关键词： 坛紫菜   生物活性肽   新冠主蛋白酶   计算机模拟   分子对接  

摘要： 新型冠状病毒感染（COVID-19）在我国的疫情流行和病亡数得到控制，但该病毒仍具有感染性和传播性，抑制新冠病毒主蛋白酶（SARS-Co V-2 Mpro）的活性能够降低感染病毒的概率。该研究从坛紫菜蛋白质中筛选出对SARS-Co V-2 Mpro具有抑制作用的多肽。通过文献检索搜集到29种坛紫菜蛋白质，结合其预测的理化性质及潜在致敏性筛选出10种具有代表性的坛紫菜蛋白，对10种坛紫菜蛋白进行模拟胃肠道水解筛选出（2≤肽段长度≤5）肽段后，对坛紫菜源多肽的理化性质进行预测筛选，得到21条亲水、无毒且无潜在致敏性的肽段作为配体，以SARS-Co V-2 Mpro为受体，采用分子对接技术筛选与靶蛋白有较好亲和作用的生物活性肽，通过2D和3D可视化分析生物活性肽与靶蛋白的结合模式及相互作用。结果发现，部分活性肽可进入靶蛋白的活性中心，且通过氢键作用、π键作用以及烷基作用与SARS-Co V-2 Mpro结合。其中，结合分数最高的多肽是DGSF(145.441)，其次是DQF(143.819)和DGPW(141.446)，表明多肽对SARS-Co V-2 Mpro具有潜在抑制作用。综上所述，坛紫菜蛋白质具备作为后疫情时代营养补充剂的潜力。

关键词： 心血管病学   新型冠状病毒   综述   心律失常   心房颤动  

摘要： 心房颤动(简称房颤)是临床最常见的心律失常疾病,新型冠状病毒(简称新冠病毒)感染可以引起房颤的发生/发作.既往房颤病史或新发房颤对新冠病毒感染的预后有着不良影响.新冠病毒感染诱发房颤的机制可能与血管紧张素转化酶G2受体、心肌损伤、炎症风暴、以及药物使用等有关.此外,新冠病毒感染可引起凝血功能紊乱.新冠病毒感染合并房颤的患者应酌情调整抗凝药物和抗心律失常药物的选择.

关键词： 新型冠状病毒   亚基因组   感染性标志物   实时荧光定量PCR  

摘要： 新型冠状病毒（Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2，简称“新冠病毒”）导致的新型冠状病毒感染（Coronavirus disease 2019,COVID-19，简称“新冠感染”）引发全球大流行，对世界人民生命安全和正常生活造成巨大影响。疫情期间，区分患者体内病毒传染性是有效控制疾病再次蔓延、节约医疗资源的关键。目前，国内主要采用荧光定量PCR对新冠病毒核酸基因组RNA(GenomicRNA,gRNA)进行检测，该检测方法尚不能区分病毒是否具有感染能力。病毒培养方法是检测新冠病毒传染性的金标准，但该方法对样本要求高，操作繁琐培养时间长，易污染，且需要在生物安全三级实验室（P3实验室）进行，不利于基层实验室大范围应用和推广。多项研究表明新冠病毒在复制过程中产生的亚基因组RNA(Subgenomic RNA, sgRNA)可作为新冠病毒传染性的良好标志物，并通过不同检测方法开展研究。与病毒培养相比，亚基因组检测方法因所需时间缩短、操作简单等，近年来备受国内外关注，在国内外各项研究中均显示出巨大潜力。本文梳理当前新冠病毒亚基因组及其检测方法的研究进展，以期为新冠病毒亚基因组检测的研究提供借鉴。

关键词： SARS-CoV-2   Inhaled Ad5-nCoV vaccine   Vaccine effectiveness   Serological IgG antibody  

摘要： BackgroundAfter the exit "zero-COVID" strategy in mainland China by the end of 2022, a large-scale COVID-19 outbreak seeded by Omicron variants occurred. An inhaled adenovirus type-5 vector-based (i.e., inhaled Ad5-nCoV) COVID-19 vaccine was licensed earlier in 2021. In this study, we aimed to assess the real-world effectiveness of a heterologous booster of inhaled Ad5-nCoV vaccine against Omicron infection and compared with the protection from hybrid immunity (i.e., prior breakthrough infection).MethodsIn this retrospective cohort study, we identified 1087 out of a total of 1146 hospital staff from a tertiary hospital in Urumqi city, China from November 22 to December 29, 2022. Demographic characteristics, baseline health status, occupation, behavioral factors, laboratory test of serological IgG antibody, and timeline from immunization to laboratory-testing outcome were obtained. We analysed the individual-level vaccination status of inhaled Ad5-nCoV vaccine, prior SARS-CoV-2 infection status and baseline vaccination status, and other risk factors before follow-up. The protective effects of the heterologous inhaled Ad5-nCoV vaccine and hybrid immunity against Omicron BA.5 infection and hospitalization were calculated as relative rate reduction (RRR), which was estimated using multivariate Poisson regression *** total of 1087 hospital staff (median age of 34 years, and 343 males [31.6%]), including 931 accepted for serological antibody tests, were recruited to assess the vaccine effectiveness (VE) of the inhaled Ad5-nCoV booster and hybrid immunity. Among the 1087 participants, 413 had a history of prior SARS-CoV-2 infection (before follow-up) but did not receive an inhaled Ad5-nCoV booster, and 674 reported no prior infection, including 390 who received an inhaled Ad5-nCoV booster. The highest serological IgG antibody level was detected among the inhaled Ad5-nCoV group, with a median of 294.59 S/CO, followed by the hybrid immunity group, with a median o

关键词： 新型冠状病毒   奥密克戎   全基因组测序   不同区域  

摘要： 为了解安徽省新型冠状病毒（SARS-CoV-2）奥密克戎变异株流行趋势和进化规律，本研究选取了2023年3月至9月安徽省皖北、皖中和皖南地区共计365份本土新冠病毒感染确诊病例，利用高通量测序技术开展SARS-CoV-2全基因组测序。将获得的高质量序列通过Pangolin和Nextclade网站对SARS-CoV-2分型和突变位点进行统计分析。监测期间安徽省不同区域奥密克戎变异株构成存在时间差异：在监测前期到中期，皖北地区优势株由XBB.1.16及其亚分支发展为XBB.1.22及其亚分支；皖中地区由BA.5.2及其亚分支发展为FE.1及其亚分支；而皖南地区由XBB.1.22及其亚分支发展为FE.1及其亚分支，在监测后期不同区域优势株均以EG.5及其亚分支占主导。受到地理文化气候等多因素影响，不同区域的变异株构成也存在空间差异，合肥市和亳州市的奥密克戎变异株亚型相对更多。安徽省不同区域奥密克戎变异株基因组平均核苷酸突变位点数随时间逐渐增加，主要伴随着S蛋白的突变。本研究结合安徽省区域特征分析了奥密克戎变异株的流行特征，为新冠病毒感染防控措施的制定提供重要理论支持。

关键词： 急性呼吸道感染   病原体   新型冠状病毒   北京   流行特征  

摘要： 目的 分析北京地区秋冬季急性呼吸道感染的流行特征，为急性呼吸道感染疾病的防控和诊治提供依据。方法 采用便利抽样法，以北京协和医院2023年9月—2024年2月因急性呼吸道感染就诊的患者为研究对象。采集患者鼻咽拭子标本，采用荧光定量PCR法检测6种常见呼吸道病原体[包括甲型流感病毒（influenza A virus，FluA）、乙型流感病毒（influenza B virus，FluB）、鼻病毒（human rhinovirus，HRV）、肺炎支原体（mycoplasma pneumoniae，MP）、呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus，RSV）和腺病毒（adenovirus，ADV）]和新型冠状病毒感染情况，对病原体感染分布特征进行分析。结果 共入选符合纳入标准的患者5556例，6种常见呼吸道病原体总体阳性率为63.7%，单一病原体阳性率为54.0%，2种病原体阳性率为8.9%，3种及以上病原体阳性率为0.7%。整体检出病原体以FluA和RSV为主，阳性率依次为16.1%和15.7%；ADV、MP、HRV和FluB阳性率接近，分别为11.1%、11.1%、10.0%和10.0%。病原体总体阳性率在性别间无显著性差异，但在秋冬季节间(χ2=34.617， P<0.001)以及儿童、中青年和老年患者间(χ2=422.38， P<0.001)存在统计学差异。其中，MP(χ2=8.647， P=0.003)、FluA(χ2=131.932， P<0.001)和HRV(χ2=174.199， P<0.001)在秋季的阳性率显著高于冬季，而FluB在冬季的阳性率显著高于秋季(χ2=287.894， P<0.001)；儿童组MP、RSV、HRV和 ADV的阳性率均显著高于中青年和老年患者（P均<0.001），而FluB在中青年患者中的阳性率则显著高于儿童和老年患者（P均<0.001）。6种常见呼吸道病原体在新型冠状病毒感染流行时期阳性率明显下降，表现为非同步季节性模式。结论 北京地区呼吸道病原体流行情况与年龄、季节有关，需在不同季节、针对不同重点人群开展有针对性的预防措施。

关键词： coalitions   COVID-19   institutional knowledge   pandemic   policy learning  

摘要： As the COVID-19 pandemic began to unfold in the late winter and early spring of 2020, US states began to work collaboratively in regional coalitions to manage a rapidly developing public health crisis. These coalitions were made up of states that were geographically contiguous and, more importantly, built upon previous working relationships. We explore two regional coalitions-the Multistate Council and the Western States Pact in the northeast and western United States, respectively. We find that these regional coalitions each drew from institutional memory-previous collaborative policies-to craft their collective COVID-19 responses and that this approach produced two different outcomes. While these regional coalitions urgently provided critical resources (including institutional knowledge) to respond to the spreading pandemic, it may have also reflected a limit of institutional memory-path dependency which limited the regional coalitions' abilities to learn from each other and experience the benefits of other coalition approaches.

关键词： 冠状病毒感染   即时检测   分析性能评价   新型冠状病毒   呼吸道病原体  

摘要： 目的评价Flash10即时检测(POCT)系统在新型冠状病毒(SARS‑CoV‑2)核酸检测中的分析性能。方法采用无生物传染危险性的噬菌体病毒样颗粒(VLPs)样本和灭活的病毒培养液样本,对Flash10全自动核酸检测系统及其配套的SARS‑CoV‑2核酸检测试剂盒进行分析性能评价。通过检测梯度稀释的非变异株、Omicron(BA.5和BF.7)变异株VLPs以及阴性样本,使用Probit回归分析评价该POCT系统的最低检测限(LoD);通过检测3000.00、1000.00、333.33、111.11拷贝/ml浓度的非变异株和Omicron(BA.5和BF.7)变异株VLPs样本,计算各浓度样本ORF1ab基因和N基因循环阈值(Ct)的变异系数(CV),评价该系统的精密度;通过检测可能引起与SARS‑CoV‑2感染症状相似的13种常见呼吸道病原体,评价该系统的分析特异性;通过检测Alpha、Beta、Delta、Omicron等既往全球范围内流行过的变异株VLPs样本,评价该检测系统对SARS‑CoV‑2变异株的检测能力;并通过交叉污染和核酸扩增产物污染风险研究,评价该检测系统的密闭性。结果该POCT系统检测SARS‑CoV‑2非变异株和Omicron(BA.5、BF.7)变异株样本的LoD分别为92.97拷贝/ml(95%CI:63.68~196.27拷贝/ml)、95.49拷贝/ml(95%CI:67.26~200.14拷贝/ml)和99.27拷贝/ml(95%CI:67.77~209.89拷贝/ml),和试剂说明书中宣称的LoD(100拷贝/ml)一致;检测4个浓度水平的SARS‑CoV‑2非变异株和Omicron(BA.5、BF.7)变异株样本时,ORF1ab基因和N基因Ct值的CV分别为2.41%~4.97%和2.29%~4.48%,均<5%;对SARS‑CoV‑2以外的其他13种常见呼吸道病原体进行检测,结果均为阴性;对既往全球范围内流行过的变异株均可正确检出;交叉污染和核酸扩增产物污染风险的评价结果均为阴性。结论Flash10 POCT系统在SARS‑CoV‑2核酸检测中的分析性能良好。

关键词： 新型冠状病毒感染后综合征   咳嗽   诊疗   云南专家共识  

摘要： 新型冠状病毒奥密克戎变异株已在云南大部分地区爆发流行,新型冠状病毒感染后综合征(长新冠)患者也日益增多。“长新冠”患者,其最常见的症状为迁延不愈的持续性咳嗽。参考国内外文献成果及新型冠状病毒诊疗专家共识(第十版),结合云南省防治新型冠状病毒感染的临床诊疗经验,经云南省呼吸、感染领域专家的多轮会议研讨,制定本专家共识。通过阐述新型冠状病毒感染后综合征咳嗽症状的发病机制、诊治要点、药物选择,对呼吸学科及相关学科医师开展“长新冠”咳嗽诊疗工作提供参考依据,也为云南省“长新冠”咳嗽患者提供合理、规范、科学的诊疗方案。