关键词： 冠状病毒   COVID-19   蛋白酶   抑制剂  

摘要： 由SARS-CoV-2引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)已经造成数百万人死亡,至今仍未停止传播,给人类健康和社会稳定造成了严重的影响。SARS-CoV-2的蛋白酶包括PL蛋白酶和3CL蛋白酶,具有切割多聚蛋白和抑制宿主先天性免疫反应等功能,在冠状病毒的生命周期中起重要作用。PL蛋白酶和3CL蛋白酶在不同冠状病毒中基因序列高度保守,是开发抗冠状病毒药物的理想靶点。根据蛋白酶与抑制剂的结合方式不同,将已报道的抑制剂分为共价抑制剂和非共价抑制剂,分别介绍了PL蛋白酶抑制剂和3CL蛋白酶的研究现状及不同抑制剂的作用特点、设计思路、化学结构及其生物活性,以期为抗冠状病毒药物的研发提供参考。

关键词： 深度学习   新型冠状病毒肺炎   人工智能   计算机断层扫描   分割网络   分类网络  

摘要： 新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)具有高传染性,严重威胁人民群众的生命安全,快速筛查可以实现快速治疗、防止肺炎进展。目前COVID-19检测诊断方法的金标准为逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR),但是由于核酸检测存在耗时且假阴性率偏高的问题,而影像医生对医学图像的诊断存在主观性且工作量巨大,因此借助人工智能(artificial intelligence,AI)技术对实现COVID-19的快速诊断至关重要。随着AI在医学领域的成功应用,深度学习技术成为辅助诊断新型冠状病毒肺炎的有效方法。近年来许多学者使用深度学习技术来构建对医学图像进行智能诊断的模型,本文的主要内容就是对这类模型进行总结和分析,介绍了分割肺部区域的模型、实现二分类或多分类的分类模型以及模型在临床上的应用。与此同时,在文章中分析了COVID-19患者的影像学特点,COVID-19患者多双肺受累,其中磨玻璃影是最常见的影像征象。对COVID-19研究的最新进展也进行了介绍,主要是关于提高AI模型准确性的开发和“长新冠”综合征的相关研究。因此,在新型冠状病毒肺炎常态化管理下,模型准确性的提高可以借助数据集的扩大或模型结构轻量化等方面实现;“长新冠”综合征作为一个新的研究领域,学者可以在临床症状、预后随访和结合深度学习技术等方面进行进一步的研究。

关键词： 新型冠状病毒   变异株   接触传播   致病力   传播力  

摘要： 目的比较新型冠状病毒(SARS-CoV-2)奥密克戎(Omicron)BA.1、BA.2在金黄地鼠中的致病性及传播能力差异。方法6~8周龄雄性金黄地鼠,体质量(107.00±18.88)g,共24只,其中,12只金黄地鼠感染10^(6)CCID_(50)/100μl病毒液(6只感染Omicron BA.1,6只感染Omicron BA.2)24 h后作为供体,与8只健康金黄地鼠(作为受体,每种病毒株4只受体)共同饲养2 h,用于接触传播研究,同时供体用于致病力研究,4只金黄地鼠作为空白对照。所有动物在实验周期内每天进行体质量监测,供体动物于感染后第1天开始采集鼻咽拭子及肛拭子,受体动物于接触当天开始采集鼻咽拭子。采用RT-PCR对动物鼻咽拭子、肺、鼻甲组织病毒载量进行检测,同时用苏木精伊红(HE)染色评估肺组织损伤程度,进而评估2种病毒株在金黄地鼠中的致病力及传播力。结果SARS-CoV-2 Omicron BA.1与BA.2均未导致严重的肺损伤,同时未引起明显的体质量变化,Omicron BA.1感染金黄地鼠体质量:初始(121.61±8.21)g,实验结束(131.53±8.02)g;Omicron BA.2感染金黄地鼠体质量:初始(88.15±1.74)g,实验结束(90.42±9.95)g。肺组织病毒核酸拷贝数[Omicron BA.1感染金黄地鼠(7.64±0.74)log_(10)拷贝/ml,Omicron BA.2感染金黄地鼠(7.79±0.25)log_(10)拷贝/ml];鼻甲病毒核酸拷贝数[Omicron BA.1感染金黄地鼠(6.63±0.63)log_(10)拷贝/ml,Omicron BA.2感染金黄地鼠(6.92±0.14)log_(10)拷贝/ml],差异均无统计学意义,表明两者致病性无明显差异。在传播能力方面,Omicron BA.2的传播能力略高于Omicron BA.1,健康金黄地鼠分别与感染病毒的金黄地鼠共同饲养2 h后,50.0%(2/4)金黄地鼠体内可检测到Omicron BA.1,100.0%(4/4)金黄地鼠体内可检测到Omicron BA.2,且受体Omicron BA.2金黄地鼠肺组织核酸拷贝数[(6.83±1.54)log_(10)拷贝/ml]显著高于受体Omicron BA.1金黄地鼠肺组织核酸拷贝数[(2.26±2.61)log_(10)拷贝/ml],P<0.05。结论SARS-CoV-2 Omicron BA.1、BA.2在金黄地鼠模型中均可通过接触传播感染,两者的致病力相似但传播力不同。

关键词： 新型冠状病毒   感染   糖酵解   相互作用  

摘要： 糖酵解与病毒感染性疾病关系密切,且病毒和宿主糖酵解之间的相互作用是多种病毒中存在的共性机制。因此,糖酵解调控可能是重要的抗病毒策略。新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染的流行给人类带来了巨大的灾难,需要从更多不同角度去探寻有效的解决方案。SARS-CoV-2可诱导宿主糖酵解水平升高,而宿主糖酵解水平在SARS-CoV-2复制和感染中起重要作用,且与病程进展和多种临床症状及并发症相关。对宿主糖酵解与SARS-CoV-2感染相互作用的研究有助于阐明SARS-CoV-2致病机制并促进相关药物研发。本文对SARS-CoV-2感染与宿主糖酵解之间的相互作用进行综述,以期为从代谢调控角度阐明病毒感染与疾病的关系及研究应对措施提供新视角。

关键词： 新型冠状病毒感染   D-二聚体   急性心肌梗死   血栓   冠状动脉  

摘要： 目的探讨新型冠状病毒感染合并急性心肌梗死患者的临床特征及预后结果。方法回顾性选取76例急性心肌梗死患者为研究对象。根据是否合并新型冠状病毒感染,分为新冠组(n=42)与对照组(n=34)。比较2组患者的一般临床情况、实验室检查指标、介入治疗特征、住院期间的并发症发生率以及预后。分析急性心肌梗死患者发生冠状动脉血栓性病变的独立影响因素。结果新冠组舒张压、左心室射血分数和淋巴细胞计数低于对照组,脂蛋白a、C反应蛋白、血清铁蛋白、纤维蛋白原和D-二聚体高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。新冠组冠状动脉血栓病变、基线心肌梗死溶栓试验(TIMI)血流0~1级、血栓负荷分级4~5级、注射GPⅡb/Ⅲa和血栓抽吸者占比高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,新型冠状病毒感染、D-二聚体增高是急性心肌梗死患者发生冠状动脉血栓病变的独立危险因素。新冠组平均住院时间长于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。随访6个月结果显示,新冠组主要不良心血管事件(MACEs)发生率高于对照组,差异有统计学意义(P=0.014)。结论新型冠状病毒感染合并急性心肌梗死患者的冠状动脉血栓负荷更高,预后更差。

关键词： 新发传染病   大数据监测   监测预警   新型冠状病毒感染  

摘要： 目的以2020—2022年新型冠状病毒肺炎(2022年底更名为“新型冠状病毒感染”)疫情为例,回顾性研究互联网大数据在新发传染病监测预警中的应用,为建立基于互联网大数据的新发传染病早期监测预警机制提供科学参考。方法基于互联网大数据,收集2020—2022年四川省新型冠状病毒肺炎(以下简称“新冠肺炎”)本土疫情网络舆情数据,通过百度指数(大众版)获取四川省内新冠肺炎的百度搜索指数,利用Excel 2013软件对数据进行描述性分析,计算构成比和比值。结果根据定制的预警主题,2020—2022年间四川省共接收新冠肺炎疫情预警信息50896条,主要分布在成都、南充、绵阳等6个地区。三年间共有9起新冠肺炎本土疫情,网络舆情系统均发出预警信息,其中7起预警时间早于传染病监测系统。监测到全网新冠肺炎相关舆情220295条,峰值在2020年3月,负面舆情占比逐年下降。舆情集中在微信、微博、网媒和APP,2022年微信舆情构成较2020年上升104.41%。关键词主要集中在“确诊病例”“肺炎”“无症状”“冠状病毒”等。新冠肺炎的百度搜索指数水平在2020年度最高,资讯指数在2022年最高。四川省和成都市搜索指数均分别位于全国同级地区前十位。结论互联网大数据监测在新冠肺炎本土疫情期间发挥了早期监测预警作用,舆情信息特征多角度反映社会对疾病的关注重点,本研究认为互联网大数据可以作为传统传染病监测预警的重要补充渠道之一。

关键词： 新型冠状病毒肺炎   复阳   危险因素   Logistic模型  

摘要： 目的筛查新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者经治疗出院后复阳的相关危险因素。方法纳入2022年1月至2022年2月在天津市第一中心医院(水西院区)接受医学观察的320例康复期新型冠状病毒感染者。采集临床资料及实验室检验数据,根据患者新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸复查是否阳性分为复阳组和未复阳组,并利用Logistic回归分析筛查部分患者复阳的相关危险因素。结果本研究纳入的320例患者中复阳73例,未复阳247例,复阳率为22.8%。Logistic回归分析显示,高CRP值(OR=1.050,95%CI:1.001~1.100;P=0.045)、既往慢性肝病史(OR=6.493,95%CI:2.771~15.216;P<0.01)是新型冠状病毒肺炎患者复阳的独立危险因素。结论感染新冠病毒后CRP值较高以及既往有慢性肝病史的患者存在较高的复阳风险,对该类患者更应做好预防及心理疏导。

关键词： Ct值   鼻拭子   咽拭子   新型冠状病毒   PCR   分析  

摘要： 目的分析新型冠状病毒感染人群的鼻拭子和咽拭子标本的循环阈(Ct)值,为流行病学调查和临床预测等提供一定的理论依据。方法对2022年4月1日至7月31日本实验室接收的SARS-CoV-2核酸阳性人群的鼻拭子和咽拭子标本,运用磁珠法进行核酸提取,用实时荧光定量PCR检测SARS-CoV-2核酸的ORF1ab基因和N基因两个靶标,分析两类标本中两个靶标的Ct值。Ct值差异用独立样本t检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果SARS-CoV-2核酸阳性标本401例,男性243例、女性158例(男女比例1.54∶1);SARS-CoV-2核酸阳性人员年龄分布为7个月~91岁,中位数为39岁;临床分型为普通型31例,轻型281例,无症状感染者89例。同时采鼻拭子和咽拭子的106例,两类标本ORF1ab基因(t=7.728,P<0.001)和N基因(t=7.504,P<0.001)Ct值差异均有统计学意义。在同一人不同时间送检鼻拭子或咽拭子的73例标本中,采样时间间隔≤48h的标本26例,两次Ct值差值的绝对值>2的标本占61.54%(16/26),末次Ct值≤30的标本占61.5%(16/26);采样时间间隔>48h的标本56件,两次Ct值差值的绝对值>2的标本占82.1%(46/56),末次Ct值>30的标本占98.2%(55/56)。结论SARS-CoV-2奥密克戎变异株感染者的临床分型以轻型为主;鼻拭子标本的病毒载量高于咽拭子;采样时间间隔≤48h的标本,若Ct值快速下降且末次Ct值≤30,大多为新发感染人员;若末次Ct值>30则大多为复阳人员。Ct值仅有一定的提示作用,对于COVID-19人群的临床情况预测、感染者当下状态及何时参与社会活动,要根据其临床情况连同实验室结果进行评估。

关键词： 感染人数   早期估计   新冠肺炎   人口流动   检出概率  

摘要： 基于运营商提供的匿名、累计手机定位大数据,提取全国人口在春节期间的出行信息,并基于爆发地区人口流动情况构建模型推算武汉感染患者数量以及增长趋势。研究结果表明,截止武汉“封城”前,基于湖北省外50座城市感染情况构建DPNA-M模型估计武汉感染人数为26464人,与依据境外检出概率的估计结果接近。与现有的估计方法相比,该模型不严格依赖于疫区统计数据,估计结果更准确,在模型稳健性与应用普适性方面更具优势。

关键词： 奥密克戎   血小板   转录组   蛋白组  

摘要： 血小板是维持机体稳态和应对疾病感染等的关键血液成分,其无核特征以及转录本和蛋白质来源的多样性导致血小板的转录组和蛋白组相关性普遍偏低。前期研究已解析了血小板蛋白质组在新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV2)奥密克戎感染不同阶段的动态表达模式,但对其具体来源未作深入分析。为了解血小板对奥密克戎感染的应答机制,对血小板蛋白组与转录本进行了对比分析,以探究不同蛋白分子的来源。结果发现,血小板转录组变化相较于蛋白组更为剧烈,且二者的变化存在差异。感染后血小板转录组与蛋白组共同上调的基因/蛋白主要富集了固有免疫、抗病毒免疫反应等特征,提示相关蛋白可能来自血小板内RNA翻译。血小板蛋白组单独上调的蛋白特征包括急性炎症反应、吞噬识别作用等,提示该部分蛋白可能由血浆直接摄入或与其他细胞互作所得。此外,血小板转录组也单独上调RNA代谢过程、RNA剪接的调控等相关基因。研究结果为探究奥密克戎感染条件下血小板RNA和蛋白质的来源多样性提供了重要的数据支撑。