关键词： 新型冠状病毒   非结构蛋白1   突变体   核糖体  

摘要： 目的 探讨新型冠状病毒(SARS-CoV-2)非结构蛋白1(NSP1)重要变异对其与核糖体40S亚单位结合能力的影响.方法 基于生物信息学方法,选取可能影响与核糖体40S亚单位结合能力的NSP1氨基酸突变位点(D152A、E155A、F157S、T170S和R171L),PSIPRED在线工具分析突变体的二级结构,mCSM-NA预测其与核糖体的结合能力,DynaMut webserver分析突变对蛋白稳定性的影响;构建NSP1突变体,转染HEK-293T细胞,利用免疫共沉淀检测NSP1突变体与核糖体40S亚单位的结合能力,SUnSET实验评价突变体对蛋白合成率的影响;双荧光素酶报告基因实验、ELISA和RT-PCR方法进一步评价NSP1蛋白关键位点突变对IFN-β表达的影响.结果 生物信息预测5种突变体均可改变蛋白二级结构,其中F157S和R171L可降低NSP1与核糖体40S的结合能力.实验表明F157S和R171L突变显著减弱了 NSP1与核糖体40S的结合能力,增加了细胞总蛋白合成、IFN-β荧光素酶活性、细胞内IFN-β mRNA的表达及上清中IFN-β表达量(P<0.05).结论 NSP1 F157S和R171L突变显著减弱了 NSP1与核糖体40S的结合能力,增强了 IFN-1的反应,提示NSP1蛋白在免疫调节中起重要作用.

关键词： 新型冠状病毒   肝炎   自身免疫性疾病  

摘要： 2019年新型冠状病毒感染(COVID-19)的暴发导致了全球范围的大流行。虽然感染新型冠状病毒主要影响呼吸系统,然而对其他器官系统也造成影响,包括消化系统[1]、循环系统等[2-4]。缘于新型冠状病毒对血管紧张素转化酶2(ACE2)的作用,其特征是各器官受累,包括肠、心脏、肝脏等[5],其中肝脏受累常见,而且可能与疾病的严重程度相关。相关研究报道,在感染新型冠状病毒期间或之后,也会导致自身免疫疾病的新发或者发作,提示感染新型冠状病毒可以打破免疫耐受并导致自身免疫疾病的发生[6]。自身免疫性肝炎(AIH)的临床特点包括血清氨基转移酶水平升高、高免疫球蛋白G(IgG)血症,另外,还表现为血清自身抗体的阳性,可以由实验室检查发现[7]。众所周知,化学品和药物、环境因素可成为肝脏自身免疫过程的触发因素。而作为病毒的一种,新型冠状病毒也可能引发AIH,本文介绍3例相关患者,现将临床特征和病理表现报道如下。

关键词： 新型冠状病毒   内窥镜检查   低氧   危险因素   保护因素  

摘要： 目的筛选新型冠状病毒感染患者无痛消化内镜诊疗(PGIE)术中低氧血症的危险因素。方法回顾性收集2022年12月至2023年4月于我院行PGIE的新型冠状病毒感染患者病例资料,根据术中低氧血症发生情况分为低氧血症组(n=201)和非低氧血症组(n=747),采用logistic回归分析法,筛选术中低氧血症的影响因素。结果2组年龄比率、ASA分级比例、吸烟程度比率、高血压病程比率、PGIE类型比率、实施PGIE时段、诱导前MAP、距离确诊新型冠状病毒感染时间、新型冠状病毒感染分型比率和咳嗽情况比率比较差异有统计学意义(P<0.05)。多因素logistic回归分析结果显示:年龄51~65岁、年龄>65岁、吸烟程度-轻度、吸烟程度-中重度、新型冠状病毒感染期间相关症状及体征-至PGIE咳嗽未愈、新型冠状病毒感染期间相关症状及体征-至PGIE咳嗽已愈是术中发生低氧血症的独立危险因素;PGIE类型-结肠镜、距离确诊新型冠状病毒感染时间43~56 d、距离确诊新型冠状病毒感染时间57~70 d、距离确诊新型冠状病毒感染时间>70 d是术中低氧血症的独立保护因素。结论年龄>50岁、有吸烟习惯、新型冠状病毒感染期间出现咳嗽是PGIE术中低氧血症的独立危险因素;PGIE类型为结肠镜和距离确诊新型冠状病毒感染时间>42 d是术中低氧血症的独立保护因素。

关键词： 新型冠状病毒   急性ST段抬高型心肌梗死   临床分析  

摘要： 目的:分析合并新型冠状病毒(COVID-19)感染的急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者的临床特点。方法:回顾性分析9例COVID-19感染的STEMI患者的临床资料,分析其临床特点、影像学特征、治疗及转归情况。结果:9例COVID-19感染的STEMI患者中,男性5例[55.6%(5/9)],女性4例[44.4%(4/9)],年龄(72.4±12.4)岁。9例患者均接受了经皮冠状动脉介入治疗(PCI),其中有5例[55.6%(5/9)]患者的TIMI血流分级为0~1级,5例[55.6%(5/9)]存在冠状动脉急性血栓,3例[33.3%(3/9)]患者的TIMI血栓分级均为4~5级。结论:COVID-19感染的STEMI患者的血栓形成率较高,且其动脉血栓负荷更严重,临床医生需更进一步认识新冠感染后的心血管危害。

关键词： 肺系疫病   新型冠状病毒感染   逆顺传变观   防治策略   中医药疗法  

摘要： 通过阐释肺系疫病“逆顺传变观”,提出了肺系疫病的潜伏期(未病)、发作期(顺传、逆传)、瘥后期(迁延、新病、恢复)三期演变规律;并结合新型冠状病毒感染病机演化,聚焦肺系疫病分期分型防治,提出了新型冠状病毒感染未病先防发、既病防逆传、瘥后防新病的防治策略。为未来可能发生的肺系疫病提供理论支撑,并进一步指导临床实践。

关键词： 新型冠状病毒肺炎   人免疫球蛋白   血常规   降钙素原   C-反应蛋白  

摘要： 目的探讨丙种球蛋白对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)、PCT、CRP的影响。方法选取2022年12月至2023年2月COVID-19患者80例,随机分为对照组和观察组,各40例。两组患者均采用抗病毒治疗方案、早期抗凝、糖皮质激素抗炎及氧疗等对症治疗。观察组在对照组基础上加静脉注射人用丙种球蛋白针,治疗5 d。动态检测两组治疗期间动血常规、PCT、CRP等感染指标变化情况,动态检测动脉血气、肺部影像评估感染控制情况和不良反应发生情况。结果与治疗前比较,两组患者NLR、PCT、CRP数值均下降,差异有统计学意义(P<0.05);治疗后两组比较,观察组NLR值下降更明显,差异有统计学意义(P<0.05)。两组患者住院时间、不良事件发生率,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论丙种球蛋白能降低新型冠状病毒肺炎患者的NLR,有助于病情改善。

关键词： 新型冠状病毒   全基因测序   ORF7a蛋白   生物信息学  

摘要： 目的 了解晋中市新型冠状病毒(SARS-CoV-2)全基因组特征及变异情况,分析ORF7a蛋白的结构与功能.方法 对晋中市2023年4月份流感样病例进行新冠核酸检测,将获得的6例新冠阳性标本进行全基因测序,并对其进行变异分析,另外应用生物信息在线软件,分析预测ORF7a蛋自序列冠状病毒属同源性、理化性质、磷酸化位点、信号肽、糖基化修饰、亚细胞定位、二级结构和三级结构等.结果 共获得6例新冠病毒的全基因组序列,拼接后有效全长在 29 628 bp~29 668 bp 之间,与 SARS-COV-2(NC_045512.2)序列相对比,均属于 Omicron 变异株BF.7.14进化分支.6个毒株存在79~85个核苷酸变异位点,59~63个氨基酸变异位点,且在ORF7a区突变情况一致:核苷酸位点均为C27532T突变,氨基酸位点均为H47Y突变;进化树分析表明,ORF7a蛋白与马蹄蝠肌腺病毒(WMT59664.1)的ORF7a蛋白同源性最高;用在线软件进行生物信息学分析表明,ORF7a为不稳定蛋白,由121个19种氨基酸组成,摩尔系数以Leu(15个,占 12.30%)、Phe(10 个,占 8.20%)和 Thr(10个,占 8.20%)较高,Met(1 个,占 0.82%)较低,而Trp含量为0,存在4个磷酸化位点,未发现潜在的糖基化修饰位点,含有一个信号肽区切割位点位于C15-E16之间,疏水性较强;其二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主,属于跨膜蛋白,在细胞外(包括细胞壁)、质膜中、内质网和高尔基体中存在的可能性依次为34.8%、30.4%、21.7%和13.0%.结论 对晋中市Omicron变异株及其ORF7a蛋白进行系统性分析,以全面了解ORF7a生物信息学特征,为新冠疫苗及抗新冠药物研制提供依据.

关键词： 腹膜透析   教学   新型冠状病毒肺炎   再培训   考核得分  

摘要： 目的调查新型冠状病毒感染(新冠感染)疫情期间间隔1年再培训腹膜透析(peritoneal dialysis,PD)操作者(患者本人、家属或保姆)考核得分的变化,以期为针对性培训提供依据。方法该研究为横断面调查研究。纳入2019年11月1日至2021年2月28日新冠感染疫情期间北京大学人民医院肾内科先后参加间隔1年的2次培训的维持性PD患者。新冠感染疫情期间,再培训由常规每6个月1次延长至1年1次。收集患者的临床资料,采用自行设计的培训考核评分表(包括理论知识和操作技能考核)调查2次培训的考核得分,比较间隔1年再培训PD操作者的考核得分总分及分项得分。采用Logistic回归分析法分析考核得分下降的相关因素。结果共59例患者入选该研究,男性35例(59.32%),年龄为(58.41±14.52)岁,透析龄为42(12,84)个月,患者本人操作54例(91.53%),操作者文化程度为大学及以上22例(37.29%)。间隔1年再培训前后PD操作者考核得分总分分别为(83.17±7.90)分和(80.61±8.20)分(t=2.732,P=0.008),其中考核得分下降35例(59.32%)。在分项计分的6项内容中,与1年前相比,1年后并发症处理(t=4.928,P<0.001)和自我监测(t=3.222,P=0.002)考核得分均明显下降;而1年前后环境与卫生、换液操作、出口护理、饮食考核得分差异均无统计学意义(均P>0.05)。透析龄<12个月、36~60个月的PD操作者间隔1年后考核得分总分显著下降(t=2.309,P=0.041;t=3.086,P=0.009),透析龄12~<36个月、>60个月的PD操作者间隔1年后考核得分总分差异均无统计学意义(均P>0.05)。Logistic回归分析结果显示,透析龄是考核得分下降的独立相关因素(透析龄36~60个月/>60个月,OR=6.233,95%CI 1.035~37.529,P=0.046)。结论新冠感染疫情期间减少再培训频率后PD操作者考核得分明显降低,尤其是透析龄36~60个月患者,知识薄弱处集中在并发症处理及自我监测方面,如因特殊情况无法开展定期再培训,应针对重点人群、重点内容加强培训。

关键词： 新型冠状病毒   S-EABR   启动子   终止子   信号肽   信号识别颗粒  

摘要： 目的通过优化启动子、终止子、信号肽及胞内序列末端氨基酸来增加SARS-CoV-2 S-EABR蛋白在293T细胞系中的分泌性表达。方法首先构建四种含有不同元件(启动子和终止子)组合的PCDNA3.1(-)真核载体质粒(Mb、MS、Ab、AS),插入按照人密码子优化的S-EABR-1目的序列,瞬时转染293T细胞,48 h后收取细胞培养上清液和细胞裂解液,通过Western Blot和ELISA检测上清S蛋白的表达水平。然后选择表达最好的元件组合载体,插入S-EABR-1和S-EABR-2(于S-EABR-1尾部添加4个氨基酸——HSLP)目的序列,比较上清S蛋白的表达水平。最后基于上述表达效果最好的元件组合载体及插入目的序列,构建替换SARS-CoV-2 S蛋白原始信号肽的5种载体质粒(tPA,AZ,IFNα2,HSA,GLUC),比较上清S蛋白表达水平。同时利用计算机模拟SRP54亚基与信号肽核酸序列的分子对接,将对接分值(Docking Score)作为对接评价标准,预测两者的结合情况。结果在293T细胞中,Ab组合的载体分泌表达S-EABR水平最高,产量相较于Mb增加了125%。基于Ab组合载体,S-EABR-2序列表达分泌S-EABR的水平较S-EABR-1增加了约50%,进一步替换成HSA信号肽后的S-EABR表达分泌水平较S蛋白原始信号肽增加了约83%。此外,计算机模拟结果显示HSA与SRP54亚基的对接分值最高,为1505.861。结论通过真核表达元件(启动子、终止子和信号肽)及胞内序列的优化可进一步提高经密码子优化后的S-EABR在293T细胞中的分泌性表达。信号肽与SRP54亚基亲和力的计算模拟对接分值与S-EABR分泌表达水平基本吻合的结果也为后续提高目的基因分泌性表达的信号肽筛选提供了一种设计思路和筛选策略。

关键词： 诺卡菌   诺卡菌感染   新型冠状病毒感染   支气管扩张症并发症  

摘要： 目的探讨支气管扩张症患者新型冠状病毒感染治疗过程中诺卡菌感染的诊断方法。方法对1例支气管扩张症患者新型冠状病毒感染治疗过程中诺卡菌感染的诊断资料作回顾性分析。结果患者因“咳嗽、咳痰、气促半月,加重伴发热3 d”入院。患者有支气扩张症10余年,入院时血常规检查白细胞30.55×109/L,动脉血气分析提示Ⅰ型呼吸衰竭,胸部CT检查可见肺多发渗出、实变、多发小空洞,右肺中叶、左肺上叶部分支气管扩张并感染,咽拭子标本检测新型冠状病毒核酸阳性,初步诊断为支气管扩张合并重症肺炎、新冠病毒感染及呼吸衰竭,予哌拉西林钠他唑巴坦联合左氧氟沙星抗感染、奈玛特韦片/利托那韦片抗病毒、氧疗等治疗效果不佳。为进一步明确诊断,患者行支气管镜检查,肺泡灌洗液宏基因组二代测序(mNGS)及培养结果均为诺卡菌阳性,明确诊断为诺卡菌合并新型冠状病毒感染。结论对新型冠状病毒感染治疗效果不佳的支气管扩张症患者,需注意合并诺卡菌感染可能,肺泡灌洗液mNGS有助于明确诊断诺卡菌感染。