量检测。方法 用逆转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）对CoV进行定性检测，用生物信息学软件进行同源性与遗传进化分析。建立逆转录实时荧光定量PCR（qRT-PCR）方法，对CoV进行定量检测。结果 共采集棕果蝠粪便样本306份，RT-PCR检测CoV阳性率为7.8%（24/306），检测到的24株CoV均为β-CoV，与NCBI中其它β-CoV核苷酸相似性为86.8%～100.0%；氨基酸相似性为95.2%～100.0%；qRT-PCR检测CoV阳性率为18.6%（57/306），比RT-PCR检出率高(χ2=25.3，P<0.05)；β-CoV平均病毒载量为1.3×103拷贝数/μL。结论 云南省清华洞蝙蝠携带β-CoV，建立的qRT-PCR方法具有很好的敏感性、准确性和重复性，qRT-PCR检出率高于RT-PCR，可对蝙蝠β-CoV进行快速检测。

关键词： 蝙蝠   冠状病毒   丝状病毒   汉坦病毒   新发传染病  

摘要： 自2003年严重急性呼吸综合征(SARS)暴发以来，蝙蝠携带病毒已成为新发传染病领域的研究热点。目前，通过各种检测技术已从蝙蝠中发现了超过200种能感染脊椎动物的病毒，其中包括一些高风险的冠状病毒、丝状病毒、汉坦病毒等。这些病毒的发现不仅丰富了我们对蝙蝠源病毒多样性的认识，也为防范潜在的蝙蝠源新发传染病提供了重要数据。尽管蝙蝠携带病毒的研究取得了显著进展，但在风险评估、蝙蝠免疫机制等方面仍需进一步加强。本文总结了我国发现的重要蝙蝠源病毒，并对冠状病毒、丝状病毒、汉坦病毒及其他重要病毒进行了综述，同时展望了未来蝙蝠源病毒的研究方向，以期为我国蝙蝠携带病毒的研究提供参考。

关键词： 汉坦病毒   基因多态性   分布特征   蝙蝠  

摘要： 近年来,全球多地证实除啮齿类动物、食虫类动物外,蝙蝠为汉坦病毒的又一重要宿主动物。蝙蝠汉坦病毒作为一种新发现的汉坦病毒,其病原学特征、基因结构以及分布特征等并不十分清楚,不利于科学防控蝙蝠汉坦病毒引起的疾病。本综述概述了蝙蝠汉坦病毒的发现、基因多态性和地理分布特征等,对深入认识新发现的蝙蝠汉坦病毒、精准防控疫情具有指导意义。

关键词： 蝙蝠蛾拟青霉枸杞胶囊   增强免疫力   保健食品  

摘要： 文章通过实验研究探讨了蝙蝠蛾拟青霉枸杞胶囊对小鼠免疫力增强的功能,按照人体推荐量的5、10、20倍设置了低(0.225 g·kg^(-1)·BW^(-1))、中(0.450 g·kg^(-1)·BW^(-1))、高(0.900 g·kg^(-1)·BW^(-1))剂量组以及一组空白对照组。经过连续灌胃实验并对各项指标进行检测,测量小鼠的脾淋巴细胞增殖量、小鼠的单核-巨噬细胞碳廓清功能、NK细胞活性、体重、胸腺/体重比值、脾脏/体重比值、小鼠的迟发型变态反应、血清溶血素水平及腹腔巨噬细胞的吞噬能力,并与空白对照组比较。实验结果显示该受试物中剂量组能显著提高小鼠抗体生成细胞数及NK细胞活性,高剂量组的受试物能显著提高小鼠淋巴细胞增殖能力、抗体生成细胞数、碳廓清能力及NK细胞活性,且受试物不会对小鼠体重增长产生不良影响。依据《保健食品功能检验与评价方法》(2023年版)判定标准,蝙蝠蛾拟青霉枸杞胶囊具有增强免疫力的功能。

关键词： 心脏损伤   ACE2   冠状病毒   重症患者   侵入细胞   蝙蝠   心率和血压   博士后  

摘要： 日前,西北大学生命科学学院博士后郭媛婷及其合作者在蝙蝠抗冠状病毒的起源机制研究方面取得新进展。血管紧张素转化酶2(ACE2)是新冠病毒SARS-CoV-2侵入细胞的主要受体,而它原本的功能是调节心率和血压。ACE2两种功能之间存在着紧密联系,如感染SARS-CoV-2的仓鼠和新冠重症患者通常会出现心脏损伤。

关键词： 人畜共患病   共感染   病毒组   蝙蝠   溢出   多样性   云南省  

摘要： 蝙蝠是许多人畜共患病病毒的储备宿主。但是关于个体蝙蝠内病毒的多样性和丰度的了解还较少,因此它们之间病毒共感染和溢出的频率也不清楚。我们用无偏的元转录组学方法,对中国云南省采样的149只个体蝙蝠中携带的哺乳动物相关病毒进行了表征。结果显示研究的动物中病毒的高频共感染(即蝙蝠个体同时感染多种病毒物种)和溢出,这可能进一步促进病毒的重组和再组合。

关键词： 蝙蝠   冠状病毒   检测方法   病毒传播  

摘要： 蝙蝠作为唯一会飞行的哺乳动物,种类繁多,分布广泛,具有长距离飞行的能力,冬季冬眠,是多种病毒的自然储存宿主,这些特性导致蝙蝠更容易携带病毒并传播给其他动物和人类。由于新一代病毒检测技术的问世,近年来蝙蝠冠状病毒的数量和种类呈现快速增长趋势。早前该病毒的影响随着时间的推移逐渐淡化出人们的视线,而2019年新型冠状病毒的爆发流行使蝙蝠冠状病毒(BtCoV)又一次引起全世界的广泛关注,这让人们深刻意识到该病毒对动物及人类社会的潜在威胁仍然存在。本文主要从蝙蝠自身、蝙蝠与冠状病毒的相关生理特性、蝙蝠冠状病毒的检测方法及近20年影响较大的蝙蝠冠状病毒等几个方面进行了综述。

关键词： 蝙蝠   病毒组   生态驱动因素   人兽共患病   新发传染病  

摘要： 蝙蝠是多种新发病毒的自然宿主,COVID-19的全球大流行更是加剧了人们对蝙蝠作为新发病毒库的关注。蝙蝠是仅次于啮齿动物的第二大哺乳动物类群,因其独特的免疫系统,能够在不发病的状态下携带并传播多种病原体,包括马尔堡病毒、SARS冠状病毒、亨德拉病毒和狂犬病毒等人兽共患病毒。我国拥有丰富的蝙蝠资源,已知的蝙蝠种类多达141种,隶属于7个科、34个属,而蝙蝠体潜藏着大量尚未被充分研究的新型病毒。虽然科学家已鉴定出多种蝙蝠携带的病毒,但对于病毒如何在蝙蝠和其他动植物之间传播,尤其是在不同生态系统中,目前的研究仍非常有限。 随着高通量测序技术的发展,病毒宏基因组学现已成为研究病毒多样性和发现未知病毒的高效工具。鉴于我国面临着严峻的新发传染病防控形势,有必要通过病毒宏基因组学方法,在大尺度的地理和生态学范围内全面分析我国蝙蝠携带的RNA病毒群,识别潜在的人兽共患威胁,同时探究影响病毒多样性和宿主-病毒相互作用的生态环境因素,为我国蝙蝠病毒的持续监测和新发传染病的防控工作提供重要的数据支持。 本研究于2008年至2022年期间,在广西、云南、广东、海南、福建、浙江、新疆、吉林、宁夏、江西和贵州11个省和自治区的52个市采集了7科16属40种蝙蝠共4,143只。通过宏病毒组学测序分析,从2.4 Tb的高质量数据中组装得到146,644,037个重叠序列(contigs)。综合运用序列相似性比对和隐马尔科夫模型识别出1,967,851个病毒样序列(Virus-like sequences,VLSs)。为了确保数据的准确性,排除了1,572,951条可能存在污染或假阳性的序列。经过去冗余处理,最终鉴定出包含8,176个RNA病毒序列的高质量宏基因组数据集(BtCN-Virome)。这些病毒序列涵盖了核糖病毒域(Riboviria)中的6个门,其中66.1%(n=5,401条)的序列被归入48个已知的病毒科。在注释到的21个哺乳动物病毒科中,具有重要公共卫生意义的哺乳动物相关病毒包括冠状病毒科的α和β冠状病毒属、丝状病毒科的奎瓦病毒属、副粘病毒科的亨尼帕病毒属、汉坦病毒科的汉坦病毒属和黄病毒科的肝炎病毒属等。与节肢动物相关的病毒科有14个,包括双顺反子病毒科、内罗病毒科、传染性软腐病病毒科、野田村病毒科、李氏蜘蛛病毒科和楚病毒科等。与植物病毒相关的病毒科有8个,如双组分病毒科、内源RNA病毒科、香石竹斑驳病毒科、番茄丛矮病毒科、马铃薯Y病毒科和南方菜豆花叶病毒科等。剩余的33.9%的序列(n=2,775条)无法归类到现有的病毒分类中,而是可能属于至少10个目中的新病毒科,如光滑裸露病毒门(Lenarviricota)、布尼亚病毒目(Bunyavirales)和荆楚病毒目(Jingchuvirales)等,这些新病毒的发现表明当前仍存在着大量尚未被充分认识的病毒。 通过主坐标分析(Principal coordinate analysis,PCoA)发现,哺乳动物病毒表现出对宿主和/或器官的趋向性,以菊头蝠科和肠道样本的病毒多样性最高。K-mer距离和t-分布随机近邻嵌入(t-distributed Stochastic Neighbour Embedding,t-SNE)降维分析结果显示,在塑造病毒群落的多样性方面,蝙蝠物种的影响超过了样本类型。同时,本研究还全面阐述了食性与蝙蝠携带节肢动物病毒和植物病毒多样性的关系,结果显示,食虫蝙蝠与它们所携带的多种节肢动物病毒之间存在显著的相关性,同样,食果蝙蝠与它们接触的植物病毒多样性紧密相关。以病毒丰富度为因变量构建多元线性回归模型(Multiple linear regression,MLR),分析发现湿度、森林覆盖率、人类活动和蝙蝠系统发育等生态因素影响了肠道和肺脏样本的病毒组组成。对比不同生态环境中的哺乳动物病毒传播数据发现,与野外栖息的蝙蝠相比,在人类居住区活动的蝙蝠携带的病毒种类更为多样,并且将病毒跨物种传播给其他哺乳动物,尤其是人类和家畜的可能性更高。 根据蝙蝠病毒组学的结果,本研究还重点关注了对人类和家畜构成潜在公共卫生威胁的病原体。在中国的8个省级地区的19种蝙蝠中,鉴定出了至少7个病毒科、10个病毒属的15种病毒,包括严重急性呼吸综合征相关冠状病毒(Severe Acute Respiratory Syndrome-related Coronavirus,SARSr-CoV)、中东呼吸综合征相关冠状病毒(Middle East Respiratory Syndrome-related Coronavirus,MERSr-CoV)和猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)、尼帕病毒(Nipah virus,Ni V)、Llovi

关键词： 新发突发传染病   蝙蝠   鼠类   自然疫源动物   病毒组   遗传进化  

摘要： 随着人类活动范围的不断拓展,城镇化进程的加速以及气候变化、栖息地遭到破坏等原因,致使野生动物与人类及家禽家畜的接触机会显著增多,进而加剧了其携带的病毒跨越物种屏障引发传染病的风险。据统计,全球超过60%的传染病为动物源性传染病,且以野生动物源病毒性新发突发传染病为主。作为在全球广泛分布的第一大类和第二大类哺乳动物,鼠类和蝙蝠是冠状病毒、副黏病毒、汉坦病毒、沙粒病毒、埃博拉病毒及拉沙热病毒等众多病毒的自然储存宿主。中国和东南亚地区生态环境多样,为蝙蝠和鼠类等众多自然疫源生物提供了适宜的栖息环境,使得这些地区面临着较为严峻的野生动物源新发突发传染病的威胁。因此,加强这些地区蝙蝠和鼠类等疫源生物携带病毒本底的调查,对于了解这些地区野生动物携带病毒的生态特征,防止野生动物源性疫病的暴发具有重要意义。 随着科学技术的快速发展,以二代测序为基础的宏基因组和宏转录组技术为高效开展蝙蝠和鼠类等自然疫源动物病毒组学研究创造了条件。同时,测序数据的质控、组装、注释及分析技术工具的迭代更新也为深入地挖掘病毒序列信息提供了实现的可能。为全面调查中国境内和东南亚地区蝙蝠和鼠类等自然疫源动物携带的病毒谱信息,本研究对2008年至2023年间在中国和东南亚地区采集的16,658份蝙蝠和鼠类样本分别进行了基于宏基因组和宏转录组的实验处理。其中,从中国14个省份采集了 13,064份涉及7个科19个属54个种的蝙蝠咽肛拭子样本(2022 China Bat Sample Data，C22B);从云南和西藏2个省份采集了 310份涉及5个科11个属19个种的鼠类等动物咽肛拭子样本(2021 China Rodent Sample Data，C23R);从东南亚的泰国、老挝及柬埔寨采集了 3,284份鼠类等动物肺组织样本(2021 Southeast Asia Rodent Sample Data,S21R),涉及3个目6个科15个属的38种动物。合并本人所在课题组在2011年至2018年间对中国全境的蝙蝠(2016 China Bat Sample Data,C16B)和鼠类等动物(2018 China Rodent Sample Data,C18R)调查获得的测序数据,共计有涵盖24,153份样本845个pools的4,615.46GB的测序数据用于蝙蝠和鼠类等自然疫源动物携带病毒本底的挖掘。 通过对测序数据的比对分析,本研究筛选出163,974,786条涉及39个病毒科的脊椎动物和无脊椎动物相关病毒reads序列,藉此开展了病毒组学分析。Adenoviridae、Coronaviridae、Paramyxoviridae、Arteriviridae、Arenaviridae、Hantaviridae等科的病毒在蝙蝠或鼠形动物中检出率较高,且这些病毒科中的成员与人畜高致病性病毒密切相关。本研究进一步聚焦于与人类疾病密切相关的RNA病毒,对 Nidovirales 目的 Coronaviridae,Bunyavirales 目 Arenaviridae、Phenuiviridae、Hantaviridae,Mononegavirales 目的 Paramyxoviridae 和 Rhabdoviridae,Amarillovirales目的 Flaviviridae,Hepelivirales 目的 Hepeviridae,Picornavirales 目的 Picornaviridae和Caliciviridae,以及Stellavirales目的Astroviridae的病毒进行了基因组序列验证,从中获得了 1,704条病毒序列,其中,Partial Genome序列1,191条,Complete Genome序列513条。此外,本研究还将C16B和C18R批次曾验证得到的184条序列(Partial Genome序列89条,Complete Genome序列95条)和基于5批测序数据组装得到的857条Partial Genome序列纳入了遗传进化分析。 本研究通过对中国和东南亚地区蝙蝠和鼠类携带冠状病毒进行分析,鉴定出了10个病毒种级别的新进化谱系,在中国云南省边境地区的中华菊头蝠中鉴定出了目前已知与SARS-CoV全基因组序列一致性最高的毒株(BtRs-CoV/YN2020,95.8%nt),并推测了 SARS-CoV-2由分布于中国南方的菊头蝠携带的SC2r-CoVs与分布于中南半岛的菊头蝠、穿山甲携带的SC2r-CoVs经历多次重组的形成过程。另外,本研究拓展了对已分类沙粒病毒宿主范围和地理分布特征的认识,在泰国的鼠类中第一次获得了肾综合征出血热(Hemorrhagic Fever with Renal Syndrome,HFRS)的病原体(T