关键词:
地中海贫血
基因型
基因多态性
临床表型
血红蛋白F
摘要:
目的:
1.分析地中海贫血(地贫)不同基因型与血液学表型的关系,为地贫的遗传咨询及防治提供更为精准的依据。2.探讨轻型β-地贫胎儿血红蛋白(Hb F)调控相关基因单核苷酸多态位性位点(SNP)与Hb F表达量的相关性。
方法:
第一部分:收集2020年10月-2021年12月贵州省人民医院确诊地贫患者或携带者1174例,采用PCR+导流杂交方法检测中国常见地贫的基因型。并搜集血红细胞(RBC)、血红蛋白(Hb)、RBC平均容积(MCV)、RBC平均Hb量(MCH)、RBC平均Hb浓度(MCHC)、RBC分布宽度(RDW)、成人Hb(Hb A)、成人Hb2(Hb A2)、Hb F等指标,分析不同地贫基因型与上述指标之间的关系。
第二部分:收集306例轻型β-地贫患者血标本,通过文献查阅Hb F表达调控修饰基因,设计修饰基因测序基因包(panel),通过二代测序技术(Next-generation sequencing,NGS)检测306例血标本上述基因panel中所有SNP位点,分析基因SNP位点与Hb F表达的相关性。
结果:
第一部分:(1)1174例地贫患者中,α-地贫617例,β-地贫512例,α-地贫复合β-地贫45例。
(2)静止型α-地贫(非缺失型2;αWSα)Hb量最高128.8±15.6 g/L。轻型α-地贫(缺失型)Hb 121.5±18.1g/L高于轻型α-地贫(非缺失型)Hb 102.5±19.8g/L,P<0.01;中间型α-地贫(缺失型)Hb 91.5±16.4g/L高于中间型α-地贫(非缺失型)Hb 78.8±11.9g/L,P<0.05。轻型α-地贫Hb量121.1±18.1g/L高于轻型β-地贫Hb量109.9±19.8g/L,P<0.01。
(3)α-地贫、β-地贫与α-复合β-地贫基因型与Hb的关系:静止型α-地贫复合轻型β-地贫Hb 120.8±18.3g/L,介于静止型α-地贫Hb量125.6±19.2g/L与轻型β地贫Hb 108.7±19.9g/L之间。轻型α-地贫复合轻型β-地贫Hb 114.5±18.6g/L,介于轻型α-地贫Hb量121.1±18.4g/L、轻型β-地贫Hb 108.7±19.9g/L之间。中间型α-复合轻型β-地贫100.0±20.7g/L,介于中间型α-地贫Hb 87.49±16.22g/L、轻型β地贫Hb 108.7±19.9g/L之间。
第二部分:(1)306个β-地贫患者中,共成功完成300例样本的建库、杂交捕获和上机测序。
(2)通过定性分析Hb F<1%和≥1%分为2组筛选与Hb F表达调控相关且符合Hardy-Weinberg平衡的位点,共筛选出30个基因123个SNP位点,基因包括chr2-(BCL11A、LRP1B)、chr6-(HBS1L、MYB)、chr11-(CHRNA10、HBBP1、HBE1、HBG1、HBG2、HBB、HBD、KCNQ1、MUC2、NUP98、OR51B4、OR52A1、RP13-726E6.2)、chr13-USPL1、chr15-PEX11A、chr16-(HBA1、HBA2、HBM、HBQ1、HBZ、LTFG3、LUC7L、MPG、POLR3K、WASH4P)、chr19-KLF1。
(3)进一步通过定量分析,共有23个基因的37个SNP位点与Hb F表达量无相关,共有13个基因86个SNP位点与Hb F表达量相关,差异有统计学意义,P<0.05
(4)其中,引起Hb F表达降低的有7个基因的54个SNP位点;引起Hb F表达升高的有9个基因的32个位点。与Hb F表达有相关性但未见报道的SNP位点有如下7个基因的18个位点:chr6-MYB(rs148441166C-T、rs34931156TA-T),chr11-HBD(rs10665762 G-GAC、rs4426158 T-C、rs4910544 T-A、rs4910735G-A、rs7482694G-A)、chr11-HBE1(rs10837767 T-G、rs5789387AT-A、rs61891977G-A、rs117502536C-T、rs12295181C-T、rs72872555G-A)、chr11-HBG1(rs7480197C-T)、chr11-HBG2(rs7481986、rs1894397C-T、rs34501951AT-T)、chr16-ITFG3(rs75369951C-T)、chr19-KLF1(rs117351327G-A)。
结论:
***-Westmead是一个沉默的非缺失型的α+突变,α-地贫(非缺失型)贫血程度大于α-地贫(缺失型),RBC异型性更大。同种临床分型的β-地贫较α-地贫的临