关键词:
新型冠状病毒
Delta毒株
潜伏期
超级传播
广义线性混合效应模型
摘要:
目的:通过分析江苏省南京市和扬州市2021年7月至8月感染新型冠状病毒B.1.617.2(Delta)毒株病例的流行病学接触追踪数据,来描述Delta毒株的潜伏期特征和超级传播潜力,应用多变量回归模型和亚组分析研究年龄、性别和疾病严重程度对潜伏期的影响。建模分析新疆乌鲁木齐市某医院新型冠状病毒感染(COVID-19)重症患者临床上的各项指标特征,筛选出影响COVID-19重症患者不能在短时间内转出重症监护治疗室(Intensive Care Unit,ICU)的影响因子,从而为该疾病的预后提供参考。方法:在江苏省南京市和扬州市卫生健康委员会官方网站上收集2021年7月至8月经实验室证实的新型冠状病毒B.1.617.2(Delta)毒株感染病例的接触者追踪数据。使用负二项分布(Negative binomial distribution,NB)方法,并对区间删失的观测数据进行调整,用于估计Delta毒株的潜伏期分布。使用区间删失的多变量逻辑回归模型分别阐述年龄、性别和疾病严重程度对潜伏期的影响。将疫情的传播模拟成一个典型的分支过程用于评估Delta毒株的的超级传播潜力,由负二项分布模型控制传播的异质性,并按不同的接触环境和年龄进行亚组分析。建立广义线性混合效应模型(Generalized linear mixed effect model,GLMM),采用基于极大似然估计的拉普拉斯近似(Laplace approximation)参数估计法,筛选出影响COVID-19重症患者不能在短时间内转出重症监护室的影响因子。结果:通过分析得出,新型冠状病毒B.1.617.2(Delta)的平均潜伏期估计为6.64天,95%置信区间(Confidence interval,CI)为6.27-7.00。研究发现,女性病例比男性病例的平均潜伏期要长,重型与危重型病例的平均潜伏期要比轻型与普通型病例相对较长。Delta毒株的潜伏期与疾病严重程度有关,即Delta毒株的潜伏期每增加一天,患重症的概率有轻微下降,调整后的优势比(Odds Ratio,OR)值为0.88(95%CI:0.71-1.07)。研究估计14%(95%CI:11%-16%)最具传染性的病例对南京市和扬州市80%的传播事件负责,其中74%(95%CI:69%-78%)的病例有0个后代次级病例。另外,研究发现江苏省南京市和扬州市麻将馆中的病例具有超强的传播潜力,有5%的病例产生了总传播量的80%次级病例。通过建立GLMM模型分析,得到影响COVID-19危重症患者不能在短时间内转出重症监护室的影响因素有4个:年龄(Age,0.949,95%CI:0.930-0.968)、C-反应蛋白CRP(C-reactive protein,0.984,95%CI:0.978-0.989)、肌酐Cr(Creatinine,1.027,95%CI:1.018-1.035)和乳酸脱氢酶LDH(Lactate dehydrogenase,0.993,95%CI:0.991-0.996),其中年龄、CRP和LDH的OR值小于1,说明这三个因素是保护性因素,且这三个因素的估计值为负,说明随着年龄、CRP和LDH水平的降低,COVID-19危重症患者在短时间内转出重症监护室的概率更大。相反,Cr是OR值大于1的风险因素,说明随着Cr水平的增加,COVID-19危重病人在短时间内转出重症监护室的概率更大。结论:本研究发现新型冠状病毒B.1.617.2(Delta)毒株的潜伏期在不同的年龄和疾病严重程度上都有差异。这些发现为Delta毒株的潜伏期提供了更多的信息。在严格的COVID-19疫情防控措施和积极的COVID-19核酸检测下,Delta毒株仍表现出巨大的超级传播潜力。所以加强对疾病传播性的监测,特别是在超级传播高风险环境中,将是缓解新出现变异毒株引起新一轮疫情的关键。在COVID-19患者转入ICU治疗的过程中,临床医生可以分析患者Cr指数下降和Age,CRP,LDH指数上升的原因,从而可以快速诊断出原因并进行治疗,从而使患者在短时间内转出ICU。