关键词： CRISPR/Cas13a系统   均相电化学生物传感器   核酸检测   新型冠状病毒   Ⅰ型人类免疫缺陷病毒  

摘要： 目的建立基于CRISPR-Cas13a系统的均相电化学生物传感器并用于病原微生物的核酸检测。方法通过逆转录-重组酶介导链替换核酸扩增技术(RT-RAA)对目标核酸进行扩增,经过体外转录后,激活Cas13a蛋白高效切割单链RNA的活性并对标记有亚甲基蓝(MB)的报告RNA进行剪切,构建CRISPR均相电化学生物传感器;通过遴选报告RNA上寡核苷酸的长度优化该传感器;利用该传感器检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)RNA和Ⅰ型人类免疫缺陷病毒(HIV-1)RNA,并对其检测性能进行评价。结果建立了一种基于CRISPR-Cas13a系统和RT-RAA等温扩增技术的均相电化学生物传感器,利该方法使用相对应的扩增引物和CRISPR RNA(crRNA)后能稳定检测出低至10^(2)拷贝/μl的SARS-CoV-2 RNA和HIV-1 RNA,并与其他多种病原体未发生交叉反应。结论该基于CRISPR-Cas13a系统的均相电化学生物传感器具有制备简单、灵敏度高、特异性好和通用性强等优点,为病原微生物的现场快速检测提供了新的可行方案。

关键词： 重症肺炎   冠状病毒感染   糖皮质激素   曲霉感染   肺炎克雷伯菌   脓毒症   合并感染   肺部影像  

摘要： 2022年底至2023年初广州地区新型冠状病毒感染住院患者的毒株主要为奥密克戎BA.5.2(91.4%),合并感染除了常见的院内感染病原体(如肺炎克雷伯菌),特别需关注曲霉感染。奥密克戎株感染可引起病毒性脓毒症,导致预后更差。重症新型冠状病毒感染不等于重症肺炎,临床上需综合考虑肺部影像和其他系统的情况。合并新型冠状病毒感染的糖尿病患者并没有从糖皮质激素治疗中获益,这些患者使用糖皮质激素需要慎重。

关键词： 新型冠状病毒   核酸检测   质量控制  

摘要： 目的分析采样液对新型冠状病毒核酸提取效率的影响,为完善实验室质控措施提供依据。方法对两批不同品牌采样管(A/B)采集的新型冠状病毒待测标本,分别用两种不同厂家生产的提取试剂(甲/乙)进行核酸提取,用同一品牌的扩增试剂和扩增仪器进行实时荧光RT-PCR检测,分析其检测结果。结果两种提取试剂对于A采样管的提取效率差异有统计学意义(P<0.05),乙提取试剂阳性检出率高于甲试剂(66.67%vs 20.83%),ORF1ab平均Ct值低于甲试剂(31.1 vs 38.2),N基因平均Ct值低于甲试剂(29.9 vs 35.2)。两种提取试剂对于B采样管的提取效率差异不明显(P>0.05)。结论不同采样管与不同提取试剂匹配效果不同,实验室质量控制中性能验证应加强采样管(液)与提取试剂的匹配性验证。

关键词： 智慧安防管理系统   人脸识别   5G+MEC   数据中台  

摘要： 新冠肺炎疫情防控要求下,全球汽车产业链备受冲击。做好疫情防控,保障复工复产尤为重要。整车生产企业作为汽车工业集大成之终端,是行业发展的驱动引擎。2022年3月份以来出现的上海、吉林等地的疫情,对国内整个汽车产业链影响巨大,防疫工作对保供保产的先决条件。其中企业在防疫管理的地位尤为关键。工厂安防管理是整个园区治理的核心,把紧出入口是保障园区有效运营的先决条件。随着技术的不断迭代进步,基于人脸识别、5G+多接入边缘计算(Multi-access Edge Computing, 5G+MEC)、人工智能(Artificial Intelligence, AI)、物联网(Internet of Things, IoT)和数据中台等技术的新一代工厂智慧安防管理系统逐步出现。文章基于新技术在企业安防管理应用和如何实现园区防疫安全及员工体验提升的实现路径进行详细的研究和阐述。

关键词： 新型冠状病毒(SARS-CoV-2)   环境   感染风险   文献综述  

摘要： 目的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)不断出现的新变异体持续引起广泛关注,综述关于SARS-CoV-2通过环境传播的感染风险研究进展,有助于更好地研究SARS-CoV-2的传播机制。方法基于数学模型、动物模型、环境监测这三类方法,查询国内外相关文献,综述SARS-CoV-2通过不同路径传播的感染风险。结果在符合查询条件的19847篇中,共计60篇纳入研究。总结数学模型的相关研究,发现SARS-CoV-2通过飞沫传播的风险最大,其次为气溶胶传播,最后为接触传播。佩戴口罩和室内通风可以有效降低SARS-CoV-2的感染风险。动物模型中雪貂和仓鼠常被作为研究对象,实验结果表明,空气传播(包含气溶胶和飞沫传播)可致近82%的易感动物感染,可能是SARS-CoV-2的主要传播路径。环境监测发现一些关键的物品表面可检测到SARS-CoV-2病毒,但浓度一般较低,使用定量微生物风险评估方法发现间接接触传播的单次感染风险可低至万分之一。结论相比于间接接触传播,空气传播可能是SARS-CoV-2的主要传播路径。

关键词： 血清流行病学研究   免疫接种,加强   新型冠状病毒   奥密克戎变异株  

摘要： 对北京市2022年一起新型冠状病毒疫苗接种人群新型冠状病毒感染聚集性疫情进行流行病学调查,并采集21例感染者和61例密切接触者血清标本(其中20例隔离观察期核酸转阳)。抗体检测结果显示:2例感染者IgM抗体阳性,密接转阳者、密接未转阳者和感染者的IgG抗体阳性率分别为36.84%(7/19)、63.41%(26/41)和71.43%(15/21)。98.78%的对象曾接种新型冠状病毒灭活疫苗,3剂疫苗接种者IgG抗体阳性率为86.00%(43/50),高于1~2剂者[16.12%(5/31)];3剂接种者抗体水平[M(Q_(1),Q_(3))为4.255(2.303,7.0375)]高于1~2剂接种者[M(Q_(1),Q_(3))为0.000(0.000,0.000)](均P<0.001)。末次接种时间<3个月者抗体水平M(Q_(1),Q_(3))为7.335(1.909,7.858),高于接种时间≥3个月者[M(Q_(1),Q_(3))为2.125(0.000,4.418)](P=0.007)。3剂次密接转阳者IgG抗体阳性率和抗体水平M(Q_(1),Q_(3))分别为77.78%(7/9)和4.207(2.216,7.099),均高于1~2剂次者[分别为0和0.000(0.000,0.000)](均P<0.05)。

关键词： 关键基因   2019新型冠状病毒感染(COVID-19)   脓毒症   加权基因共表达网络(WGCNA)   差异基因表达(DEG)   基因本体论(GO)   京都基因与基因组百科(KEGG)  

摘要： 目的 识别2019新型冠状病毒感染(COVID-19)相关脓毒症的关键基因和信号通路。方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载基因芯片数据。采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)确定COVID-19和脓毒症的枢纽模块,并将两个模块交叉确定与COVID-19相关脓毒症的共同基因。采用R软件筛选出COVID-19和脓毒症差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),同时结合WGCNA和差异分析的结果,得到与COVID-19和脓毒症相关的候选基因,最后将两者取交集得到COVID-19相关脓毒症的关键基因。对与COVID-19相关脓毒症的共同基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,得到基因功能和参与的信号通路。结果 通过WGCNA获得了COVID-19相关枢纽模块和脓毒症相关枢纽模块。将两个模块交叉,共获得49个共同基因。结合WGCNA和差异分析的结果,得出与COVID-19和脓毒症相关的候选基因,通过将候选基因交叉,共筛选出11个关键基因(CCD82、CEACAM8、G6PD、HLA-DMB、HLA-DPA1、IL-1β、LTB4R、LTF、MME、S100A9、TGF-β1)。根据功能富集分析,共同基因主要在免疫和炎症相关通路中增强。结论 本研究通过构建WGCNA方法筛选出COVID-19相关脓毒症的11个关键基因,可能成为潜在的COVID-19相关脓毒症诊疗相关候选靶点。

关键词： 公立医院   脆弱性分析   应急体系   疫情防控  

摘要： 医院应急体系既是卫生应急体系的重要组成部分,也是卫生应急体系有效发挥作用的关键环节。在应对新型冠状病毒感染疫情过程中,医院应急体系发挥了积极作用,但也暴露出应急体系不完善、能力不足、机制不健全等诸多问题与短板。本研究通过对宁夏56家二级以上公立医院应急体系建设情况调研,分析目前医院应急体系存在的主要问题,从而对建立和完善应急体系及机制,提升医院应急能力等方面提出对策建议。

关键词： 新型冠状病毒感染   淋巴细胞计数   奥密克戎变异株  

摘要： 目的探讨新型冠状病毒奥密克戎变异株感染患者淋巴细胞计数与预后关系。方法收集首都医科大学附属北京安贞医院2022年12月8日至2023年1月31日在院且于2023年2月1日前出院的新型冠状病毒奥密克戎变异株感染1313例患者的病历资料;根据淋巴细胞计数三分位数将患者分为3组,T1组(淋巴细胞计数≤0.59×10^(9)/L)433例;T2组[淋巴细胞计数(>0.59~1.07)×10^(9)/L]437例;T3组(淋巴细胞计数>1.07×10^(9)/L)443例。比较3组患者一般资料,采用Kaplan-Meier生存曲线分析各组患者生存情况。根据临床预后,将患者分为存活组与死亡组,使用限制性立方样条图分析患者淋巴细胞计数与预后关系,使用Cox回归模型分析不同模型中各指标与患者预后关系。结果1313例新型冠状病毒奥密克戎变异株感染患者,存活1038例(79.1%),死亡275例(20.9%)。T1组死亡比例、男性比例、年龄大于T2、T3组,体重指数小于T2、T3组(均P<0.05)。死亡组患者全程淋巴细胞计数均低于存活组,差异均有统计学意义(均P<0.001)。Kaplan-Meier生存曲线结果显示,T1组累积死亡率显著高于T2、T3组(P<0.001)。Cox回归分析结果显示,模型1(调整性别、年龄、体重指数)、模型2(模型1+既往病史)、模型3(模型2+血常规指标)校正后入院淋巴细胞计数均与患者预后显著相关(风险比分别为0.32、0.27、0.46,均P<0.01)。模型3校正后,限制性立方样条图显示,入院淋巴细胞计数与患者预后呈非线性关系(P=0.003);当入院淋巴细胞计数<0.844×10^(9)/L时,淋巴细胞计数降低与死亡风险升高相关(风险比=0.122,95%置信区间:0.054~0.275,P<0.001)。结论新型冠状病毒奥密克戎变异株感染患者入院淋巴细胞计数与预后呈非线性关系,淋巴细胞计数<0.844×10^(9)/L时,淋巴细胞计数越低,患者死亡风险越大。

关键词： 化湿宣肺合剂   新型冠状病毒   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接探寻化湿宣肺合剂用于防治新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的活性化合物、作用靶点及通路,探索其可能的作用机制。方法:借助TCMSP、ETCM等数据库检索化湿宣肺合剂中药物的化学成分和作用靶点,使用Cytoscape软件构建其“中药-活性成分-相关靶点”网络图,通过GO富集和KEGG通路注释分析预测潜在的作用机制,并将化湿宣肺合剂中的核心成分与SARS-CoV-2、血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接验证。结果:经筛选获得化湿宣肺合剂共280个活性化合物与4713个作用靶点,关键靶点涉及病毒感染、AKT1、TNF、MAPK及VEGF等。GO富集分析得到细胞组成(CC)功能条目599个,KEGG通路获得113条(P<0.05),主要涉及甲型流感(Influenza A)信号通路、TLR(Toll-like receptor)信号通路、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路等。分子对接结果显示化湿宣肺合剂中连翘苷、绿原酸、阿魏酸、木犀草素等核心成分与核心蛋白的亲和力较强。结论:化湿宣肺合剂中的连翘苷、绿原酸、木犀草素等核心成分可能通过与ACE2、3CL等的结合来抑制病毒的侵袭和复制,并可能通过调节IL6、MAPK3、MAPK1、IL1β、CCL2、EGFR和NOS3等关键靶点而在新冠肺炎的治疗中发挥作用,或为治疗新型冠状病毒肺炎的活性化合物。