关键词： 新冠肺炎   语义分割   多尺度特征   Transformer   半监督  

摘要： 新冠肺炎(Coronavirus Disease 2019,COVID-19)是一种由SARS-Co V-2病毒引起的急性呼吸道感染病,计算机断层扫描(Computed Tomography,CT)图像已经成为诊断和评估患者病情的重要工具。实现自动的从CT图像中分割出COVID-19病灶区域有助于提高诊断效率。目前相关研究中仍然存在着数据集噪声多、COVID-19病灶特征复杂以及带标注数据集规模小等问题,基于上述问题,本文进行了如下研究:(1)针对CT图像中存在大量噪声的问题,本文设计了CT图像肺部区域裁剪算法用于数据的预处理过程。该算法基于形态学方法进行设计,利用二值化、最大连通区域提取、二值图像细化、孔洞填充和开运算方法生成感兴趣区域的二值图,最后依据该二值图像中最大连通区域的外接矩形框对原始CT图像进行裁剪,得到感兴趣区域。实验结果表明,利用该算法进行预处理能够有效提升模型的分割性能。(2)针对COVID-19在肺部CT图像中的特征复杂性以及尺寸的多样性,本文基于U-Net的编解码结构设计了融合Transformer的多尺度病灶区域分割模型。模型中包含两个编码器:多尺度特征增强编码器和基于Transformer结构的编码器,其中多尺度特征增强编码器借助空洞卷积实现层内COVID-19病灶区域的多尺度特征提取,基于Transformer结构的编码器主要用于全局特征的提取,来弥补多尺度特征增强编码器的不足。对于输入CT图像两个编码器并行运行,分别进行特征编码。在解码器部分设计了特征融合模块将来自两个编码器的特征图融合,实现了两个编码器特征间的像素级的通信,充分利用局部以及全局特征信息实现CT图像中COVID-19病灶区域的分割。实验结果表明,本文提出的模型在二类分割数据集上的Dice和Io U评价指标上均取得了较好的结果,在多类分割任务中,m Dice和m Io U评价指标上也取得了较优的结果。(3)针对用于COVID-19病灶区域分割任务的数据集小的问题,本文设计了基于不确定性感知的半监督训练策略。以平均教师模型为基础,引入了偶然不确定性以及认知不确定性的估计,引导学生模型从教师模型的预测结果中更可靠的部分进行学习,通过学生模型的指数移动平均更新教师模型的参数从而提高教师模型的分割性能。经实验验证,该训练策略能够借助少量的带标注数据实现与全监督训练模型相当的分割结果。通过本文的方法可以在较少的带标注的训练数据基础上实现对CT图像中COVID-19病灶区域的精确分割,为临床治疗过程中监测COVID-19患者病情提供支持,更好地帮助医生快速做出诊疗决策。

关键词： 医疗服务复工   地理探测器   多层次   解释力   新冠肺炎  

摘要： 新型冠状病毒肺炎(COVID-19)大流行仍然是一种全球性持续威胁,不仅给人类的健康带来了极大挑战,而且给社会、经济及自然环境带来了严重的影响,因此,我们必须立即采取有效的措施,来恢复正常的生产生活。医院作为此次抗击疫情的主战场,其正常医疗服务水平受到严重影响,而医院的复工不仅有利于保障人们的健康,同时也将为各个行业的恢复生产、经济发展提供强大的医疗保障。移动设备轨迹数据包含与人口流动和特定位置相关的大量时空信息,提供了在高分辨率时空域内评估行业复工及其相应决定因素的潜力。此外,不同研究单元的医疗服务恢复情况及其复工影响因素也有所不同。本研究利用覆盖全国80%以上移动设备的位置服务轨迹数据(覆盖时期为2019年12月与2020年2月21日至3月18日),评估了医院层次和城市层次上的中国大陆医疗服务恢复状况。选取了基础医疗服务能力、人口流动、疫情严重程度以及社会经济因素作为医疗服务复工的潜在影响因子,采用地理探测器方法具体评估了医院层次和城市层次上的影响因子对复工状况的解释力以及交互作用,旨在为复工复产评估与单因子/交互解释力测算研究提供一种新颖的多层次视角,也可为区域化医疗服务复工策略制定提供有价值的启示,研究结果表明:(1)医院和城市医疗服务复工率总体均呈现上升趋势,近一半医院复工复产情况良好,超过半数的城市医疗服务实现复工复产,此外,医院和城市医疗服务复工率的分布均表现出较强的空间自相关,呈现高度集聚的空间分布格局,其空间相关性的时序变化特征分别呈现“U”字型和“V”字型,表明其空间集聚性在时间序列上均呈现“强-弱-强”的变化特征。(2)不同的决定因素对多层次医疗服务的恢复状况有不同的解释力,人口流动、疫情严重程度和社会经济因素在解释城市医疗恢复状况方面发挥了重要作用,而城市分层则对医院恢复状况的解释力更大;同一决定因素的个别解释力因多层次医疗服务恢复状况而异,人口流动对多层次医疗服务恢复状况均有影响,但对城市医疗恢复状况的影响明显大于对医院恢复状况的影响。(3)解释多层次医疗服务恢复状况时,出现了不同类型的成对行列式交互关系。在医院恢复状况方面,变量间交互作用中大多存在双因子增强的交互关系,而在城市医疗恢复状况方面,所有变量交互作用时都存在强非线性增强的交互关系类型。(4)决定因素间的交互作用因多层次的医疗服务恢复状况而异,如城市分层是医院恢复状况的最主要交互决定因素,而人口流动、疫情严重程度和社会经济因素是解释城市医疗恢复状况的主要交互决定因素。

关键词： SARS-CoV-2冠状病毒   非结构蛋白Nsp10   非结构蛋白Nsp16   原核表达   RNA加帽  

摘要： 目的新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)隶属于冠状病毒,是一种有具有包膜包裹的正义单链RNA病毒,可引起新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)。本研究通过对SARS-CoV-2非结构蛋白Nsp10和Nsp16的基因序列进行克隆,通过原核表达载体系统对两种蛋白进行表达,并成功制备了Nsp10和Nsp16和Nsp10/Nsp16融合蛋白,并通过体外转录的方法对RNA进行加帽,获得Nsp10和Nsp16功能检测所用的底物。方法(1)根据Genebank公布的SARS-CoV-2冠状病毒非结构蛋白Nsp10(NCBI:YP＿009725306.1)和Nsp16(NCBI:YP＿009725311.1)的基因序列设计引物,用PCR的方法把Nsp10和Nsp16基因从SARS-CoV-2冠状病毒的c DNA片段中扩增出来,将目标基因融合His基因标签后利用限制性内切酶双酶切的方法连接到原核表达载体PET15b和PET30a中,构建重组质粒。重组质粒经PCR和酶切反应进行初步鉴定,并将初步鉴定后的质粒进行测序。如果克隆的Nsp10和Nsp16基因序列与发表基因完全一致,说明成功构建了原核表达载体。(2)重组质粒PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16的优化诱导表达。将成功构建的原核表达重组质粒PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16转化到大肠杆菌感受态细胞BL21(DE3)中,经菌液PCR鉴定后,通过对时间、IPTG浓度诱导优化后进行蛋白表达。(3)利用SDS-PAGE电泳和蛋白免疫印迹法(Western Blot,Wb)验证目的蛋白是否在成功表达。通过SDS-PAGE电泳和Wb验证Nsp10和Nsp16蛋白质是否以可溶形式存在,为得到纯度较高的Nsp10和Nsp16蛋白质,对非结构蛋白Nsp10和Nsp16的表达和纯化条件进行了优化,利用镍层析柱对非结构蛋白Nsp10、Nsp16和Nsp10/Nsp16融合蛋白进行纯化。(4)对RNA加帽底物进行制备。通过KOD酶对SARS-CoV-2冠状病毒进行UTR的c DNA片段的克隆,利用体外转录试剂盒进行体外转录获得RNA,通过Capped RNA Synthesis加帽系统对RNA进行加帽,以得到RNA加帽底物。结果(1)将SARS-CoV-2冠状病毒非结构蛋白Nsp10的复制子和PET15b质粒通过限制性内切酶Bam HI和Xho I进行酶切连接构建,命名重组质粒为PET15b-Nsp10。将SARS-CoV-2冠状病毒非结构蛋白Nsp16的复制子和PET30a质粒通过限制性内切酶Nde I和Xho I进行酶切连接构建,命名重组质粒为PET30a-Nsp16。测序结果显示成功构建了PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16重组质粒。(2)将重组质粒PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16通过蓝白筛选后将克隆正确测序的PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16表达质粒转化到大肠杆菌中,种在带有抗性的LB培养板上,37℃下培养12-14小时后,挑取单克隆菌株通过优化培养条件,选择0.1m M IPTG培养16 h将PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16重组质粒进行大量目的蛋白的表达。(3)通过SDS-PAGE电泳和Wb发现Nsp10和Nsp16蛋白质大量表达并以可溶形式存在,对非结构蛋白Nsp10和Nsp16进行了优化纯化条件并通过镍层析柱进行纯化,获得了纯化后的Nsp10和Nsp16蛋白质,并将菌体混合进行Nsp10/Nsp16融合蛋白的纯化。(4)通过体外转录的方法到了SARS-CoV-2冠状病毒的UTR的RNA,通过Capped RNA Synthesis加帽系统对RNA进行加帽,以得到RNA作用底物。结论(1)成功构建了SARS-CoV-2冠状病毒Nsp10和Nsp16表达载体PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16。(2)成功表达了PET15b-Nsp10和PET30a-Nsp16重组质粒,成功优化培养条件并大量表达以可溶形式存在的Nsp10和Nsp16蛋白。(3)成功通过镍层析柱纯化了Nsp10和Nsp16蛋白和Nsp10/Nsp16融合蛋白,为体外功能的研究提供了基础。(4)成功通过体外转录的方法得到了底物RNA进行加帽,为甲基化功能检测提供了底物。

关键词： 近视   发病率   焦虑情绪   抑郁情绪   心理健康  

摘要： 目的：　　2021年对河南某高校的新生进行现况调查，了解其视力情况，分析疫情前后近视率趋势，以及近视大学新生与正常视力新生焦虑和抑郁的差异，探讨焦虑和抑郁水平与近视发病率之间的关系。　　方法：　　采用随机抽样的方法，根据纳入、排除标准，选取2021年10~12月5519名河南某高校本科新生。接受常规眼科检查及一般情况调查表、视觉相关生活质量量表、焦虑和抑郁的问卷调查。　　结果：　　1.根据排除标准排除无效问卷后,剩余有效问卷4930份，问卷有效回收率为89.32％;在校大学新生中男性2951份（59.9％），女性1979份（40.1％）;2.在校大学新生近视检出率为87.35%，其中正视学生检出率占12.7％;轻度近视学生检出率29.2％;中度近视学生检出率48.0％，高度近视学生检出率9.6％，超高度近视学生检出率0.5％。　　3.在校大学新生近视影响因素分析;近视与性别、家庭关系和睦、电子产品使用时间、父母近视情况、看书及手机距离、配镜合适、户外活动时间、戴镜时间等因素存在差异（P＜0.05）;近视与焦虑存在差异性，具有统计学意义（F=6.084，P=0.000）;与抑郁无关(P＞0.05)。　　4.近视程度与大学生视觉相关生活质量的差异性，结果显示不同程度近视大学生视觉生活相关生活质量量表得分在11个维度均低于正视大学生，呈显著性差异(P＜0.05)。　　5.在校大学新生近视状况的影响因素分析结果：　　焦虑程度对近视有显著的影响，焦虑评分值越大，近视程度越深，焦虑评分程度每增加一个等级，近视程度是原来的1.009倍(β=0.041;95%CI:0.846-1.089, P=0.042)。　　结论：　　大学新生近视率及近视程度较前均提升，焦虑率、抑郁率检出比也较前提高。学习距离变近、时间延长、屏幕使用时间的学生百分比高于在疫情之前的研究。现代生活方式中存在一些与近视和眼健康相关的风险因素：学习距离变近、时间延长、屏幕使用时间，需要更多的注意力和措施来预防近视和保护眼睛健康。　　近视与焦虑的发生率相关：焦虑评分越高，近视程度越高。可能进一步揭示了人类近视的成因和发展机制。既往认为近视是因为眼球增长或角膜曲率过高等生理因素导致的，本研究提示近视可能也与人的心理状态有关。如果我们能够更深入地了解焦虑与近视之间的关系，就可以更好地预防和治疗近视。本研究结果突显大学生近视发展情况及心理健康的影响，为政府有关部门及高校对大学生心理健康教育提供精准决策参考。

关键词： 新型冠状病毒   RBD   突变文库   抗体逃逸  

摘要： 背景: 新型冠状病毒(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2,SARS-CoV-2)流行至今,已经出现了多种变异株,与野生型病毒相比,这些突变株的传染性和抗体逃逸能力有所提高。目前主要的流行突变株Omicron对大多数中和抗体表现出不同程度的抗体逃逸,介导抗体逃逸的突变主要位于S蛋白的受体结合域(Receptor Binding Domain,RBD)内。RBD区域内484位点的突变最早发现于B.1.351突变株,其位点的氨基酸由谷氨酸(E)突变为了赖氨酸(K)。在此之后发现的P.1突变株中同样存在此突变。研究表明RBD区域内484位点的氨基酸突变可单独或与其他位点氨基酸协同作用提高病毒逃逸抗体中和的能力。本研究利用深度突变扫描技术,探究SARS-CoV-2在携带E484K突变的基础上,其他位点发生随机突变时对特定新冠病毒中和抗体免疫逃逸功能的影响,提前获得变异与表型改变的关系,将为中和抗体的优选、广谱免疫原的设计以及病毒传播预警奠定基础。 目的: 通过密码子突变的方式构建由酵母展示的SARS-CoV-2 RBD随机突变库,利用深度突变扫描技术,使用基于磁微粒的新冠病毒免疫逃逸筛选方法,获得针对特定新冠中和抗体的RBD区域突变或突变组合。 方法: 1.将p ETcon＿SARS＿CoV＿2-RBD质粒为模板,根据其DNA序列,首先在编码第484位氨基酸的对应DNA序列引入点突变,使其表达的氨基酸由谷氨酸变为赖氨酸。将p ETcon＿SARS＿CoV＿2-RBD-E484K质粒以电转化的方式转化酵母细胞,利用外源蛋白所携带的Myc标签,与anti-c Myc的荧光抗体标记结合,用流式细胞分析技术检测RBD是否在酵母细胞表面表达。在证实RBD可在酵母细胞表面表达的基础上,通过优化诱导时间和诱导温度以提高RBD表达水平。 2.以p ETcon＿SARS＿CoV＿2-RBD-E484K质粒作为构建突变文库的初始模板,采用步移的方式设计合成覆盖在RBD每个氨基酸位点的NNS简并碱基的引物池,通过三轮PCR引入随机突变。再以第三轮突变PCR扩增后的回收产物为模板,用含有16位随机碱基序列的反向引物向每条DNA序列中引入barcode序列,将含barcode的突变片段与线性化质粒载体同源重组,转化大肠杆菌进行扩增,提取质粒。使用Pac Bio测序获得barcode与突变或突变组合之间的对应关系。 3.将突变文库质粒转化入酵母细胞,诱导RBD蛋白在酵母细胞表面表达。用磁珠分选法检测RBD蛋白突变对蛋白与抗体结合的影响。首先将展示新冠病毒RBD结构域的酵母细胞与磁珠耦联的ACE2受体蛋白孵育,磁性分离去除不能与ACE2蛋白结合能力的突变RBD。将分离得到的具备同ACE2蛋白结合能力的酵母细胞分别与磁珠耦联的58G6、55A8以及51D3三种新冠病毒中和抗体进行孵育,磁性分离逃逸中和抗体的酵母细胞,扩大培养后提取质粒进行Illumina测序确定barcode信息,再结合Pac Bio测序的结果可获得特定新冠病毒中和抗体逃逸相关的突变或突变组合。 结果: 使用快速定点突变试剂盒,在野生型RBD序列上引入E484K点突变,经测序比对,成功在p ETcon＿SARS＿CoV＿2-RBD质粒上引入该突变。将p ETcon＿SARS＿CoV＿2-RBD-E484K转化酵母细胞,流式细胞分析结果证实RBD可在酵母细胞表面表达,并通过调整诱导温度和诱导时间优化RBD表达水平。以p ETcon＿SARS＿CoV＿2-RBD-E484K为模板成功构建两个RBD突变文库,通过PCR为每种突变或突变组合添加上特有的barcode序列,Pac Bio测序获得突变文库的突变概貌并建立barcode-突变对应关系。将突变文库转化酵母细胞,用磁珠细胞分选技术分离出逃逸中和抗体结合的酵母细胞群,Illumina测序获得RBD不同突变或突变组合所携带的相应barcode序列及数目,综合分析得出不同突变介导特定抗体的逃逸分数并绘制突变-逃逸图谱,结合RBD-抗体复合物结构特征验证突变-逃逸图谱的合理性,进一步根据RBD各突变对其表达及其与ACE2结合的影响分析了介导抗体逃逸突变的适应性代价。 结论: 本研究成功构建了SARS-CoV-2 RBD的突变文库,利用深度突变扫描技术,探究了RBD各个位点的不同突变对新冠中和抗体免疫逃逸的影响,为针对SARS-CoV-2突变株的疫苗研发和抗体筛选与设计提供新的信息。

关键词： CRISPR-Cas13a   单碱基突变   核酸检测   新型冠状病毒   引物交换反应  

摘要： 目的及时鉴别新型冠状病毒变异毒株突变是遏制其传播的最佳方法之一。常用的测序方法周期长、费用高,不能满足快速鉴别新型冠状病毒的变异毒株的需要,探索其快速、简便鉴别方法是领域内的研究热点,通过Lw Cas13a蛋白的表达纯化,获得有活性的Cas13a蛋白;建立基于CRISPR技术的新型冠状病毒的核酸层析检测方法,并评价该方法对新型冠状病毒Delta变异毒株D614G单碱基突变检测的特异性。方法*** Cas13a蛋白的原核表达纯化:通过对其诱导温度、诱导时间及IPTG诱导剂浓度等条件进行优化,确定可溶性表达条件;通过镍亲和层析纯化蛋白并对其进行活性鉴定,以获取课题实验CRISPR反应体系中的关键试验生物活性材料;2.设计并通过CRISPR反应筛选新型冠状病毒的模板链及cr RNA:通过体外转录、RNA纯化及配对筛选,获得与模板链配对较好,且可激活Cas13a蛋白切割活性的cr RNA,以满足课题研究所需的核酸序列;3.筛选发卡结构与引物,通过优化引物交换反应（PER）扩增条件,设计并验证特异性探针,将CRISPR技术与PER后扩增技术联合后探究其灵敏度及特异性;以搭建的CRIPSR/PER核酸检测技术为载体,筛选新型冠状病毒Delta变异毒株D614G单碱基突变位点的特异性cr RNA,评价该技术对单碱基突变位点检测的特异性。结果1.确定了Cas13a蛋白诱导表达的最适温度为16℃,最佳时间16h,IPTG终浓度为1mmol/m L,纯化后的Cas13a蛋白纯度较高,对其活性鉴定后,其结果表明自制Cas13a蛋白活性较好,满足实验要求。2.获得了14条RNA序列,其中RNA-1与c RNA-1、RNA-2与cr RNA-7、RNA-3与cr RNA-11、RNA-4与cr RNA-17配对可较好激活Cas13a蛋白活性。3.筛选确定了H27发卡结构与P27引物配对的扩增效果最好;确定PER最佳扩增条件为:温度37℃,Bst DNA聚合酶加入4U,H27发卡结构加入10μL,Mg SO4加入1μL,d NTP加入2μL,扩增时间为40min;基于CRISPR/PER的核酸层析检测方法的最低检测限为:100pg/μL RNA模板链,特异性较好,该方法可特异性识别新型冠状病毒Delta变异株的D614G位点的单碱基突变。结论1.确定了Cas13a蛋白的诱导表达条件:IPTG终浓度为1mmol/L,16℃诱导表达16h;2.建立了CRISPR/PER实验室核酸检测方法,经初步测定该方法的最低检测限为100pg/μLRNA模板链,特异性较好;3.筛选确定了SARS-CoV-2原始毒株S和ORF1ab的2条cr RNA,SARS-CoV-2 Delta变异毒株D614G突变位点的特异性cr RNA,为SARS-CoV-2的检测及单碱基突变检测提供新思路。

关键词： 病死率   传染病   大流行   新冠肺炎  

摘要： 目的:本研究旨在探索一种利用人群水平监测大数据在传染病大流行过程中准确计算病死率的新方法,并以新冠肺炎为例计算全球各国家或地区疫情初期的病死率,以期为政府和卫生部门在疫情早期评价传染病危害、及时制定相关政策并采取有力措施提供数据支撑。方法:本研究探索出一种在传染病大流行过程中计算病死率的新方法,并将其命名为“假设T值法”。该方法对传统的病死率计算公式进行了调整,即病死率等于某天的累计死亡人数除以T天前的累计确诊人数,其中T值为某人群从疾病确诊到出现死亡结局的平均天数并且T值是从一系列假设值中筛选出来的。首先,利用模拟累计确诊病例数增长数据探索“趋近”规律:如果假设T值等于真实T值,实时病死率会保持不变,即等于疫情结束后使用定义法公式得到的真实病死率;如果假设T值大于(或小于)真实T值,实时病死率会大于(或小于)真实病死率,并随时间推移逐渐减小(或增加)直至无限趋近真实病死率。因此,在许多由假设T值计算出的具有增减趋势的实时病死率曲线中间,只要能找到最早保持稳定不变的那条曲线,就可以找到真实的T值并获得真实病死率;本研究将此法命名为“假设T值法”。然后,运用“假设T值法”计算中国湖北省和非湖北地区新冠肺炎疫情初期病死率并验证新算法的准确性。最后,运用“假设T值法”计算并分析全球其他国家新冠肺炎疫情初期病死率。结果:根据“趋近”规律和“假设T值法”,中国非湖北地区新冠肺炎疫情初期的病死率为0.8%,湖北省为6.6%;此外,两地区疫情初期每日估计病死人数与每日真实病死人数随时间变化曲线的吻合程度也验证了“假设T值法”的准确性。欧洲国家新冠肺炎疫情初期的病死率相对较高,其中荷兰为12.6%,意大利为14.1%,比利时为18.1%,瑞士、波兰和罗马尼亚约为6%,爱尔兰为7.9%;德国、葡萄牙、奥地利、挪威和捷克相对较低,约为3%至4%。在欧洲以外的其他国家中,美国新冠肺炎疫情初期的病死率为7%,智利为2.1%,以色列为1.6%。结论:本研究提供了一种利用人群水平监测大数据在传染病大流行过程中计算病死率的新方法,即“假设T值法”。该方法不仅简单有效,而且不受样本量和随访时间的限制,无需等到疫情结束便可准确计算病死率。该方法有助于为政府和卫生部门在疫情早期评价传染病危害、及时制定相关政策并采取有力措施提供数据支撑。

关键词： 县级政府   突发公共卫生事件   应急管理  

摘要： 近年来,突发公共卫生事件层出不穷,像2002年SARS、2009年甲型H1N1等,都具有涉及范围广、牵扯领域广、影响人数多等特点。2019年末至2020年初,新冠肺炎病毒疫情在我国武汉暴发,并迅速蔓延至全国各地,给当地人们的身心健康和正常的生产生活带来了巨大的威胁,同时也对当地经济的高质量发展、社会秩序的和谐稳定造成了一定的影响。为了有效防控新冠疫情的传播,我国各地县级政府采取了大量务实有效的防控措施,这些措施在遏制疫情蔓延、化解危机风险、维护社会稳定等方面起到了立竿见影的效果。然而,县级政府作为应对突发公共卫生事件的关键力量,在风险防控、物资储备、信息沟通和社会动员等工作中也存在着一些问题。县级政府只有不断健全有关工作机制,提升危机应对能力,才能更好地应对各类突发公共卫生事件,保障当地民众身体健康和生命安全,护航当地经济发展。为此,本研究拟通过总结滨州市B区新冠肺炎疫情防控的措施和问题,提出优化县级政府突发公共卫生事件防控的对策建议。本研究查阅滨州市B区政府官方公布的相关讯息和政策文件,了解了滨州市B区新冠肺炎疫情防控采取的具体措施。本研究以当地政府机关、相关领域专家、社会专业力量、基层一线工作人员、居民群众等对象,采用问卷调查、走访访谈等研究方法,了解了他们对滨州市B区新冠肺炎疫情防控的满意度评价,并运用危机管理理论、协同治理理论分析了滨州市B区新冠肺炎疫情防控的现有问题和产生原由,阐述了 B区政府进一步做好突发公共卫生事件防控工作的完善思路,对具有类似情况的县级政府来说提供了一些有价值的参考。

关键词： 冠状病毒感染   德尔塔变异株   奥密克戎变异株   临床特征   CT   高海拔  

摘要： 目的:通过分析比较甘肃省高海拔地区(海拔>1000米)新型冠状病毒德尔塔与奥密克戎变异株感染者的临床特征和胸部CT影像表现,探讨高海拔地区新型冠状病毒感染病例的临床表现及CT影像学特点,为高海拔地区新型冠状病毒感染的防治提供科学依据。方法:采用回顾性研究方法,收集兰州市重离子医院2021年10月1日至2022年9月31日,收治的1439例确诊病例,根据纳入和排除标准进行筛选后,共计纳入418名患者作为研究对象,包括103例德尔塔变异株感染病例(德尔塔组)及315例奥密克戎变异株感染病例(奥密克戎组),比较分析两组患者的人口学资料、临床特征、实验室检查、抗体水平、胸部CT影像学特征及临床预后特点。结果:共纳入确诊病例418例,其中德尔塔组103例,奥密克戎组315例。男性180例(43.1%),女性238例(56.9%),中位年龄分别为42岁和36岁,临床分型均以轻型为主;德尔塔组中的普通型和重型患者比例明显高于奥密克戎组;两组患者临床分型比较,差异有统计学意义(χ2=43.782,P<0.05)。新型冠状病毒疫苗全程接种率为32.3%(135/418),奥密克戎组全程疫苗接种率高于德尔塔组,各组间差异有统计学意义(χ2=52.202,P<0.001);奥密克戎组确诊至末次接种疫苗时间超过6个月的患者比例高于德尔塔组,差异有统计学意义(χ2=39.587,P<0.001);共采集血型样本112份,其中A型35例(31.3%)和B型39例(34.8%),比例高于AB型13例(11.6%)和O型25例(22.3%)患者,各组间差异无统计学意义(均P>0.05)。生活地区海拔>1500米的患者核酸转阴时间长于海拔1000-1500米地区的患者,差异有统计学意义(Z=-2.912,P=0.04)。德尔塔组和奥密克戎组患者核酸转阴时间(入院前后核酸阳性持续时间)中位数分别为为18天和12天,住院时间中位数分别为15天和10天,差异有统计学意义(Z=-9.379、-9.971,均P<0.05)。患者最常见的临床症状为咳嗽、咳痰,然后是发热、咽喉不适、肌肉关节酸痛等。奥密克戎组发热患者比例高于德尔塔组[48.3%(152/315)VS 16.5%(17/103)],差异有统计学意义(χ2=33.482,P<0.001)。两组患者中,有96名(23.0%)患者合并一种或多种疾病,其中德尔塔组患者合并的基础疾病更多。实验室检查结果显示:49例(11.7%)患者的淋巴细胞计数减少,其中德尔塔组患者5例(4.9%),奥密克戎组44例(14.0%),差异具有统计学意义(χ2=6.230,P=0.013)。德尔塔组患者的降钙素原和血清淀粉样蛋白A水平升高患者比例均低于奥密克戎组,差异有统计学意义(χ2=40.517,29.498,P<0.05)。患者入院时有258人(70.1%)Ig G抗体水平升高,其中德尔塔组患者升高比例高于奥密克戎组,差异有统计学意义(χ2=7.319,P=0.007);德尔塔组Ig M抗体水平升高比例高于奥密克戎组,差异有统计学意义(χ2=49.425,P<0.001)。胸部CT数据分析显示,两组患者全肺病变总体积/全肺体积、全肺磨玻璃样病变体积/全肺体积等指标,差异有统计学意义(均P<0.05)。结论:德尔塔和奥密克戎变异株感染者临床分型均以轻型为主,德尔塔变异株感染者普通型和重型比例高于奥密克戎变异株感染者;奥密克戎变异株感染者在发热及上呼吸道症状上更多见,肺部CT炎性病灶更少、病毒核酸转阴时间和住院时间更短;奥密克戎变异株感染人数更多,且多数在末次接种疫苗6个月以后确诊,与当地疫苗接种政策和疫苗接种后体内保护性抗体滴度降低有关;海拔高度可影响新冠病毒感染者的病毒核酸转阴时间和住院时间。