关键词:
地中海贫血
第三代基因测序
常见基因类型
罕见基因类型
德阳地区
摘要:
目的:通过描述性分析第三代基因测序技术与常规技术(聚合酶链反应和反向斑点杂交技术)对地中海贫血基因检测的结果,了解四川德阳地区地中海贫血的基因检出及分布情况,了解罕见基因型血液学表型,丰富本地区地中海贫血基因突变谱,为临床遗传咨询提供参考依据,及时行产前诊断,提高地中海贫血的防控效率,减少中重度地中海贫血患儿的出生,减轻社会和家庭负担。
方法:选取2023年1月-2024年2月自愿接受第三代基因测序技术进行地贫基因检测人群的全血样本954例及2023年1月-12月自愿接受常规技术(聚合酶链反应和反向斑点杂交技术)进行地贫基因检测人群的全血样本1627例进行分析,对夫妻双方携带同型地贫者于孕16-24周行产前诊断,若双方携带基因均为常见类型,则行常规地贫检测,若一方或双方携带罕见地贫基因则行第三代基因测序检测。
结果:1.1627例常规地中海贫血检测受检者中,共检测出阳性样本308例。检出α-地贫174例,β-地贫128例,α复合β地贫6例。α-地贫中以--SEA/αα(60.92%)、-α3.7/αα(28.16%)为主。β地贫主要以βCD41-42(-TCTT)/βN(36.72%)、βCD17(A→T)/βN(27.34%)、βIVS-Ⅱ-654(C→T)/βN(20.32%)为主。在常规技术检测范围内,检出17种变异类型,在HBA1/2基因区共检出6种变异类型,在HBB基因区共检出11种变异类型。
2.954例第三代基因测序检测样本,共检测出阳性300例。检出α-地贫共181例,β-地贫106例;α-地贫复合β-地贫13例。α地贫中以--SEA/αα(53.59%)、-α3.7/αα(18.32%)为主,同源重组型结构变异检出13例,突变型α地贫6例,β地贫以βCD41-42(-TCTT)/βN(29.25%)、βCD17(A→T)/βN(30.19%)、βIVS-Ⅱ-654(C→T)/βN(21.70%)为主。本次检测检出常见地贫等位基因共286个,罕见地贫等位基因41个。本次检测共检出31种变异类型,在HBA1/2基因区检出19种变异类型,HBB基因区检出12种变异类型,其中18种为罕见基因变异类型,这些罕见基因变异类型中,包含1个既往未报道过的新的基因突变类型。
3.15例地贫产前诊断高风险胎儿,检出2例重型地贫(--SEA/--SEA、βCD41-42/βCD27-28),4例静止型地贫,5例轻型地贫。
4.19例携带罕见地贫基因受检者,其中12例Hb未见异常,6例血常规(Hb、MCV、MCV)筛查均未见异常。
结论:1.第三代基因测序技术能够检测多种罕见基因变异类型,丰富了地贫的突变谱,为临床遗传咨询提供参考依据,有效防控中重型地贫患儿的出生。
2.第三代基因测序技术检测结果中罕见基因类型在人群中占据一定比例,且α地贫占比及复合型地贫更多,在地贫防控中要更加注重α地贫突变型以及α地贫复合β地贫的筛查。
3.部分受检者血常规未见明显异常,仅进行血常规筛查明确是否需要进一步地贫筛查容易导致漏诊。