摘要： Amidst the looming threat of the COVID-19 pandemic, the global scientific community has fervently pursued understanding SARS-CoV-2 and its pathophysiology to uncover potential therapeutic avenues. In this investigational study, in-silico methods were employed to screen potential therapeutic interventions against SARS-CoV-2. The study involves screening the interaction of the 2019-nCoV spike protein with Phytoderivatives Liquiritin and Ellagic acid, along with the known inhibitor V607, using the AutoDock Vina suite. The binding energies obtained from the docking are -13.4 kcal/mol for Liquiritin, -9.1 kcal/mol for Ellagic acid, and -8.1 kcal/mol for VE607. The results suggest a higher affinity of the Phytoderivatives, particularly Ellagic acid and Liquiritin, and VE607 against the spike protein. Both Phytoderivatives (Liquiritin and Ellagic acid) bind to the HR-1 (fusion peptide) domain of the spike protein. Other parametric results indicate good absorption activity for the studied molecules. The studied molecules do not violate the Lipinski score of drug-likeness. The study suggests that Liquiritin and Ellagic acid, along with VE607, may have pharmacological and therapeutic potential in inhibiting or blocking the fusion mechanism of the virus particle during entry into host cells. The inhibition of the fusion mechanism may contribute to preventing or treating ***'s important to note that in-silico studies provide valuable insights, but experimental validation is crucial to confirm the effectiveness of potential drug candidates.

关键词： Vaccine   Vaccine development   COVID-19   Rapid development   Platform technology   ChAdOx1   Vector vaccine   mRNA   Process development map  

摘要： In 2015 the UK Vaccine Network through its Working Group 3 began the creation of a website describing the conventional development of human and veterinary vaccines, which routinely takes several years to complete from concept through to licensure, in the form of process development maps. This website has proved to be a valuable resource for those involved in commercial vaccine development and it has also highlighted the potential bottlenecks within the processes. However, during the COVID-19 pandemic, vaccines were created, licenced and administered within 1 year of the SARS-CoV-2 virus sequence being made available to researchers globally, through the use of novel platform technologies, such as viral vectors and mRNA. The paper describes the updating of this vaccine process development website and the inclusion of a rapid development map with 14 Stages based knowledge gained during the development of the University of Oxford/Astra Zeneca ChAdOx-1 vectored COVID-19 vaccine. The map captures the key steps required to expedite human vaccine development in the face of a pandemic threat from pre-clinical discovery, vaccine platform development, regulatory review and approval through to the administration of the first dose in humans.

关键词： 机器学习   新型冠状病毒感染   森林图   人工智能   极端梯度提升(XGBoost)   预后   预测模型  

摘要： 目的探讨影响新型冠状病毒感染(novel coronavirus pneumonia;别名corona virus disease 2019,COVID-19)重症病人预后的危险因素,建立预测模型并进行验证,进而准确地评估COVID-19重症病人的不良预后。方法收集2022年11月1日至2023年7月1日沧州市中心医院收治的526例COVID-19重症病人的临床指标与结局(院内28 d内死亡或存活)。用于R软件“caret”包,将526例病人按7∶3的比例拆分为两组:训练集(n=369)用于模型训练,测试集(n=157)用于模型验证。利用极端梯度提升(XGBoost)、随机森林(RF)2种机器学习算法构建病人临床结局的预测模型,应用SHAP进行XGBoost模型可解释性分析,分别得出影响病人预后的变量。将RF和XGBoost得出的变量取交集得到差异有统计学意义的变量,进而构建决策树模型。最后,在训练集和测试集上利用受试者操作特征曲线(ROC曲线)、曲线下面积(AUC)评估所决策树模型的预测性能。结果通过XGBoost模型得到与院内死亡相关的变量15个,随机森林模型得到与院内死亡相关的变量23个,两种模型取交集得到13个与院内死亡相关性最强的重要变量(白细胞介素-6、N端脑钠肽前体、白蛋白、超敏肌钙蛋白I、淋巴细胞、血乳酸、α-羟丁氨酸、肌酸激酶同工酶、动脉血氧分压、年龄、尿素氮、血红蛋白、乳酸脱氢酶)。用这13个重要变量构建决策树模型,得出2个与病人死亡最相关的变量(白细胞介素-6、淋巴细胞),死亡组病人的白细胞介素-6为155.48(42.81,691.3)ng/L,显著高于存活组15.38(10.51,31.11)ng/L(Z=37387.50,P<0.001)。死亡组病人的淋巴细胞为5.4(3.3,12.6)%,显著低于存活组13.5(8.62,22.28)%(Z=10584.50,P<0.001)。在训练集上的决策树模型预测COVID-19重症病人死亡的AUC为0.86,在测试集上的AUC为0.84。结论基于XGBoost和随机森林这2种机器学习方法构建的决策树模型能够更准确地评估COVID-19重症病人的不良预后。

关键词： 新型冠状病毒   动物   病原变异   防控  

摘要： 新型冠状病毒(SARS-CoV-2)是导致当前COVID-19大流行的病原体。根据世界动物卫生组织(WOAH)的数据,截至2023年6月全球已报告775起动物感染新型冠状病毒疫情,涉及36个国家的水貂、猫、狮子等29个物种,对全球公共卫生和社会经济造成严重的影响。新型冠状病毒感染动物后,其基因组会发生变异甚至出现再传染给人类的可能。本文对动物感染新型冠状病毒的病原学、易感动物及主要症状、遗传变异机制、动物模型、诊断、疫苗和综合防控措施进行综述和展望,以期为动物感染新型冠状病毒的防控提供参考。

关键词： 避瘟解毒颗粒   新型冠状病毒感染   网络药理学   免疫调节  

摘要： 目的通过网络药理学和动物实验探讨避瘟解毒颗粒(Biwen Jiedu Granules,BWJD)防治新型冠状病毒感染的机制。方法通过TCMSP和BATMAN-TCM数据库检索组方药材的化学成分及作用靶点。用GeneCards数据库查找新型冠状病毒感染相关靶点,将二者交集靶点导入STRING数据库中构建靶点相互作用网络图,筛选核心靶点,通过DVIAD数据库对靶点进行GO功能分析和KEGG信号通络富集分析。构建环磷酰胺诱导的小鼠免疫低下模型,检测小鼠的脾脏和胸腺指数、血常规、血清及组织中免疫因子水平。结果获得BWJD药物靶点259个,疾病靶点2284个,交集靶点98个,通过蛋白相互作用(proteinprotein interaction,PPI)网络分析获得肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)等核心靶点。基因GO功能、KEGG通路富集分析结果表明,药物增强免疫功能主要是通过TNF、白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)等信号通路发挥协同调节作用。动物实验进一步证实BWJD能显著改善免疫低下小鼠的脾脏、胸腺指数和血常规,显著提高血清中免疫球蛋白G(immunoglobulin G,IgG)、免疫球蛋白M(immunoglobulin M,IgM)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、IL-1β水平和脾、胸腺中TNF-α、IL-1β的含量,提高脾和胸腺中超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)的活性。结论避瘟解毒颗粒可能通过免疫调节发挥防治新型冠状病毒感染的作用。

关键词： 亚临床心房颤动   新型冠状病毒感染   双腔起搏器  

摘要： 目的探讨新型冠状病毒感染(COVID-19)对双腔起搏器植入患者新发亚临床心房颤动的影响。方法回顾性分析2016年1月至2023年6月在首都医科大学附属北京安贞医院首次植入永久双腔起搏器的420例患者的临床资料。将患者根据是否合并COVID-19分为感染组和未感染组。比较2组随访资料和亚临床心房颤动发生情况。采用多因素Logistic回归模型分析影响亚临床心房颤动发生的独立危险因素。结果420例患者中共395例完成24.0(6.0,54.0)个月的随访,其中感染组323例,未感染组72例。随访过程中有3例患者死亡,其中1例肾衰竭、另外2例原因不详,死亡患者均合并COVID-19。感染组亚临床心房颤动发生率明显高于未感染组[16.7%(54/323)比6.9%(5/72)](P=0.035)。多因素Logistic回归分析结果显示,合并COVID-19、大于2 s长RR间期、左心房内径增大是患者发生亚临床心房颤动的独立危险因素(均P<0.05)。结论合并COVID-19、大于2 s长RR间期、左心房内径增大均是植入永久双腔起搏器患者发生亚临床心房颤动的独立危险因素。

关键词： 呼吸道病毒   实体器官移植   造血干细胞移植   抗病毒治疗   流感病毒   新型冠状病毒   巨细胞病毒   呼吸道合胞病毒  

摘要： 病毒感染始终是人类健康面临的重要挑战。实体器官移植和异基因造血干细胞移植受者因接受免疫抑制治疗,免疫功能较弱,属于病毒感染的高危人群。与普通人群感染不同,移植受者呼吸道病毒感染后容易出现肺炎甚至重症肺炎,需要临床医师高度关注。因此,本文针对该类人群病毒感染的临床特点及特殊性管理,就移植受者常见呼吸道病毒感染的流行特点、感染后早期诊断及干预、重症预警、药物治疗策略等方面进行综述,供临床同行借鉴及参考。

关键词： 新型冠状病毒   气管狭窄   呼吸困难  

摘要： 新型冠状病毒感染(coronavirus disease 2019,COVID-19)主要表现为咽干、咽痛、咳嗽、发热等症状[1],部分患者出现呼吸困难,其主要原因是肺部感染、原有呼吸道疾病加重、继发肺间质病变及肺栓塞等所致,大部分患者可通过胸部CT及临床特征鉴别。本文报道新型冠状病毒感染后出现呼吸困难的1例病例,结合病史、胸部CT、气管镜检查,诊断为COVID-19后气管狭窄,经过糖皮质激素治疗后好转。本文结合相关文献回顾分析其发病机制及治疗方案,以引起临床对该病的关注,并为临床提供治疗参考。

关键词： 新型冠状病毒   Omicron变异株   肾移植  

摘要： 自2019年12月新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情爆发以来,不断发生变异的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)给实体器官移植领域带来了前所未有的挑战。而肾移植受者(KTRs)由于常年服用免疫抑制剂及合并多种合并症,是SARS-CoV-2感染后进展为重症的高危人群。本文旨在结合当前新的流行病学背景,对肾移植工作的最新诊疗进展进行综述,为后续新的流行病学背景下KTRs的管理提供参考。

关键词： 无偿献血者   新型冠状病毒   IgG抗体  

摘要： 目的:了解遵义市无偿献血人群中高效价2019-nCoV IgG抗体的血清学流行情况。方法:标本血浆按1∶160或1∶320稀释后用酶联免疫吸附实验间接法检测2019-nCoV IgG抗体,分析抗体反应性率在不同性别、年龄、血型中的差别。结果:5378份标本血浆按1∶160稀释后,筛查出1523份反应性标本;2988份标本血浆按1∶320稀释后,筛查出329份反应性标本。总的抗体反应性率为22.1%。进一步分析发现,女性、40岁以上、AB血型的人群中,高效价抗体反应性率相对较高。结论:新冠感染防控进入新阶段后,遵义市无偿献血人群中有较高的高效价2019-nCoV IgG抗体血清检出率。抗体反应性率在不同性别、年龄、血型间存在一定的差异。