关键词： ADMET predictions   Binding free energy   MMGBSA   Molecular docking   Molecular dynamics simulation   Natural products  

摘要： Background Cucurbitacins are present in some common vegetables as secondary metabolites and are used by the plants against harmful microbes. Exploration of this capability of natural product based substances against wide variety of microbes seems relevant due to the ease of availability of the resources and safety. In this regard, considering the current pandemic, the antiviral properties of these molecules with a subset of Cucurbitacin I structural derivatives have been screened. The inhibition potential of the phytochemicals was assessed by the stability of the protein-ligand complex formed with the nucleocapsid protein (PDB ID: 7CDZ) of SARS-CoV-2 by computational methods. The proposition of an alternate antiviral candidate that is cost-effective and efficient relative to existing formulations is the main objective of this *** Server-based molecular docking experiments revealed CBN19 (PubChem CID: 125125068) as a hit candidate among 101 test compounds, a reference molecule (K31), and 5 FDA-approved drugs in terms of binding affinities sorted out based on total energies. The molecular dynamics simulations (MDS) showed moderate stability of the protein-CBN19 complex as implied by various geometrical parameters RMSD, Rg, RMSF, SASA and hydrogen bond count. The ligand RMSD of 3.0 +/- 0.5 angstrom, RMSF of C alpha of protein with less than 5 angstrom, and smooth nature of SASA and Rg curves were calculated for the adduct. The binding free energy (- 47.19 +/- 6.24 kcal/mol) extracted from the MDS trajectory using the MMGBSA method indicated spontaneity of the reaction between CBN19 and the protein. The multiple ADMET studies of the phytochemicals predicted some drug-like properties with minimal toxicity that mandate experimental *** Based on all the preliminary in silico results, Cucurbitacin, CBN19 could be proposed as a potential inhibitor of nucleocapsid protein theoretically capable of curing the disease. The proposed molecule is recom

关键词： COVID-19   colchicine   magnolol   hybrid   3-chymotrypsin-like protease   neutrophil elastase  

摘要： Coronavirus disease 2019 (COVID-19), caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2 or 2019-nCoV), is a life-threatening infectious condition. Acute lung injury is a common complication in patients with COVID-19. 3-chymotrypsin-like protease (3CL(pro)) of 2019-nCoV and neutrophil elastase are critical targets of COVID-19 and acute lung injury, respectively. Colchicine and magnolol are reported to exert inhibitory effects on inflammatory response, the severe comorbidity in both COVID-19 and acute lung injury. We thus designed and synthesized a series of novel colchicine-magnolol hybrids based on a two-step synthetic sequence. It was found that these novel hybrids provided unexpected inhibition on 3CL(pro) and neutrophil elastase, a bioactivity that colchicine and magnolol did not possess. These findings not only provide perquisites for further in vitro and in vivo investigation to confirm the therapeutic potentiality of novel colchicine-magnolol hybrids, but also suggest that the concurrent inhibition of 3CL(pro) and neutrophil elastase may enable novel colchicine-magnolol hybrids as effective multi-target drug compounds.

关键词： 免疫缺陷   登记号   肺炎   免疫效果   免疫抑制剂   适用人群  

摘要： 美国FDA于2024年3月22日紧急批准(emergency use authorization,EUA)Invivyd公司(Invivyd,Inc.)的Pemgarda(pemivibart,CAS登记号2858673⁃18⁃2,为蛋白/肽序列,序列长度1344)用于某些成人及青少年(年满12岁及以上且体重至少为40 kg[约88磅])在暴露前预防新冠肺炎(COVID⁃19)。除此之外,FDA没有批准Pemgarda的其他任何用途。Pemgarda此次紧急批准用途的具体适用人群为:(1)目前未感染新冠病毒(SARS⁃CoV⁃2)且与感染者没有明确接触史的人群;(2)因为医疗方面的原因(如疾病、正在服用免疫抑制剂类药物)有中重度免疫缺陷(亦称免疫妥协)以致接种新冠疫苗后未能达到充分免疫效果的人群。

关键词： 近视   小学生   近视筛查   新型冠状病毒感染   预防策略  

摘要： 目的通过收集杭州市小学生在新型冠状病毒感染疫情前后的视力筛查数据,分析小学生连续4年的近视患病率变化情况。方法使用分层抽样的方法纳入杭州市21所小学一至六年级(6至13岁)完成视力筛查的34474名学生(68948眼)。统计2019年至2022年小学生近视患病率并比较2020年与其他年份近视患病率的差异性。计算连续4年等效球镜值并按照性别及年龄分组观察其变化趋势。结果2019年至2020年,儿童近视患病率大幅增加,其中一年级27.2%比44.5%,二年级40.1%比53.1%,三年级56.5%比66.0%,四年级62.2%比75.9%,五年级75.4%比83.6%,六年级80.4%比88.4%。经杭州市儿童近视防控策略的实施,2020年至2022年所有年级组的近视患病率均明显缓和。一年级和二年级2019年至2022年整体近视变化幅度较大(均P<0.01),五年级和六年级整体近视变化幅度较小。年级越高,近视程度越深。右眼比左眼更容易发生近视。女生相比男生的近视发展速度更快。结论疫情结束后儿童近视情况有所缓和,这可能与户外运动时间的增加等相关环境影响因素有关。小学生处于生长发育及用眼习惯的关键时期,通过学校近视筛查工作可及时发现小学生近视及高度近视的发生,从而为小学生近视防控工作提供科学依据。

关键词： 即时检测   新型冠状病毒   新型冠状病毒肺炎  

摘要： 即时检测(point-of-care testing,POCT)是便捷、快速和低成本的检测手段,顺应了高效率和快节奏的社会运转模式,满足了人们对快速检测的需求,被广泛应用于临床诊疗、口岸检疫和疾病防控等领域。目前,POCT已由干化学法、免疫层析等传统技术向生物传感器、生物芯片等新型技术发展,并在新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情中新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的快速检测和筛查中发挥了重要作用。本文归纳了POCT技术在基于核酸检测的COVID-19诊断方面的应用研究,为传染病防控和临床诊治提供参考。

关键词： 慢性肾脏疾病   终末期肾病   透析   新型冠状病毒   疫苗接种  

摘要： 慢性肾脏病尤其是终末期肾病接受肾脏替代治疗的患者,在新型冠状病毒感染疫情中面临巨大风险。研究显示,慢性肾脏病患者接种现有的新冠疫苗安全性较高,且全程接种能使大多数慢性肾脏病患者产生特异性抗体。但疫苗在慢性肾脏病患者中产生的体液反应和效力均显著弱于健康人群。增加疫苗接种剂次和采用混合接种对提高疫苗在慢性肾脏病患者中的保护效力具有潜在价值,但相关的接种策略仍值得进一步研究。本文综述了慢性肾脏病患者接种新冠疫苗的可行性、安全性、有效力及针对性接种策略方面的研究进展。

关键词： 新型冠状病毒   亚单位疫苗   腺病毒载体疫苗   m RNA疫苗   抗体   T细胞  

摘要： 新型冠状病毒(新冠病毒)在全球范围内流行,对公共卫生和人民生命健康造成了巨大威胁,新冠病毒疫苗的研发和使用对预防疾病和控制疫情起到了关键作用.基于包括重组蛋白亚单位、病毒载体、mRNA脂纳米颗粒在内的多种技术平台开发的疫苗都获得了使用.然而,由于抗原设计的差异、免疫剂量和注射间隔的差别,不同疫苗平台之间的免疫效果无法直接比较.因此,本研究以Delta-Omicron嵌合RBD二聚体为免疫原,对广泛使用的3个疫苗平台(重组蛋白亚单位疫苗、腺病毒载体疫苗和mRNA疫苗)进行了免疫原性头对头比较,通过小鼠模型比较了它们同源接种和序贯接种所诱导的体液免疫和细胞免疫反应的差异.结果显示,小鼠在免疫同源的两剂疫苗后,m RNA疫苗诱导的结合抗体和中和抗体滴度都最高,其次分别是重组蛋白亚单位疫苗和腺病毒载体疫苗;异源加强免疫的结果显示,不管是以重组蛋白亚单位疫苗、腺病毒载体疫苗或者mRNA疫苗初免,以mRNA疫苗作为第2针加强免疫均能诱导更强的体液免疫反应.此外,在疫苗激发的细胞免疫方面,mRNA疫苗诱导了较强的CD4^(+)T细胞反应,腺病毒载体疫苗诱导了较强的CD8^(+)T细胞反应,而亚单位疫苗刺激的细胞免疫反应以CD4^(+)T细胞为主,但在强度上较弱.本研究具有重要的应用价值,为未来新一代的新冠病毒疫苗研发和接种策略提供了指导.

关键词： 新型冠状病毒灭活疫苗   川崎病   偶合症  

摘要： 2022年3月,在深圳市罗湖区某社区健康服务中心接种新型冠状病毒灭活疫苗后出现1例川崎病。本研究通过收集疫苗管理、接种实施、临床诊治等相关资料进行诊断与调查。结果显示,疫苗生产、储运和使用均符合要求,接种单位及人员具备相应的资质,接种程序规范,该例所患川崎病与接种新型冠状病毒灭活疫苗无明确因果关联,不属于预防接种异常反应,属于偶合症。应对此类事件,需科学解答、及时应对、规范处置。

关键词： 新型冠状病毒变异株   Omicron I1566V突变位点   反转录聚合酶链反应   MS2噬菌体   病毒样颗粒  

摘要： 目的构建新型冠状病毒Omicron I1566V突变位点MS2噬菌体病毒样颗粒。方法选取并合成带有6×His标签的MS2噬菌体的衣壳蛋白(CP)、成熟蛋白(A蛋白)及Omicron I1566V突变基因序列,插入pACYCDuet-1质粒构建重组载体,通过原核系统诱导表达目的蛋白,纯化重组蛋白后利用透射电镜对蛋白质进行物理表征,最后通过反转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测病毒样颗粒的热稳定性及耐核酸酶水解能力。结果成功构建包含有6×His标签的CP、A蛋白和Omicron I1566V突变基因序列的重组载体,经限制性内切酶BamHⅠ和KpnⅠ酶切鉴定和测序验证,结果均与预期相符。经诱导并纯化后,通过电镜观察到了大小均匀、直径为23~28 nm的病毒样颗粒,该病毒样颗粒经核酸酶消化后可在37℃条件下稳定储存20 d以上。结论该研究成功利用MS2噬菌体的CP和A蛋白构建了Omicron I1566V突变位点病毒样颗粒,为该突变位点的RT-PCR检测体系提供了可靠的质量保障。