关键词： SARS-CoV-2   Omicron   RdRp   多序列比对   分子对接  

摘要： RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)在新型冠状病毒——严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)复制中发挥重要作用,是主要的抗病毒靶点。RdRp的功能严格依赖其空间结构,而关键氨基酸位点的突变可能导致空间结构和功能的改变。为了探究对SARS-CoV-2原型株有效的RdRp抑制剂是否对Omicron变异株仍存在抑制效果,对我国近两年流行的Omicron变异株的913个RdRp优质序列进行多序列比对。与原型株相比,这些Omicron变异株的RdRp序列既存在同义突变又存在错义突变。在错义突变中,除少数低频突变位点外,44%为P323L,34%为P323L和G671S双重突变,12%为P323L、G671S和D63N三重突变,分别将包含这3类突变的Omicron RdRp归为1_RdRp、2_RdRp和3_RdRp。利用AlphaFold2构建这3类RdRp的蛋白质结构模型,并通过PyMOL将Omicron与原型株的RdRp结构进行叠合比对,结果显示3类蛋白质3D结构均与原型株的RdRp(6M71_RdRp)高度重叠,提示突变未对RdRp的空间结构产生显著影响。在此基础上,将3种Omicron RdRp蛋白模型分别与4种已报道的RdRp抑制剂对接,结果显示这4种抑制剂依然能稳定结合在各Omicron RdRp模型的活性中心,提示RdRp是一个长期有效的靶标。基于此,构建的细胞外RdRp酶活反应和检测体系将有助于靶向RdRp的抗病毒药物的评价或筛选。

关键词： 新型冠状病毒   再感染率   三次感染率   随访调查  

摘要： 【目的】通过对2022年3—5月既往新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸阳性者随访调查,了解阳性者于2022年12月—2023年1月的二次感染和三次感染情况及再感染的影响因素。【方法】分析2022年3—5月2583例SARS-CoV-2核酸阳性者流行病学资料,并于首次核酸阳性后第8个月和第12个月分别随访。采用Pearson卡方检验比较不同特征的首阳者二次感染和三次感染率的差异;采用生存分析Kaplan⁃Meier法和Cox回归分析再感染的影响因素。【结果】核酸阳性后第8个月回收有效问卷2264份,回收率87.7%,二次感染率9.7%;第12个月调查分析二阳者第三次感染情况,三次感染率4.6%。二次感染距首阳中位间隔时间(P25,P75)为261(252,268)d,三次感染距第二次感染中位间隔时间(P25,P75)为135(111,157)d。性别、年龄、职业、吸烟和饮酒以及基础性疾病与二次感染风险差异无统计学意义(P>0.05)。医务人员三次感染率(20.0%)高于学生/教师(14.3%)和企事业员工三次感染率(9.5%),不同职业人员三次感染率差异有统计学意义(P<0.05)。职业中个体户再感染风险较企事业员工低(HR=0.52,95%CI:0.33~0.83),经性别和年龄调整后仍旧较低。有基础性疾病者二次感染的风险是无基础性疾病者的1.54倍(95%CI:1.08~2.02),经性别和年龄调整后是1.85倍(95%CI:1.25~2.75)。【结论】随着SARS-CoV-2的不断变异,二次感染和三次感染风险不可避免。有基础性疾病和所从事职业是影响二次感染或三次感染的主要因素。

关键词： 杏苏止嗽汤   呼吸导引操   新型冠状病毒感染  

摘要： 目的:探讨杏苏止嗽汤联合呼吸导引操治疗新型冠状病毒感染轻、中型患者的临床疗效。方法:观察150例轻、中型新型冠状病毒感染患者的临床资料,采用阿兹夫定片(对照组)、杏苏止嗽汤联合呼吸导引操(治疗组)、杏苏止嗽汤、呼吸导引操联合阿兹夫定片(中西医结合组)分组进行治疗。观察各组患者治疗效果。结果:治疗组及中西医结合组治疗时间均较对照组显著缩短,差异有统计学意义(P<0.05),治疗组与中西医结合组比较差异无统计学意义(P>0.05)。治疗后各组患者症状均较治疗前显著改善,中医症状积分治疗组和中西医结合组较对照组显著降低(P<0.05),治疗组与中西医结合差异有统计学意义。治疗后淋巴细胞计数水平、淋巴细胞百分比治疗组均显著高于对照组及中西医结合组(P<0.05)。结论:杏苏止嗽汤联合呼吸导引操治疗新型冠状病毒感染轻、中型患者疗效显著,较单纯西药治疗优势明显。

关键词： 新型冠状病毒感染   医护人员   临床特征  

摘要： 目的研究医院工作人员感染新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)的鼻、咽部临床特征,为今后新型冠状病毒感染医护人员的救治提供依据。方法选择我院部分科室(呼吸科、耳鼻咽喉科、感染科、消化科、血液科、急诊科、重症医学科、口腔外科、烧伤科、儿科、风湿免疫科、麻醉科、药剂科、消毒供应室、肝胆外科)的医护人员,调查2022年12月1日~2023年1月14日期间是否感染新型冠状病毒及其相关鼻及咽部临床特征、心理健康等进行问卷调查。统计学方法:临床症状大多为多分类变量,采用单因素逻辑回归分析各个症状与各分组(涉疫科室与非涉疫科室、有心理问题与无心理问题)之间的相关性。将心理问题进行分数数值转化,工作环境、工作强度、年龄以及职业等计数资料采用百分比表示,组间比较选用皮尔逊卡方检验,新冠持续天数组间比较选用两独立样本T检验。结果共收集有效医护人员调查问卷1212份,按照不同科室、心理健康评分进行分类,组内及组间比较得出结论。依据科室涉疫情况分类,非涉疫科室的人员病程更长,更容易出现寒战、口渴口干、喜饮水等症状(P<0.05),涉疫科室人员嗅觉减退/消失、味觉减退/消失、咽痒、胸痛等症状更明显(P<0.05)。将人员工作环境及基础情况同是否有心理问题进行相关性分析,外科医护人员和新冠持续时间是出现心理问题的危险因素(P<0.05)。结论不同科室医护人员感染新型冠状病毒后鼻、咽部等上呼吸道临床特征有细节上的不同,同时应重视新型冠状病毒感染后医护人员的心理问题。

关键词： 新型冠状病毒感染   医院消毒   消毒效果   合格率  

摘要： 目的了解新型冠状病毒(以下简称“新冠病毒”)感染疫情发生前后浙江省医院消毒效果。方法采用回顾性调查方法,对新冠病毒感染疫情发生前后该省3家医院的消毒质量监测结果资料进行统计分析,比较消毒合格率差异。结果新冠病毒感染疫情发生前的2017—2019年共监测1931份样本,总合格率为86.74%;疫情发生后的2020—2022年共监测1850份样本,总合格率为93.14%,合格率高于疫情前(χ^(2)=42.411,P<0.001)。按季度监测结果显示,疫情发生后第一、四季度和第二、三季度消毒效果的总合格率均高于疫情前同期水平(92.40%vs 89.02%,93.84%vs 84.24%;χ^(2)=6.430和44.193,P<0.05)。相较于疫情发生前,疫情发生后医疗用水卫生质量和内镜消毒合格率明显上升(98.04%vs 63.31%,100.00%vs 96.26%;χ^(2)=138.499和5.430,P<0.05)。结论新冠病毒感染疫情发生后医院消毒合格率明显提升,但仍要关注洁净手术室、手卫生和医院污水等消毒薄弱环节。

关键词： 新型冠状病毒   中和抗体   孕妇   新生儿  

摘要： 目的了解新型冠状病毒中和抗体在孕妇体内的转化过程。方法选取2022年12月至2023年9月在该院产检的90例孕妇作为研究对象,其中39例为孕妇外周血-羊水组,51例为孕妇外周血-新生儿外周血组,采用化学发光法,对所有标本进行检测,明确两组间中和抗体含量的对应关系。结果孕妇外周血与羊水中的中和抗体水平存在正相关性,孕妇外周血与新生儿外周血中的中和抗体水平存在正相关性。结论新型冠状病毒中和抗体在孕妇体内的转化过程为新型冠状病毒感染产前检测和临床诊疗提供新的思路。

关键词： 新型冠状病毒   疫苗   pH值   渗透压摩尔浓度   铝含量   能力验证  

摘要： 目的通过开展新型冠状病毒灭活疫苗pH值、渗透压摩尔浓度、铝含量的测定能力验证,评价疫苗质控实验室及疫苗生产企业实验室的检测能力。方法采用F检验和t检验对新型冠状病毒灭活疫苗样品开展均匀性和稳定性考察,样品通过均匀性稳定性检验后冷链运输分发至各参加实验室。以Z比分数评价参加实验室的pH值、渗透压摩尔浓度、铝含量检测能力。结果全国共有30家实验室参加本次能力验证活动,pH值、铝含量考核结果均为满意,2家实验室渗透压摩尔浓度考核结果为不满意,后经参加测量审核,获得满意结果。结论参加本次能力验证的省级疫苗质控实验室以及疫苗生产企业具有较好的检测能力和质控水平。

关键词： 病毒采样管   新型冠状病毒   数字聚合酶链反应   回收试验  

摘要： 目的:检测不同厂家病毒采样管中样本保存液对核酸样本的保存能力;方法:相同体积的新型冠状病毒核酸标准物质加入相同体积的样本保存液中作为观察组,对照组将相同体积的标准物质用RNA保存液稀释,经核酸提取后用数字聚合酶链反应进行绝对定量,计算浓度和回收率;结果:经数字聚合酶链反应定量后,10个观察组的回收率在40%~95%范围内;结论:不同样本保存液对核酸样本的保存能力不同,差异具有显著性。

关键词： 定量CT分析   新型冠状病毒感染   磨玻璃影   实变   氧合指数  

摘要： 目的探索新型冠状病毒(新冠病毒)感染患者胸部计算机断层扫描(CT)不同模式的定量分析结果及其与病毒载量和病理生理状态的关系。方法采用回顾性临床队列观察研究,选择2023年6月9日至15日在青岛市市立医院就诊的新冠病毒感染患者(所有患者均在确诊后24 h内接受胸部CT检查),根据CT表现将患者分为新冠病毒感染非肺炎组和新冠病毒感染相关性肺炎组。收集各组患者的相关基线数据,如人口学特征、胸部CT特征、CT检查前后12 h内的实验室指标等资料。采用Spearman相关性检验定量分析CT特征与实验室指标之间的相关性;绘制受试者工作特征曲线(ROC曲线)评估各实验室指标对新冠病毒感染患者发生肺炎的预测价值;采用多元线性回归分析探讨磨玻璃影(GGO)和实变等不同CT模式与通气氧合状态之间的关系。结果最终纳入171例新冠病毒感染患者,其中新冠病毒感染非肺炎组44例,新冠病毒感染相关性肺炎组127例(肺炎发病率为74.3%)。与单纯新冠病毒感染患者相比,新冠病毒感染相关性肺炎患者的淋巴细胞计数(LYM)、氧合指数(PaO_(2)/FiO_(2))、肺总量、GGO体积和GGO比例明显更低,C-反应蛋白(CRP)、中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)、D-二聚体、吸入氧浓度(FiO_(2))水平、实变体积和实变比例明显更高,差异均有统计学意义;两组间核衣壳蛋白(N)基因循环阈值(Ct)、开放阅读框(ORF)基因Ct值比较差异均无统计学意义。ROC曲线分析显示,经年龄、性别、CRP水平等相关因素校正后,与N基因Ct值、ORF基因Ct值、N基因Ct值+LYM、ORF基因Ct值+LYM相比,LYM预测新冠病毒感染相关性肺炎的效能最强,ROC曲线下面积(AUC)为0.703;当LYM截断值为0.7×10^(9)/L时,敏感度为55.5%,特异度为79.5%。多元线性回归分析显示,当根据实变比例、年龄、性别、Hb和D-二聚体水平进行校正时,新冠病毒感染相关性肺炎患者的GGO比例与PaO_(2)/FiO_(2)相关(β=-2.18,P<0.001);当根据GGO比例、年龄、性别、Hb和D-二聚体水平进行校正时,新冠病毒感染相关性肺炎患者的实变比例与PaCO_(2)相关(β=0.36,P=0.004);当根据GGO比例进行校正时,新冠病毒感染相关性肺炎患者的实变比例也与NLR相关(β=0.79,P=0.006)。结论LYM可能是预测新冠病毒感染相关性肺炎的潜在标志物,这种相关性似乎是独立存在的,与病毒载量无关。此外,在影像特征分析中,GGO与低氧相关,而实变则与PaCO_(2)水平和炎症相关,实变占全肺比例增加可能不利于肺通气。

关键词： 新型冠状病毒感染   低龄儿童   家长   疫苗犹豫   3C模型   重庆市  

摘要： 目的减少低龄(3~11岁)儿童家长的疫苗犹豫。方法通过问卷星平台制作基于3C模型的新型冠状病毒疫苗(简称新冠疫苗)犹豫相关调查问卷,并于2023年7月16日至8月15日向重庆市低龄儿童家长发放。调查内容包括调查对象基本情况和疫苗犹豫情况及模型3个维度(信任度、自满度和便利度)得分情况。采用多因素二元Logistic回归模型分析家长发生疫苗犹豫的影响因素。结果共回收问卷401份,有效问卷387份,有效回收率96.51%。家长男女比例1∶1.33,平均年龄(34.56±3.70)岁,38.76%存在疫苗犹豫。家长学历[OR=7.778,95%CI(2.102,28.783)]、子女健康状况[OR=59.312,95%CI(23.026,152.778)]、职业为医护工作者[OR=8.018,95%CI(2.636,24.382)]及模型中信任度得分[OR=0.848,95%CI(0.750,0.959)]、自满度得分[OR=1.192,95%CI(1.022,1.391)]对家长新冠疫苗犹豫的影响有统计学意义(P<0.05)。结论3C模型中信任度、自满度得分对该市低龄儿童家长新冠疫苗犹豫有明显影响,未来可通过增强疫苗犹豫家长对疫苗相关的信任度及高度重视疫苗接种的作用,提高疫苗接种率。